在中國歷史上，第一部闡述醫學理論的書籍應該就是《黃帝內經》了。對於這部託名黃帝的古代醫書，其實真實作者已經很難考據了，其成書年代也說法不一，或說是在戰國，或者在秦漢之際，也許是在漢朝中期。然而無論如何，其思想的系統性和完備的程度，在浩如煙海的古代典籍中是極為罕見的。可是，如果我們有幸翻開這部古老的而又深沉的醫學著作，肯定會大吃一驚：在這部書裡，出現最多的不是病理，不是藥方，而是“陰陽”二字！以至於出讀者不得不懷疑;這到底是一部醫學著作還是一部解釋《周易》的書？
《黃帝內經》中一句話道出了中醫治病的最高原則：“黃帝曰：陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，生殺之本始，神明之府也，治病必求於本。”從這裡我們可以看出，《周易》從根本決定了《黃帝內經.》的“身體觀”和“疾病觀”，也決定了中醫在幾千年的歷史長河中的走向。唐朝的孫思邈說：“不知易者不知中醫。”古代的中醫藥家都很重視對《周易》的學習和研究，很多有名的醫家無一不對周易有深刻的認識。所以中醫學史上有一句名言，叫做“醫易同源”。意思是說，醫學和易學儘管形態各異，但卻是同根本院。正如明代醫學家張景嶽所說：“易者，易也，具有陰陽動靜之妙；醫者，意也，合陰陽消長之機。”一言概之，醫學與易學的核心問題都不過是“陰陽”問題。
陰陽相生相剋，卻又相輔相成，此消彼長，反映在人的身體上，則表現為“新陳”和“代謝”。所以中醫認為，陰陽平衡才能進行正常的生理活動，若遭受某些疾病的因素破壞了陰陽平衡，體內的任何一方偏盛或偏衰，都可發生疾病，即所謂的“陰陽失調”。所以我國醫學認為，疾病發生的基本環節就是“陰陽失調”，而治病的關鍵就是要“調和陰陽”，而非“頭痛治頭，腳痛治腳”。
《周易》作為中華文化的本源，其最大的一個特色就是：它的方法論和世界觀不像西方世界那樣是彼此分離的，而是糾纏在一起：方法論同時又是它的世界觀，世界觀同時又是方法論。《黃帝內經》從陰陽式的思維模式出發，成就了自身的“身體觀”，即把身體看作一個有機的結構系統，而非身體的各個部位之間簡單、機械的組合。也就是說，中國人眼裡看到的是“身體”，而非“肉體”。