水產養殖的命脈是水，水質的好壞決定養殖產品的品質的產量，對養殖效益起著至關重要的作用。有效利用池塘養殖密度的提高，水源的匱乏，以及迫捷的養殖零排放趨勢，對養殖用水的處理及回收利用，是擺在水產人面前的重要任務。
保持養池塘或水庫良好水質，養殖水產品生長迅速、飼料利用率高，養殖產品不易患病，是獲得養殖效益的關鍵所在。有一種神祕的紅色液體，它就是光合細菌，水產老司機都視它為寶。
光合細菌能夠降解水體中的亞硝酸鹽、硫化物等有毒物質。改善養殖環境，培養浮游動物，增加天然餌料，降低餌料係數。提高水體透明度，促進浮游植物的光合作用。增加水產動物幼體的增重率和成活率，作為飼料添加劑和預防疾病等方面有不可估量的作用。
光合細菌要經常使用，而且宜晴天使用，這樣光合細菌在水體中形成優勢群體，發揮最佳的效果，光合細菌在生產池塘每隔10-15天潑灑使用一次，每畝潑灑5-8公斤。對於養殖密度較高，通過使用光合細菌仍有過肥現象，應適當加入新水，將換出的水收集到單獨的池塘，通過潑灑生石灰水消毒，並加大潑灑使用光合細菌，一般幾天後又可以再循環使用。既節約用水，又避免了排放汙水的現象，神奇光合細菌可謂是水產養殖的法寶。
由於購成品光合細菌成本太高，則可以採用光合細菌培養基自行培育光合細菌，可以大幅度降低成本，每公斤光合細菌成本不足3毛錢。以養殖泥鰍為例，整個養殖季節每畝池塘光合細菌花費不超過30元。
自行培育光合細菌的方法比較簡單，因而適合養殖戶在普通家庭條件下進行生產培育。培育採用清潔水加光合細菌培養基和食鹽，再加入光合細菌種。首次培育完成後留取少量作為下次培育的菌種。培育的容器則可以使用透明塑料瓶、塑料桶、塑料袋或魚苗袋等。培育時間一般為5-7天，通過簡易方法檢查合格即可使用或留種。
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