種菜先養魚，養魚先養水，水好靠過濾，一個良好的過濾系統，才能保證你的水肥，水肥魚才長的胖，所謂肥水養肥魚是有道理的。魚的糞便長期在水中就會產生亞硝酸鹽，魚在亞硝酸鹽的水裡是要死的，過濾系統必須是把亞硝酸鹽分解硝化為硝酸鹽。但，硝酸鹽濃度過高魚也要死，一般情況下是不會過高的，如果真的高很高說明你的菜種的太少了，還有一個原因是你的過濾系統太好了。
潮汐式過濾系統圖
這種過濾系統解決了虹吸系統偶爾失靈的缺點，生化球要選空心裡面沒有海綿的，越大號越好。
生化球
左側三個箱子下面兩個藍色箱子是生化球，上面箱子過濾棉。右側五個小箱子是K1和過濾棉，K1用來增加氧氣。
櫃式過濾系統
那麼如何判斷水的硝酸鹽的狀況呢，看魚池周圍的青苔，青苔可以使水色變得發綠，你的魚池綠油油的說明你的水很肥，足夠植物生長所需要，但一個月下來，你的水還是白色的，說明你的水沒有肥，那麼植物也不會長大，或者只是一點點的青苔，這也是肥料不夠，證明你的過濾有問題。如果你的魚池裡面很多藍色的水藻，藍藻是水中的植物，植物需要肥料，水中有藍藻就說明水的肥料足夠，這是好的現象，說明你的過濾系統是正常的。
綠油油的水
如果硝酸鹽很多，對魚也有影響，解決的辦法就是加水，加入沒有任何肥料的水沖淡下，就這麼簡單。過濾的目的是讓水清澈見底，陽光照射後展現的是綠油油，油亮亮，藍窪窪，這樣的水質是既有足夠的肥料供給植物生長，又適合魚兒生長。
清澈見底的魚池
過濾池裡的硝化細菌是不需要陽光的，只要有足夠的水和氧氣就可以，硝化細菌才能把亞硝酸鹽轉化成植物生長所需要的硝酸鹽，硝化細菌只能生活在生化球、玻璃杯，陶瓷環等等這種有微孔的過濾材料中，在滿足水和氧氣的同時就能夠存活。
背景牆櫃式過濾系統
整個的魚菜系統的核心就是過濾，過濾的目的是讓魚和植物都受益，過濾系統其實就是一臺製造肥料的機器，肥料製造的足夠植物就有營養吸收，過濾系統還是一個清潔工，把魚生長的環境清理乾淨沒有汙染。如果你的過濾系統不能充當清潔工，不能製造肥料，那麼這個系統就是不過關的過濾系統，需要重新改造。
清澈見底
綠油油的菜
棚內蔬菜
牆邊蔬菜
方管種植
剛剛連接好的
小型可移動
過濾系統原理大概就是這樣，擺放位置根據空間條件而定，隨心所欲。