茨菇田生態兼作(輪作輪養)，是利用茨菇田淺水環境，既種菇又養殖，充分利用水中動物餌料，還能減少茨菇病蟲害，增加肥份，同時保證魚類用水與水生經濟作物茨菇一生都不得缺水習性，從而取得菇魚雙增產的生產方式。實踐證明：菇田養殖具有投資少、見效快、收益高的特點。現將其生態兼作技術簡介如下。
一、搞好田間配套工程建設
1.田塊選擇。用於兼作的田塊更要求水源充足、水質好、無汙染、注排水方便、蓄水力強、漲水不淹。
2.田埂加固加高。通常把田埂加高至30～70釐米，寬度一般為30釐米左右。田埂要捶打結實，以防田鼠等動物打洞漏水或大雨時溢水，造成逃魚。
3.開挖環溝、田間溝和暫養池。魚溝一般在菇苗栽植前開挖。可開成“口”“田”“井”字型。一般每隔15～20米可開一條橫溝或豎溝，田的四周必須距田埂兩至三行菇苗處開挖一環溝。溝深、寬30～50釐米。魚溜要開在魚溝的交叉處，一般設在排灌水口附近或菇田中央,長形或圓形。每個魚溜面積2～5平方米,深0.6～1.2米，暫養池長度視用塊長度而定,寬4～6米,深1.2～1.5米，一般暫養池面積佔茨菇面積的5%～7%(養蟹可佔15%以上)。魚溝魚溜總面積可控制在佔菇田面積的5%。
4.設置排灌水口和攔魚設備。
二、菇田生態兼作養殖種類。
菇田兼作魚類種類有鯉、鯽、草、鬍子鯰、羅非魚、團頭魴、鰱、鱅魚、黃鱔、泥鰍、河蟹、青蝦、田螺、牛蛙、羅氏沼蝦等。菇田具體放養種類，要因地制宜，並要儘可能多品種混養，以充分利用菇中生物餌料。?
三、苗種兼作放養
通常一塊菇田應以一種魚為主，適當搭配3～4種其他魚類。苗種放養要求體質健壯體表光滑、鱗片完整，鰭條無損、大小整齊，並且在放養前用藥液浸洗消毒。
四、精細搞好菇田兼作飼養管理
1.水質管理。苗種放養初期，魚小菇矮可以淺灌，水深10～12釐米；隨著茨菇長高，魚種長大，要逐步加水，水深保持在15釐米左右，使其始終能在水田叢中暢遊索餌。菇田排水時，不宜過急過快，防止魚兒來不及進溝系而乾死；注意夏季水溫變化。菇田水溫在盛暑期可高達30℃～50℃，故要適當加深水位或換水降溫。
2.防汙防逃。經常巡查，發現問題及時處理。
3.投餌施肥。應按不同養殖對象根據季節、攝食、生長情況，輔喂精飼料，如糠餅、豆渣、麩皮、菜餅、螺螄、蚯蚓、蠅蛆、魚用顆粒料、雜魚小蝦和其它水生動物等。
茨菇栽插前應施足基肥，秧苗活棵後再追肥。菇魚兼作有機肥應占總肥量70%以上。因此菇魚兼作要控制好化肥用量。施用對水產品較安全的化肥，如尿素、過磷酸鈣等。其用量，水深6釐米以上,一次畝施尿素3～5公斤,過磷酸鈣5～10公斤。用法：作基肥菇苗栽植前深施，作追肥要加深田水或放乾田水，採取少量多次進行，或一次施半塊田，隔日再施剩下的一半，並注意不要直接將化肥撒在溝系內。對水生物有強烈刺激作用的碳酸氫銨等僅作基肥為好。
4.菇田用藥。宜使用高效低毒蟲藥，如井崗黴素、多菌靈、殺蟲脒、殺蟲雙等。施藥時一般要先加深水位，藥物應儘量噴灑在菇葉上，不僅能提高農藥效果，而且還可避免藥物落入水中危害養殖品種。粉劑農藥在露水乾前噴施；水劑在露水乾後噴灑。禁用毒性較大的農藥，如五氯酚鈉、毒殺酚等。
根據品種優劣和其茬口搭配關係，一般採用5～6月初催芽，6月底移植菇苗,在移栽茨菇苗前先拔好茨菇苗秧，洗去過多厚泥，早栽苗，行穴距50～80釐米見方，畝植1500～2000株。茨菇採收結束後，選擇早熟油菜秧苗，於11月底12月初栽植，畝密度3000～3500株。
六、捕獲。
一般在茨菇採收前30～40天捕獲。起捕方法：先疏通溝系水流暢通，然後再緩慢排乾田水，使菇中魚兒順利進入溝中，再順著水流集中到魚溜或排水口，此時用小抄網起捕即可。