日本澡堂的男女混浴是日本的一項眾所皆知的傳統，這個風俗從日本戰國時期便開始了，到了江戶時代大眾化，至今已經有400多年的歷史。日本澡堂的男女混浴之所以出現，和當時的市民文化有密切的關係，但形成後逐漸走偏。
日本有記錄的最早的公共浴室是在1591年左右，相當於中國的明朝時期。當時日本處於戰國時期的末期，社會逐漸穩定，市民階層的人數越來越多，人口急劇增長，意味著城市的擴張。在當時的江戶（即現在的東京）是各地大名以及商人聚集之所，人員密集商業繁盛，這需要大量的水與場地以及木柴來滿足日本市民的洗浴要求，而狹小的場地和高昂的水費、柴火費決定了這些浴場只有一個浴池來滿足民眾的洗浴要求，這個滿足的代價就是男女混浴的出現。
1591年，在如今東京都千代田區大手町錢瓶橋，來自畿內的商人伊勢與一開辦了江戶第一家澡堂，因為當時江戶市區建設並沒完備，地下水道希少，水費比薪材還貴，所以當時澡堂實際是蒸氣桑拿浴。因為收費低，所以很快吸引了大量顧客，一時繁盛。在這間澡堂裡，由於條件所限，市場需求又旺盛，所以自然而然地就出現了男女混浴的現象。
江戸名所圖屏風一部分
上圖是1624年左右描繪澡堂風景的《江戸名所圖屏風》，從中可以看出可以看到當時澡堂顧客為男性，搓澡工為女性。所謂澡堂其實以擦身為主，池子也很少。不過隨著江戶城市不斷擴大化，澡堂也慢慢變多，到了江戶後期文化年間(1804~1818)江戶城市共計600餘軒公共澡堂。
初時男女混浴僅限同族同家子女，別家分隔。但後來行業競爭越來越激烈，特別是與娼妓聚集的娛樂場所對抗，公共澡堂毫無優勢，於是打擦邊球的男女混浴便開始了，有些店家就公然招募陪浴的私娼。此風一開，男女混浴的澡堂一下子門庭若市，甚至公然賣春。公共澡堂的男女混浴習俗逐漸走偏。
這種走偏引起了政府的注意，德川幕府在1648年“風呂屋禁止令”中規定一家澡堂只允許三名“湯女”，即最多有三名服務擦澡的女性；1657年又搗毀了200家以賣春為主的澡場。在1791年，鬆平定信在江戶城頭貼出禁止成年男女混浴的告示。然而政府的干預並沒有是沒用，公共澡堂的男女混浴該怎樣仍然怎樣。當時的一位地方藩主留下了筆記，說這種公共澡堂裡黑燈瞎火，時有男女行苟且之事。
1853年美國水師提督佩理率艦隊敲開了日本國門，也目睹男女混浴的現象：一個公共澡堂裡，男女滿不在乎地赤身裸體，混雜共浴，那光景使美國人對當地的道德心抱有不太好的印象。他不僅把這個東洋景用文字記述在《日本遠征記》中，而且有寫生畫為證。男女混浴，通俗文學的猥褻插圖，讓他認為日本人淫蕩。
但見仁見智，似乎普魯士人比較說好話，例如艾林波伯爵，在美國人之後出使日本，說：男女老少共浴一池，起碼不發生醜事；不，可以說，入浴的人絲毫不注意男女性別。其實這只是他沒有深入瞭解的情況下這麼認為的，公共澡堂的男女混浴很多都打賣春這種擦邊球的生意，否則日本政府也不會屢頒禁令去禁止了。
明治維新後，日本全盤學習西方，但男女混浴的傳統仍然有巨大的市場。一百多年前的1879年，時當清末，中國人王韜遊覽過日本混浴溫泉，寫道：“往浴於溫泉，一室中方池如鑑，縱橫約二丈許，男女並裸體而入，真如入無遮大會中。”到了三島由紀夫（生於1925年）小時候，溫泉鄉男女混浴也不罕見。而生於1907年的井上靖寫傳記小說，說小時候寄居在伊豆半島上的曾祖母家，經常跟讓他叫姐姐的年輕姑母在全村公用的溫泉混浴，他十來歲，在水花中看見姑母“白皙豐滿的裸體很耀眼”。
二戰後，日本飛速發展，生活方式與時俱進，一般人家都有了浴室，男女混浴的公共澡堂逐漸衰敗。據統計，二戰後男女混浴的公共澡堂最繁榮的1968年東京都內有2687家，而今只剩下652家。日本曾有800間混浴的溫泉旅館，另有400處野外混浴溫泉池。但2013年統計，日本全境只剩下500間混浴的溫泉旅館和200處野外混浴溫泉池。
報道稱，多數日本人覺得混浴是珍貴的日本文化，若因少數人胡來而讓這個文化消失，真的非常可惜。