90年代初，上海大眾並不滿足於桑塔納國產化的成功，開始嘗試走聯合開發的道路。1992年，上海大眾和德國大眾聯合開發桑塔納2000的工程正式啟動。所謂聯合研發，就是在巴西版的Quantum原型車基礎上，重新設計了底盤軸距，比普通桑塔納增長了108mm，同時還加大車身離地間隙和加大了後座的空間而得來。
桑塔納2000從開發到上市只花了三年時間，1995年成功下線。作為中國人蔘與開發的第一個車型，桑塔納2000最大的創意就是將車身自B柱以後拉長了10釐米，大大提高了後排乘員的乘坐舒適性，得到了用戶的好評。同時1995年，上海大眾累計生產桑塔納轎車50萬輛。
外觀尺寸上，當時桑塔納2000的長寬高分別達到了4680mm×1700mm×1423mm，軸距為2656mm，動力上依然採用的是1.8L四缸發動機，最大功率95馬力（70千瓦），最大扭矩155牛米，採用5速手動變速箱，空車質量為1210公斤，百公里平均油耗僅為6.2L。
配置方面，當時的桑塔納2000配備了真皮座椅、車內中控鎖、電動車窗等，在當時這些算是豪華配置，相比普通桑塔納有了很大的提升。在整個90年代，桑塔納2000作為一款高品質商務轎車，迅速佔領了國內中級公務及商務車市場。
事實證明，桑塔納2000在當時是一個不錯的選擇，很好地起到了承上啟下的作用。桑塔納2000既與桑塔納共用一個平臺，降低了生產成本，又不同於桑塔納低檔公務車的定位。1995年推出市場後久銷不衰，到2004年停產時，已保持了多年產銷近10萬輛的水平。
1995年桑塔納2000推出之後的8年中，上海大眾不斷推陳出新，先後推出了“時代超人”、“自由沸點”、“俊傑”、“時代驕子”、“時代陽光”等系列改進車型。
1998年3月25日，推出了裝備有AYJ電噴發動機的Santana 2000時代超人。整車排放達到歐Ⅱ標準。發動機配備了8氣門電控多點噴射系統，最大功率由桑塔納2000的95馬力提升到了101馬力，最大扭矩依然為155牛米。在安全方面，它配備了更多的安全裝備，包括ABS、液壓助力轉向等，提供了更周到細緻的安全保護。
2000年正值世紀之交，Santana 2000自由沸點於8月21日上市。在秉承了Santana 2000時代超人寬敞、舒適及動力強勁等特點的基礎上，對保險槓、防擦條、控制面板的開關、內飾面料等方面做了更新設計。整體的黑色內飾隱約透著一絲活躍的紅，整部車洋溢出朝陽般的動感和青春活力。
2000年11月1日，上海大眾在桑塔納2000時代超人的基礎上，歷時兩年進行了多項技術和裝備的改進，推出第一款裝備自動變速器的桑塔納2000 AT車型-“俊傑”。它也配備了AYJ型電噴汽油發動機，裝置了4速自動變速器，分別在中國和德國道路進行了各種性能匹配試驗和道路試驗，均達到了大眾汽車嚴格的質量標準。還增加了間歇式雨刮器、中央門鎖、4喇叭音響系統、紫外線隔熱玻璃等裝備。
同原有車型比較，在2002年6月5日推出的桑塔納2000時代驕子，在舒適性、安全性、產品外觀的時尚性以及產品的質量四個方面又有了進一步的突破。它應用了中高級汽車才裝備的發動機液壓支承。內飾面料則採用新的針織方法，手感質感更佳。空調旋轉面板由原來的撥杆式改為旋轉式操縱結構。車內改進的遮陽板、新造型的三輻條方向盤以及全新的換擋桿，造型時尚、富有現代感。
2003年5月8日又推出了桑塔納2000時代陽光，不僅裝配了天窗，還增加了不少新的配置，包括安全氣囊、車內防炫目後視鏡、後玻璃防霧裝置、防炫目外後視鏡、中央後座兩點式安全帶、頭枕高度可調等，當時這款車型是桑塔納2000一系列車型中配置最高的，售價為18.7萬元。
桑塔納推陳出新的速度已經讓我們眼花繚亂。雖然在現在看來，就和那些每年換個燈、換個輪轂的小改款車型一樣沒有新意，但是在當年這種方式卻屢試不爽。截止2003年，桑塔納在中國的保有量已經超過了200萬臺，對於當時的人們這種營銷方式確實有足有的誘惑力，這也證明了上海大眾不斷追求創新的意識，當然至此桑塔納更新的腳部依然沒有停止，接下來上演的就將是桑塔納3000的一陣“狂轟濫炸”。