紫蘇是傳統的藥食兩用植物，紫蘇葉、紫蘇梗、紫蘇子均可以入藥。紫蘇有較高的營養價值，具有低糖、高礦質元素、高胡蘿蔔素、高纖維等特性。紫蘇的嫩莖葉，既可以用來炒食、涼拌、煮粥或醃成鹹菜，還可以作紫蘇茶或配以青梅和砂糖製成紫蘇梅酒。紫蘇莖葉也常用作調味劑，作泡菜的香料或醃製臘肉、臘魚等。
治療風寒感冒
紫蘇葉性溫入血分，能解表散寒，開宣肺氣。《本草正義》雲“紫蘇……外開皮毛，洩肺氣而通腠理；上則通鼻塞，清頭目，為風寒外感靈藥”。紫蘇葉適用於風寒感冒，惡寒發熱，鼻塞頭痛，周身酸楚者，常配伍荊芥穗、防風、生薑等，如荊防達表湯；若兼有氣滯胸悶，可配伍陳皮、香附等，如杏蘇散；若兼見咳嗽，多配伍前胡、杏仁等，如杏蘇散。要注意的是，氣弱表虛者不宜使用紫蘇。
治療嘔吐、腹瀉
紫蘇梗解表之力雖不及紫蘇葉，但長於行氣寬中，和胃止嘔，常用於治療心腹氣滯，出現胸悶、腹部不適、噁心嘔吐等症，可配伍半夏、生薑、陳皮、大腹皮等藥。偏熱者可配伍黃連以增強清熱和胃之功效；偏寒者可配伍藿香以增強和中止嘔之功效。此外，紫蘇梗還有理氣安胎的功效，可用於妊娠嘔吐、胎動不安者。
以紫蘇葉莖為主藥，配伍陳皮，焦麥芽、焦山楂等藥，可用於治療某些腹瀉。這種腹瀉常因飲食不節，反覆發作。引起腹瀉的食物主要是某些魚、蟹、蝦等海產品。因魚蟹中毒者，可用單味帶梗紫蘇煎汁服用以解毒。獲效後，要注意忌口，因哪一種食物引起發病的，就忌哪一種食物。
治療哮喘、腸燥便祕
紫蘇子能降氣平喘，潤腸通便，遇到哮喘患者既見痰氣鬱逆上盛之勢，又存在飲食積滯、裡實便祕時，可用炒蘇子、杏仁以降氣潤腸，炒萊菔子、麩炒枳殼以行滯消積，服用後，可使大便通暢，痰喘得平。紫蘇配伍杏仁,既能利肺降氣,又宣散肺氣，正如《本草匯言》所言:“紫蘇散寒氣,清肺氣,寬中氣,下結氣,化痞氣,為治氣之神藥也。”腸燥便祕的患者，可用適量的炒蘇子，打成細粉，煮粥食用。需要注意的是，陰虛喘逆、氣虛久嗽、脾虛便滑者均不宜使用紫蘇子。
止血
紫蘇內服或外敷均有一定的止血功效，《本草綱目》中記載有用紫蘇止血的方法，如“金瘡出血不止，以嫩紫蘇葉、桑葉同搗貼之。”現代藥理研究表明，紫蘇能明顯地縮短出、凝血時間和凝血酶原時間。以二至丸加紫蘇桑葉，可用於月經量多或陰道出血如崩等出血病症，有一定的治療效果。
此外，因紫蘇富含氨基酸、微量元素和維生素等多種營養成分，紫蘇還可以作為飼料添加劑飼餵動物，不僅可以促進生長、補充營養、改善動物品質，而且低殘留、低毒，在畜禽養殖中有一定的應用前景。