在整個武德年間，李靖既不屬於秦王李世民集團，也不屬於太子李建成集團。李世民雖然在危急關頭為李靖說過話，但李靖卻並沒有進入李世民集團的核心。在秦王的文學館中，沒有李靖。玄武門之變，李靖也沒有參與謀劃，更沒有參加行動。太子集團也沒有主動拉攏過李靖。
李靖是個真正忠於唐朝的人。
整個武德年間，李靖都在為平定各地割據勢力努力。他和李孝恭密切配合，充分施展自己的軍事才能，為唐朝的統一做出了傑出貢獻。難怪李淵會對他讚不絕口。
玄武門之變後，李世民掌權。他並沒有因為李靖不是集團的人就冷落疏遠。他依舊像唐高祖一樣信任他、重用他。貞觀元年，任命他為刑部尚書，賜封四百戶。貞觀二年，又兼任中書令。貞觀三年，轉任兵部尚書。
國內太平之後，突厥的威脅便日益凸顯。李淵在太原起兵時，曾向突厥撕逼可汗稱臣，以換取北方的安定。但突厥並不安分，經常騷擾邊境農民，還支持薛舉、劉武周等割據勢力。隨著唐朝逐漸統一，突厥感到了壓力，他們不想看到強大的統一王朝。唐朝也不會容許突厥的騷擾。所以，雙方必有一戰。
先動手的是突厥。
武德八年八月，突厥頡利可汗率領十萬突厥大軍越過石嶺，進攻太原。李淵急忙調兵防守。李靖任行軍總管，率一萬唐軍駐守太谷。突厥來勢凶猛，唐軍無力抵擋。幷州總管任瑰全軍覆沒。唯獨李靖的軍隊得以保全。不久，李淵又調任李靖為靈州道行軍總管，責任就是抗擊突厥，防止突厥大軍進一步南下。
武德九年八月，李世民即位不滿一個月，頡利可汗就給這位新皇帝送了份“厚禮”。他率十幾萬精銳騎兵進犯涇州，並長驅直入，一直打到渭水便橋的北邊，威脅唐朝首都長安。由於突厥來勢凶猛，當時徵調的防守軍隊竟然尚未趕到長安。為解長安之危，李靖及時調集軍隊，準備斬斷突厥退路，威脅突厥大軍的後方。在這種情況下，李世民冒險親自到渭水橋邊，與頡利可汗結盟，突厥才退兵後撤。
雙方雖然結盟，但大家都知道，這只是暫時，和平不會以“結盟”這種方式出現。和突厥的戰爭，這只是開始，而不是結束。