曾有許多文章和書籍談到清末袁世凱與譚嗣同在北京法華寺晤面之事，一些電視劇中也涉及這個事。但對袁、譚晤面的法華寺之所在，語焉不詳，留下不少歷史謎團。
北京歷史上，曾有三座法華寺，分別位於北京的城南、城中、城西北，有“南法華寺”“北法華寺” “西北法華寺”之俗稱。
“南法華寺”在崇文區天壇公園東北部，現已無存，但留下一個地名——“法華寺街”。歷史上的“南法華寺”，就在今天的“法華寺街”之路北，曾香火旺盛，算是北京的一座名寺。
“北法華寺”在今王府井大街北段路東的報房衚衕，為明朝太監劉通舍宅而建，明天啟年重修，清乾隆年重建，一時也頗具規模。現已無存。
“西北法華寺”是俗稱，位於北京城西北的海淀區，今中央民族大學西門，民族學院西路之路北。該寺始建年代不詳，在清代是一座規模很大的寺院。現已無存。
其中到“南法華寺”投宿者，多為從南方來北京做生意的客商或來北京投考之學子;到“北法華寺”投宿者，多為來京辦事的達官貴人;到“西北法華寺”投宿者，則多為從京城赴頤和園拜見皇帝或皇太后的朝中重臣。
“北法華寺”是由宮內的太監所建。皇宮中的太監多信佛，且平素頗有積蓄。於是，他們便常拿了銀兩到“北法華寺”去拜佛，順便給寺廟捐錢。這些錢實質上也是他們的“買後路錢”。因為宮中的太監老了，也就沒用了。太監無後又無用，被開出宮後的晚景是很悽慘的。於是，很多太監趁尚在宮中之時，便考慮自己的晚年“後路”了。其“後路”之一，就是出家為僧。從明至清，宮中太監多到本由太監所建之“北法華寺”拜佛捐資，以博得寺中僧人(大多也是出宮之老太監)們的好感，待年老出宮後，該寺便可接納他們入寺剃度為僧了。由於“北法華寺”中的僧人、香客多為太監，與宮中有某種特殊關係，也吸引了眾多走仕途的人來此投宿，通過“北法華寺”的僧人、香客“走門子”，行賄買官。宮中太監，也多通過“北法華寺”獲得社會上的消息，密報給朝廷，得些賞錢。因此，“北法華寺”也是朝廷監督官員的耳目之一。
“西北法華寺”位於皇城到頤和園、圓明園的路途中間。出西直門往頤和園走，可經過此寺。住在北京城內的朝中大臣們，在去頤和園拜見慈禧和光緒皇帝的途中，常在“西北法華寺”歇息。許多大臣為了縮短拜見路途，節省時間，也為了減少勞頓之苦，常於拜見之頭一天就先住進“西北法華寺”，第二天晨起再赴頤和園。外地來京拜見慈禧和光緒皇帝的大臣，則多直接住進“西北法華寺”，以方便去頤和園。
那麼袁世凱和譚嗣同的法華寺之會到底是在哪座“法華寺”呢?要回答這個問題，首先必須弄清楚的是：袁世凱1898年9月奉詔入京，住的到底是哪一座法華寺?
筆者認為應為“西北法華寺”。根據有二：一是“北法華寺”在當時實為來京買官者蠅聚之所在，而袁世凱是奉詔入京的，不是去買官。且袁世凱為人十分機警，政治上很敏感，他當然知道“北法華寺”既是買官之所在，也是是非之地，朝廷耳目甚多。他既不買官，又是作為朝廷召見而引人注目的大臣，也就沒必要置身於耳目之下了。二是光緒皇帝召見袁世凱，是讓袁到頤和園去陛見的。袁已知光緒住在頤和園，為了方便去頤和園，節省路上的時間，也為了避免路途勞頓，袁世凱來京投宿之所在，當選“西北法華寺”。譚嗣同乘馬車赴法華寺密晤袁世凱，亦可印證此點。清代風尚，官員於城內拜親訪友須乘轎，去城外方須乘馬車。譚嗣同出城去位於海淀區的“西北法華寺”密晤袁世凱，因路途較遠，當然須乘馬車了。
一直以來，史學界有這樣一個似乎言之鑿鑿的說法：譚嗣同到法華寺密訪袁世凱，要求袁效忠光緒，在閱兵時趁機殺榮祿，然後率兵入京，包圍頤和園，逼迫慈禧交出權力。袁世凱假意應允，說：“殺榮祿如殺一狗”，但又推說要待慈禧去天津閱兵時再動手，以為拖延之計。後袁世凱迴天津向榮祿告密，出賣了光緒和維新派的計劃。榮祿連夜進京向慈禧報告，因此才有了戊戌政變，六君子被殺……筆者對此一說法，頗存疑問。
第一個疑問是：譚嗣同真的向袁世凱提出了這樣的要求嗎?未必。譚嗣同是維新派不假，但他出身於封建官僚家庭，本人也是封建官僚，忠君思想根深蒂固。譚所持之維新主張，並不是要廢皇權，而只是要在維護皇權的基礎上搞些許變法。依譚嗣同當時的地位、境界、主張，他不可能向袁世凱提出要袁殺榮祿，逼慈禧交權，這在當時來說屬“大逆不道”。從譚臨刑前的幾句話也可看出，他是忠於朝廷的。當時，他只不過是想“清君側”罷了。且當時光緒仍在親政，慈禧並未重新“訓政”，談不上讓慈禧交權的問題。
再者，譚嗣同在官場多年，也是政治上很精明的人，他也不可能提出這樣愚蠢的要求。因為凡頭腦清醒者都明白，袁所練新軍僅7000人，且駐紮在天津小站，受榮祿轄制。榮祿所指揮的軍隊，比袁世凱指揮的新軍要多得多，還有李鴻章留下用來防守京津要地的精銳部分，裝備也不差。僅僅指揮駐紮在天津小站的7000軍隊的袁世凱，怎麼可能殺得了指揮幾萬軍隊、防守在天津重鎮的榮祿?除非袁個人身手不凡，並自充刺客去殺榮祿。那樣的話，問題又來了。譚嗣同怎麼會提出讓袁世凱個人充當刺客去殺榮祿的荒唐請求呢?即使殺了榮祿，榮祿手下幾萬軍隊豈是吃素的?還有，袁所統率的7000新軍，遠在天津小站。天津到北京之間，清廷部署了幾道重兵防線。即便袁世凱在天津殺了榮祿，在幾萬軍隊的截擊下，他又怎麼能率一支7000人的軍隊殺到北京，包圍頤和園呢?
第二個疑問是：如果袁世凱決意耍兩面派，真的假意應允譚之要求，回頭便出賣維新派的話，他當時在北京法華寺完全可以直接向住在北京的清朝重臣李鴻章告密，也完全可以向住在北京的慶親王奕劻告密，甚至還可以直接到頤和園向慈禧告密。他怎麼會捨近求遠跑到天津去向榮祿告密?要知道，當時，袁世凱已被皇帝特許與榮祿“各辦各事”了。如果袁直接在北京向朝廷告密，豈不更受慈禧信任?
第三個疑問是：譚嗣同到法華寺找袁世凱密談，當為二人之間的高度機密，談的什麼話，只有袁、譚二人知道。戊戌政變後，袁、譚二人均無譚對袁所提前述諸種要求之說。何以袁、譚二人之間密談之內容反被別人知曉，甚至連誰說的哪句話都那麼詳細?當為疑也。
歷史常常給我們留下很多謎團。袁、譚法華寺之晤，亦為歷史之謎。當年，慈禧從頤和園回到皇宮，囚禁光緒，下令捉拿維新派人士，這是有必然性的。當時，帝、後兩黨矛盾已深，已到了互不相容的地步。後黨實力雄厚，且處處挾制帝黨。如帝、後兩黨發生衝突，帝黨必敗無疑。慈禧在帝、後兩黨矛盾尖銳之時，已決定要重掌最高權力了。決定之後，依慈禧的政治經驗，必定經過周密的考慮而有所安排，並且還要尋找一個在當時能為朝廷內外所接受的藉口。於是，這個藉口就來了。指使統兵大員殺大臣，圍頤和園以逼母后交權這樣的說法，在當時足以引起朝廷內外大臣們的憤恨。以此藉口來達到從光緒手中奪回最高權力的目的，也就能夠實現了。袁世凱在戊戌政變後的升遷可以證明，他確實捲入了這場鬥爭，並且是站在後黨一邊的。但他到底怎麼捲入的，需要進一步考證。在考證出來之前，從過去一直流行到現在的法華寺袁、譚密晤時二人的交易及此後的袁之告密，或可為一說，然此說存在的疑點也確實太多了。