紅太陽幼兒園食品安全問題經媒體曝光後，望花區主要領導表示，對此事件要積極調查、深入瞭解、科學研判，如果情況屬實，絕不姑息，嚴肅處理。望花區第一時間組成調查組，進駐紅太陽幼兒園開展深入調查。
在現場調查取證中，區市場監督管理局查驗了該幼兒園的餐飲服務許可以及食品經營人員健康證，認定證照齊全。但是，發現在食堂冷凍櫃底層留存的半袋由漳州市某公司生產的精製大豆肉鬆，產品生產日期為2016年11月30日，保質期6個月，超過保質期；一袋我市某食品加工廠生產的冷麵，無生產日期和淨含量；一白色塑料容器盛裝的小米，生有米蟲；在食堂洗漱間發現盛裝直接入口食品容器，部分未消毒。執法人員當場對該幼兒園經營的不符合食品安全標準的食品依法予以扣押，同時認定當事人存在以下違法行為：一是沒有按照保證食品安全要求定期檢查庫存食品，及時清理變質和超過保質期食品；二是採購食品原料沒有索證索票；三是使用未經消毒的盛裝直接入口食品的食品容器；四是涉嫌採購不符合食品安全標準的食品原料；五是涉嫌經營《中華人民共和國食品安全法》禁止經營的食品，區市場管理局將在進一步調查後根據《食品衛生法》進行嚴肅處理。
區疾控中心同時跟進調查。通過核查，發現近一個月內無紅太陽幼兒園托幼兒童食源性疾病病例報告，無紅太陽幼兒園托幼兒童中毒病例。經區疾控中心鑑定，此次事件不是一起食物中毒事件，不構成食源性疾病暴發與突發公共衛生事件。
區教育局在事件發生後，也立即做出積極反應，會同區市場監管局執法人員對紅太陽幼兒園負責人進行教育訓誡，責令她認識錯誤的同時，真誠與幼兒家長對話，滿足家長的合理訴求。該幼兒園負責人接受批評，表示服從處理，並以書面形式向全體家長道歉，按照有關部門要求進行整改。同時，區教育局委派學前教育專幹，到紅太陽等幼兒園進行督查巡視，確保在全區幼兒園孩子的合法權益不受侵害。區教育局近期還將召開全區幼兒園長會議，要求各幼兒園對食品安全工作進一步提高認識，開展食品安全自查自檢，確保幼兒日常食品安全。此後，區教育局與市場監督局、疾控中心領導分別接待了幼兒家長代表，並與家長代表建立信息溝通平臺，家長代表對望花區的積極態度和處理方法表示滿意。