上世紀九十年代，香港電影百花齊放，做為必不可少的一個重要流派和分支，武俠功夫電影一直以來都有非同一般的地位。
洪熙官被滅門
做為這其中的代表電影人之一的李連杰，更是將新派武俠電影推到了一個無人企及的高度，《新少林五祖》就是其中的優秀作品之一。
清朝康熙年間，少林弟子與陳近南因攜手在各地建立祕密組織反清復明，而被朝廷列為必殺目標。
大俠洪熙官因牽扯其中被滿門殺害，但自己的幼子得以倖免。
馬寧兒
洪熙官的同門師弟馬寧兒卻投靠朝廷做了叛徒來刺殺洪熙官，不敵洪熙官被一槍刺中，但倖免於死，最後被西域妖僧救走，練就了百毒不侵之身。
少林方丈將一幅明朝遺留下來的藏寶圖紋在了五個小弟子的背上，以圖交與天地會總舵主陳近南，從而完成反清復明的大任。
遇到馬大善人
兒子漸漸長大，洪熙官本打算將兒子託付給自己的親哥哥，結果再次被出賣，殺人之後走投無路到馬家莊土豪員外馬大善家做了保鏢。
竊賊母女
馬大善則花錢買下一個賣身葬母的姑娘紅豆，而紅豆與母親其實是一對竊賊母女。
馬大善之子是少林五弟子之一，因與洪熙官的兒子洪文定發生矛盾，用飛鴿傳書到少林找其餘四弟子前來搭救，不料正遇到官兵血洗少林，方丈被變異後的馬寧兒撕成兩半。
血洗馬家莊
官兵發現飛鴿，得知少林五弟子藏身馬家莊，便在馬大善與紅豆成親之際又血洗馬家莊，打鬥中，官兵抓走洪熙官之子，而洪熙官與紅豆則救走其中一個少林弟子。
洪熙官與紅豆兩人漸生情愫，與母女兩人化敵為友，三人遂用計一起劫獄。
洪熙官與已經變異且帶戰車的馬寧兒一場惡戰，結果卻不敵對方，無奈用炸藥想與對方同歸於盡，馬寧兒被炸成重傷。
雞婆大師蠟人張
一行人最後得以逃脫後尋找紅花亭，遇到做蠟像的怪人蠟人張，之後大年三十夜晚終於等到陳近南，不料一出場就被馬寧兒秒殺。
紅豆的母親其實是當年人稱千手觀音的朱小倩，善使暗器，卻在與八臂羅漢對飆暗器時不幸被刺身亡。
馬寧兒隨後趕到，洪熙官父子合力絞殺馬寧兒未能成功，這時蠟人張及時趕到，原來蠟人張就是少林高僧雞婆大師。
父子二人合力絞殺馬寧兒
最後，洪熙官之子洪文定用槍頭刺中馬寧兒面部的命門，終於將其殺死。洪熙官將藏寶圖合為一體並順利完成任務，五個小孩也重歸普通人的生活。
影片拍攝於香港武俠功夫電影的黃金年代，李連杰邱淑貞等一眾主演也都是顏值的巔峰，只是，我們再也看不到這樣的經典作品了。
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