首先，我們來確定一個觀點，即魚只生病只有兩種可能，第一種是魚只生存環境變化導致，另外一點是魚體有病變。一般的魚體掉鱗、劃傷等我們姑且不認同這是疾病的症狀，可能說是意外或是事故更貼切點。既然已經排除了魚只的問題，那麼很明顯，魚只得了病，而且是傳染病，那就是水體出了問題。魚只生活在魚缸中，而換水只能人為操作，除非你把養魚的環境佈置在室外，經過大雨之後，水體酸度暴漲，你的鹼性魚就犧牲了。
水體出現了問題，多半是水體有了細菌，有細菌的存在就會使魚得細菌性疾病。常見的疾病為爛尾等，初期只會有少數魚之發病，最初的症狀通常只有浮頭、食慾不振等等。如果有此類情況發生，最簡單的還是進行換水，在一定程度上換水會減少細菌的存在，但僅限於疾病初期。若只有一隻魚發病，依照正常方式，隔離治療，原缸下重鹽，每天大量換水，持續三至五天，若停藥一星期之後，沒有新的魚只發病，即可確定以控制病情。若隔離第一隻病魚，數天之後原缸仍然出現病魚，就代表疾病已在原缸中蔓延開來。此時可採用兩種方式。方法一是隔離病魚，病魚缸與原缸下重藥，每日換水，將過濾綿全部更新，儘量減少細菌數量，持續兩週，若沒有新的魚只發病，即可確定控制病情。若新的病魚不斷出現，則使用方法二。方法二是逆向操作。將外表健康的魚移至新缸，如果可能最好是一隻一缸。健康的魚以黃藥和重鹽藥浴三至五天，停藥後一星期沒發病即是沒有被傳染的危險。若發病則移至病魚缸，病魚缸採用輕量藥劑長期治療，並輔以每天100%換水，兩天喂一次，喂完之後馬上換水。持續此步驟直到缸中的魚症狀消失回覆活力，或是持續到魚全部掛光為止。
其實當魚缸出現傳染病時，治療已是次要事項，如何防止疾病的蔓延才是重點，通常疾病蔓延會持續到魚全部死亡為止。所以很多人養魚常遇到養怎麼死，待魚死光之後，重新洗魚缸佈置造景，新買的魚反而能養活，即是因為重新洗魚缸這個動作消滅了傳染病之故。所以在決定重新飼養熱帶魚的到時候一定要把養魚的設備進行消毒才可以。