產前診斷遺傳分析有了新方案,你知道嗎?

Illumina 懷孕 寶騰 科學 安諾優達 2017-06-08

導讀:產前診斷是出生前檢測胎兒是否患有某些遺傳性疾病或先天畸形的技術。通過細胞或分子遺傳學技術對侵入性取樣技術取得的胎兒遺傳物質進行分析,以確定其是否帶有可能引起遺傳性疾病的異常。

自上世紀70年代細胞培養與核型分析技術應用於產前診斷,細胞遺傳學與分子生物學技術不斷被引入到臨床應用中。PCR、FISH、MLPA、Bobs等技術的出現為產前診斷金標準——核型分析提供了有效補充,大幅提高了產前診斷的分析精度與檢測範圍,使得臨床的視野得到大大的擴展,為我國優生優育事業做出了不小的貢獻。

產前診斷遺傳分析有了新方案,你知道嗎?

但隨著臨床對產前診斷精度要求越來越高,以上技術的缺點就暴露出來了。這些分子分析技術雖然能夠檢測微小的染色體異常,但是其檢測無法做到高通量與廣覆蓋,即僅能檢測有限種類的染色體異常,無法針對整個基因組進行全面檢測。所以,以上技術只適用於有遺傳學疾病先證者的家庭再孕、高度懷疑某類疾病或核型分析結果不清晰需驗證的產前診斷情況。

產前診斷遺傳分析有了新方案,你知道嗎?

針對以上,微陣列芯片技術(CMA)與高通量測序技術(NGS)應運而生。此兩種技術具有檢測精度高、分析範圍廣的特點,彌補了上述技術的缺點,可以一次性對整個基因組進行檢測,檢測精度可達Kb級別,為臨床提供最全面的分析結果。同時,高通量測序技術由於技術原理上的獨特優勢,可以檢測新發類型的突變,可以區分低比例嵌合體,還可以靈活調整測序策略適用不同精度,較微陣列芯片技術更具發展前景。

基於高通量測序的染色體異常檢測,可覆蓋全部23對染色體,分辨率可達0.1Mb,可以有效檢測超過500種染色體異常綜合徵,適用於產前篩查陽性、高齡、染色體異常患兒生育史等具有產前診斷指徵,需要進行遺傳學診斷的孕婦。利用該技術進行產前診斷可以為臨床提供高精度的遺傳學分析,為妊娠結局的選擇提供支持,有效避免先天缺陷兒的出生。同時,該技術不需要細胞培養,樣本適用類型廣泛,不僅適用於絨毛、羊水、臍帶血等的檢測,而且適用於流產組織、成人、兒童外周血等的檢測。

隨著高通量測序技術臨床應用的不斷擴展,越來越多的醫院對掌握這門新型的分子遺傳學分析技術有著越來越迫切的需求。目前可用於臨床的高通量測序儀主要分為Proton、BGISeq和NextSeq三大平臺。NextSeq平臺在測序通量與質量方面較Proton平臺與BGISeq平臺具有明顯的優勢,其Q30質量值普遍可達80%以上,一次測序可檢測48個樣本。在實際應用中,NextSeq平臺是產前診斷染色體異常檢測的最常用平臺,積累了大量的臨床樣本數據庫,可提供更全面的結果分析。而最新研發並已獲CFDA認證的NextSeq 550AR是NextSeq平臺最傑出的代表,其Q30可達93%,在測序質量方面顯著優於其他平臺。

樣本檢測流程:

1、取樣與DNA提取:染色體異常檢測適用於多種樣本,針對不同樣本的處理方法也不盡相同。以流產組織為例,組織需經過剪碎、消化等過程將細胞粉碎,再經過DNA純化提取其中的DNA。

2、建庫與擴增:該項檢測所需DNA量極少,僅需10ng即可完成檢測,DNA樣本經過末端修復,增加接頭引物、索引引物,PCR擴增等步驟後即完成了上機測序前的準備。

3、樣本測序:通過對NextSeq 550AR進行簡單的設置後,即可開始對文庫進行全覆蓋低深度基因組測序得到測序結果。

4、報告輸出:經過自動化分析軟件將結果與數據庫進行比較,再結合遺傳諮詢人員的潤色,一篇染色體異常報告就完成了。

NextSeq 550AR

是安諾優達與美國Illumina公司合作開發的新一代桌面式高通量基因測序儀,採用最新研發的雙通道“邊合成邊測序(SBS)”技術和經典的“可逆末端終止子”專利技術,具有通量高、速度快、數據精準、性能穩定、操作簡單等諸多優勢,與目前市面現有的設備比較,其數據質量、穩定性以及批量樣本處理能力等均具有顯著領先的優勢。同時, NextSeq 550AR也具備極強的臨床和學術應用延展性,包括PGS、液體活檢、FFPE測序、遺傳病檢測等都可以在此測序平臺上進行試劑盒的開發和註冊。

產前診斷遺傳分析有了新方案,你知道嗎?

相關推薦

推薦中...