明祖陵是一座很大的皇陵，坐落於我國江蘇境內的盱眙縣，並且西臨洪澤湖，這座皇陵裡埋葬的人大家都不陌生，就是明朝的開國皇帝朱元璋的高祖、曾祖、祖父的衣冠冢及其祖父的實際葬地。
其實，和其他眾多的皇陵比起來，明祖陵的地理位置非常一般，它並不在山水相依的寶地中，而是在一塊坑坑窪窪，非常不平坦的丘陵地帶裡。當時給朱元璋祖先看地的就是著名的風水大師劉基，他從一開始就知道明祖陵的地理位置並不是完美的風水寶地，明祖陵的周圍只有一片湖泊，且地勢不平，實在是說不出來有多好。
既然知道這兒風水並不怎麼好，那麼，朱元璋為什麼不換個別的地方來安葬自己的祖宗呢？
其實這個事情朱元璋也很無奈，因為這是他祖父朱初一的墓穴所在地，如果說要換地方，那麼，其多年積累的王氣肯定就會傾瀉而出，影響明朝的國運。
那麼，他祖父為什麼把墓穴放在這裡呢？《泗虹合志》裡面記載著這樣一個傳說：
話說，楊家墩家有個窪窩，朱元璋的祖父朱初一經常臥於其處。有一次，一個道士路過此處，年了這個地勢說，“葬於此處，後代可出天子。”朱初一把道士的話告訴了朱元璋的父親朱世珍。十年後，泰定四年朱初一病死，如道士所言，葬於此。半年後，朱世珍妻陳氏即懷了朱元璋。之後朱元璋就因為其祖父睡了風水寶地，所以，最後當了皇帝。
所以說，非常無奈之下，朱元璋只能把祖陵放在了這裡。並且，朱元璋當年在修建陵墓時，朱元璋不敢移動其祖屍骨，怕挑斷龍脈，壞了風水，因此在旁邊造了衣冠冢。
為了彌補一下這塊地先天上的風水問題，當初建造的時候他可下了一番大工夫，地勢不平的地方都是人工填補，地下河道甚至都要改變流向，所以說，眼前這片地方，是朱元璋費了九牛二虎之力才改造出來的，並不是一塊天然的的風水寶地。
朱元璋於洪武十九年開始修建祖陵，追封並重葬其祖父朱初一、曾祖朱四九和高祖朱百六三代帝后，次年在陵前建享殿，永樂十一年朱棣又建櫺星門及圍牆，祖陵全部建成。據有關史料記載，當年明祖陵建築規模宏大，氣勢雄偉，十分壯觀。
那麼，朱元璋改了這麼多，為什麼明祖陵還是在水裡呆了好幾百年？
是這塊地確實是不堪大用，是不適合作為帝王的陵墓來使用？還是隻是自然的力量而已呢？又或者，是人力讓洪水灌入了這塊被修改過的土地? 有人推測，天災確實有，但是，只有三分，另外七分就是人為，那麼，這種推測到底從何而來呢？
公元一四九四年的時候，劉大夏奉命建造太行堤，目的是為了阻斷黃河的一個支流，誰知道這次修改以後就開始亂了套，河道自此開始紊亂，淮河沿岸一帶開始不斷的鬧水災，一起遭殃的，當然還有我們的明祖陵，被水淹多次，不斷遭受水患。
為了解決這個問題，管理河道的工部尚書潘季馴想到了一個好辦法。他的想法是，建造一個堤，把水重新歸到河道里，不要為了疏通再開支流，目前這種情況，應該把水聚在一處，用水的自身的力量解決問題，而不是運用蠻力。他覺得，水被分開的同時，力量就小了，那麼，如果和在一起，力量就會變大，就會把河道沖刷的更深，這樣蓄水能力就會提高，而衝出的沙子也會變成一個天然的堤。這樣不費吹灰之力，就可以解決目前的問題，一舉兩得。
只是可惜理論就是理論，雖然看起來不僅節省銀兩，而且還省心，但實際操作中，沒人知道，但是，這番言辭頗為有理，所以明神宗決定採用他的辦法試一下，看看是否可行。
只是理論到底是和實踐有差距，你就算把整個淮水之力集中起來，恐怕也擋不住黃河，水量巨大，沖刷力極強的黃河怎麼會只靠一點淮水之力就原道返回呢，這顯然是不可能的。所以這套方案採用以後，河口泥沙堆積的更為厲害了，而淮河的河床因為被黃河不斷地灌水而流量逐漸變大。這樣一來，淮水的水勢就更低了，遇到阻礙以後不僅過不去，反而會倒灌，這樣的惡性循環，讓情勢更加糟糕。
本來只是夏季會發洪水的地區，現今，一年四季都會受到洪水的洗禮，百姓民不聊生，朝廷也損失慘重，每年都要花費大量的銀子去賑濟災民，這套辦法的實行不僅沒有取到預期的效果，反倒讓問題更加嚴重。
此時，提出這套方案的潘季馴知道自己這個辦法在實踐中被徹底的否定了，按照一般人的想法，錯了就要趕緊改正，但是，這個時候一旦更改，豈不是說明自己辦法原來就是非常愚蠢的。之後，潘季馴為了維護自己的面子和權勢，決定把這件事徹底的隱瞞下去，為了自己的前途，他把所有的反對意見都剔除了。
不僅如此，他在上報的摺子裡還說明：祖陵比以前好，周圍的松柏長勢良好，讓皇上不要擔心。之後，清康熙十九年，黃河奪淮，明祖陵與古泗州城一起毀於洪水。
這一轉眼竟然瞞了很多年 也不知道朱元璋的祖宗到底會不會顯靈，如果顯靈的話，自己的墓地被水淹這麼多年自己怎麼會無動於衷呢？
上世紀七八十年代，為保護明祖陵，築堤3000米，把陵墓從湖水中隔出，沉沒湖中300餘載的文物瑰寶重見天日，成為一處遊覽勝地。這隻能說明被埋入陵寢中的祖宗恐怕也是有心無力，才會足足被淹了三百多年，而這件事情，在歷史界，也就是我們所說的水下古墓之謎了。