黑旗魚
消化菌：異營性細菌，一大群細菌的總稱，為好氧性菌，能分解水中的有機物。說明白一點，就是能把大便或是殘留的飼料或豐年蝦分解，通常廣泛生存於水中，不太須要額外添加。
硝化菌：都是叫，消硝。但二者大大的不同，也是很多人會搞錯的地方。硝化菌也是一大群細菌的總稱，為好氧性菌。無法分解有機物，也就是無法分解大便或是飼料，而是將水中的氨或亞硝酸分解。通常這二種物質就是水中的有毒物質，也是水聞起來有腥味或臭味的因素。
光合細菌：為自營菌，也是一大群細菌的總稱，為厭氧性菌。能在光線充足的地方自行光合作用，能幫助分解水中有機物質，不過因為他是厭氧性菌 在大自然中通常存在泥土或氧氣少的地方，在水族箱中無法長期存在，添加後幾天內就會失去效用。因此必須定期再添加，不屬於水族箱中長存的菌種，這三個細菌都是不同的菌。水族箱中以前二者較為重要，也關係者水族箱中菌相平衡的一大因素。
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