這幾年菌肥市場可謂火爆，不僅是菜農在蔬菜栽培中投入菌肥的數量越來越多，並且市場上形形色色的菌肥產品也不計其數。很多菜農都反映菌肥效果不錯，但是當記者與他們交流關於菌肥的選用時，很多菜農都道不出一二三來。對於菌肥，記者認為每個菜農心中都應該有把“尺子”，這樣在選用菌肥產品時才能正確合理。
正確認識菌肥
生物菌肥，顧名思義，是由微生物的活動來體現其功效的一類肥料，其微生物多為酵母菌、放線菌、芽孢桿菌、木黴菌、鉀細菌、磷細菌等，此類菌群都屬土壤有益微生物，施入土壤後，能在作物的根際周圍生長繁殖，形成一個龐大的有益菌群。
生物菌肥最大的特點是以“菌”為本，以菌抑菌。導致死棵的根部病害多為腐皮鐮孢根腐病、疫黴根腐病、莖基腐病、黃（枯）萎病等，他們的共同特點是都是由土壤傳播的病害。腐皮鐮孢黴、疫黴菌等病原菌長期存在於土壤中，使得死棵年年治年年有，並且愈演愈烈。
使用生物菌肥後其中的有益菌能夠迅速發展壯大並形成有益菌群，從而抑制有害菌的發展，起到以菌抑菌的功效。如果在定植穴內增施生物菌肥，菌肥中的有益微生物就在蔬菜根部大量增殖，菌群形成局部優勢，抑制和減少病原菌的入侵和繁殖機會，起到了減輕病害的功效。
生物菌肥中的有益菌在抑制雜菌的同時不斷分解土壤中的腐殖質、有機物等，使土壤變得肥沃，還能分解土壤中已被固定的磷、鉀、鈣、鎂等元素，重新供應作物利用，同時緩解了土壤鹽漬化，這就起到了改土沃土，提升土壤肥力的作用。另外，生物菌所分泌的物質可能刺激生長激素的合成和傳導，是作物正常生長所不可缺少的。
正確選擇生物菌肥
時下菌肥品牌種類繁多，質量良莠不齊。筆者認為，要想選擇一種好的菌肥產品，可以從以下幾個方面考慮：
第一，查看保質期。選購生物菌肥時，要注意其是否過了產品保質期，一般超過生產日期1年的生物菌肥活性會顯著降低。
第二，要看有無農業部登記證。正規的廠家生產的產品都有農業部登記的證明。還要看清楚這款產品的商標是否標準，同時要打一打包裝上的服務電話，看看能不能打通等等。
第三，要看包裝袋上標明的活菌數量是否符合國家規定。國家規定生物菌劑有效活菌數≥2億/克，顆粒狀的≥1億/克，複合微生物肥料和生物有機肥有效活菌數≥2000萬/克，這僅僅是國家規定的最低標準，若低於這個標準則證明產品不合格。而多數的菌肥產品在包裝上標註的有效活菌數往往大於5億/克甚至更多，在宣傳的時候也是往高處說，然而很多的劣質產品卻根本達不到這個含量。所以，菜農要選擇有實際效果，而不是有宣傳效果的生物菌肥。
第四，看大棚中的磷鉀含量是否超標。如果大棚土壤中的磷鉀含量大大超標，就應少用或不用磷鉀肥料，改用含有解磷解鉀的生物菌肥，從而將土壤中固定的磷鉀釋放出來，促進蔬菜的吸收利用，降低土壤磷鉀的含量，減輕土壤的鹽漬化。如果土壤中的磷鉀含量較低，則應在配合衝施磷鉀肥料的同時，使用含有解磷解鉀的生物菌肥，減少土壤對肥料中的磷鉀的固定，以滿足蔬菜生長對營養的需求，促進蔬菜的生長。
正確使用生物菌肥
生物菌肥因其是生物活體肥料，其特殊的成分決定了它必須有特定的使用條件。土壤環境條件會影響菌肥使用效果，如溫度、光照、土壤水分、酸鹼度及使用方法等，所以在使用的時候就需要考慮到這些方面。
首先，要先調控好地溫。一般菌肥中的生物菌在土壤18—25℃時生命活動最為活躍，15℃以下時生命活動開始降低，10℃以下時活動能力已很微弱，甚至處於休眠狀態。因此，無論是夏季還是冬季，棚內氣溫應保持在15℃—30℃這個範圍內。
其次，施用前先調控好土壤的溼度。土壤在澆水過大，透氣性不良，含氧量較少的情況下也不利於生物菌的生存。一般情況下，澆水應選在晴天上午進行，因這段時間內澆水有利於地溫的恢復和棚內溼氣的排除。澆水時要注意澆小水，切忌大水漫灌。若在蔬菜苗期覆蓋地膜之前澆水，還應及時進行劃鋤，以增加土壤的透氣性，促進生物菌的生命活動。
再次，還要注意施足有機肥。在很多大棚區，棚內土壤有機質含量嚴重貧乏，個別地區有機質含量還不足10克/千克。而生物菌的功效是在土壤有機質豐富的前提下才能發揮出來的。如果土壤中的有機肥施用不足，生物菌就會因食物缺乏而使用效果不良；如果土壤中的有機質供應充足，生物菌肥中的益生菌就會大量的繁殖，從而增強對有害菌的抑制。因此，蔬菜定植前，一定要注意施足有機肥，一般每畝菜地以施純雞糞15-20方或稻殼糞35-40方為宜。
另外，使用方法要得當。菌肥可作基肥，畦施、溝施或穴施；也可作追肥，進行衝施。生物菌肥穴施效果較好，生物菌可以迅速在蔬菜的根系周圍形成強大的菌群，保護根系。
如果土壤中病原菌積累較多，如種了十幾年的老棚，建議採取先普施後穴施的方式以增加土壤中生物菌的數量，增強防病效果。作追肥衝施時，可單獨使用，也可與化學肥料混合使用，但化學肥料的用量不能過大，以防高濃度的化學物質對生物菌肥裡的微生物有毒害作用，尤其注意不能與碳酸氫銨等鹼性肥料和硝酸鈉等生理鹼性肥料混合。
當然，應用生物菌或生物菌肥時最好只使用一種，不宜將含有不同有益菌的多種生物菌肥同時使用，更不應經常更換使用不同種類的生物菌，這是因為當初次使用的菌肥發揮效果時，將另外一種菌肥施入，改變了菌群結構，一是後者為了繁殖要與前者爭奪營養；二是後者或與前者產生對抗關係，產生不良後果。
需要特別注意的是，應用生物菌肥後通常不能立即使用殺菌劑。兩者的使用時間間隔至少是10-15天以上。