整枝主要是調節植株生長和結果的矛盾，減少養分不必要的消耗，使植株健壯生長。整枝的輕重應根據栽培品種的發枝情況、長勢、種植密度、土壤肥力等具體情況而進行。
整枝方法
1、單蔓整枝：是在主蔓長約50釐米時，保留主蔓，摘除所有的側蔓。單蔓整枝的葉數少，雌花數少，坐果的選擇餘地小，果形較小，通常在北方生長期短的地區早熟栽培時採用。
2、雙蔓整枝：除主蔓外，在基部選留1個側蔓與主蔓平行生長，以後摘除所有的側蔓。雙蔓整枝相對單蔓整枝，蔓數較多，葉面積較大，雌花數較多，主側蔓均可坐果，果形較大。一般在南方和北方早熟栽培上普遍應用。
3、三蔓整枝：除主蔓外，基部選留2個側蔓與主蔓平行生長，以後摘除所有的側蔓。三蔓整枝，葉面積更大，果形大，雌花數多，坐果機會多，是露地栽培中晚熟品種常用的整枝方法。
4、多蔓整枝：主蔓5~6葉時，對主蔓進行打頂，側枝成型後選留4~5條側蔓，向四周或兩側平行生長，利用側蔓結果。該法各個枝條長勢接近，雌花出現節位、開花時期較接近，可以同時結3~4個瓜。此法在生長勢強的品種和稀植時應用。
注意事項
1、整枝強度應適當。西瓜以輕整枝為原則，根據分枝數、田間覆蓋率靈活掌握。過輕達不到效果，過重則影響西瓜正常生長。
2、要分次及時進行整枝。西瓜整枝過早會抑制根系生長；整枝過晚，摘除的枝葉量多，白白消耗了植株的營養，達不到整枝的目的。通常在西瓜主蔓長50~60釐米時進行，摘除葉腋發出的側枝15釐米左右，隨後每3~5天進行1次，連續進行3~4次。
3、坐果以後不再整枝。西瓜坐瓜後植株長勢趨向緩和，營養中心主要是在果實膨大和種子的生長，不存在長勢太旺的問題。另外，新抽生側枝上的葉片所製造的養分有利於瓜的膨大，而且會增加後期坐果的可能性。
4、整枝要與種植密度聯繫起來。在同一密度條件下，蔓多的葉數增多、單株葉面積大，雌花數多，坐瓜數也相應增加。但改變密度以後則是另一種情況，整枝增加了密植的可能性，單位面積的坐瓜數增加，瓜形增大，從而提高了產量和瓜的商品性。
整枝授粉
1、頭茬採用三蔓整枝法，即除主蔓外再在其3~5節處選留2條健壯側枝，其餘枝杈在西瓜坐果前全部抹去。選主蔓第3或第4雌花留果（節位控在18~22節範圍內）。上午10點前人工輔助授粉，用坐瓜靈處理果柄和子房，每株授粉2朵，等瓜長到拳頭大進入快速生長期，留一個果形周正、生長快的幼瓜，摘除另一個（去側蔓的）。在主蔓結瓜節位前留10片打頂或埋頭，促進側枝生長，以後不再打杈。
2、二茬瓜採用側枝留瓜法。在頭茬瓜停止膨大後，在側枝上留果，若2條側枝上相近節位在同一天開放，可每株同時授粉2朵。授粉5~7天后，若兩個瓜大小一樣則全留，否則去小留大。二茬瓜的品質、個頭、產量都不低於頭茬瓜。頭茬瓜成熟收摘後，正趕上二茬瓜褪毛，進入迅速膨大期，此時追肥、澆水，既保證頭茬瓜優質，又保證二茬高產。
3、剪除老葉和摘瓜蔓。西瓜葉片功能期一般50天左右，超過50天后即使不變黃，製造養分的能力也很低。因此在頭茬成熟後要剪除結果主蔓及其基部老葉和病殘葉，但要注意保留2~4節，以促使抽生側枝為結3~4茬打基礎。
4、頭茬瓜坐穩後不再打杈，但要及時理順瓜蔓。在摘瓜和剪除結果蔓時，一定要保留30~40釐米，不可弄亂或碰傷其他瓜蔓、瓜葉及未熟西瓜。整枝時間以晴天上午為好，摘瓜時間以晴天下午為好。