帕金森病新的候選基因或被發現

帕金森病新的候選基因或被發現

一項大型帕金森病研究結果可能找到了該疾病的新遺傳途徑。來自Genentech、美國國家衰老研究所、TECNICA國際數據和23andMe的研究人員合作,為成千上萬個人進行了多階段GWAS分析和Meta分析尋找神經退行性疾病的新基因,這些人中包括帕金森病人和沒有患病的。

除了已知的幾十種與帕金森病有關的常見變異外,研究小組還發現了17個未被報道過的危險位點。9月11日,該研究結果在線發表在Nature Genetics上。

在第一研究階段,研究人員分析了來自23andMe 研究項目的6476個患有帕金森病的歐洲人的基因,以及302,042個未患帕金森病的人的基因。結果顯示,12個位點的變異在帕金森病病例中的代表性較高,包括一個新的位點和多個活躍的調控標記區域。雖然有幾個已知位點出現在分析中,但他們並沒有看到CHMP2B基因和TMEM229B 基因與變異有顯著的關係,過去曾報道這兩個基因與變異有顯著關係。

然後,研究小組對另外13708例病例和95282例對照進行了Meta分析,發現了35個與帕金森病有顯著關聯的位點。研究人員進一步對其中29個位點進行測試,測試組由5851個帕金森患者和5866個未患病的人組成。

最終,研究人員確定了17個帕金森病相關的新基因位點。有了新的風險基因位點,加上過去報道的風險位點,研究人員使用Neurocentric策略尋找候選基因,其中考慮了eQTL 數據、表達譜和神經效應相關基因。

“候選基因證實了幾個已知的帕金森病的風險基因,包括GBA,LRRK2,SNCA和MAPT。”作者寫道,“在41個帕金森病的風險位點中,共有29個位點有蛋白改變或者順式eQTL變異與SNP指數相關。”

“我們可以識別這些候選基因,通過研究基因功能的先後順序確定帕金森氏病的致病基因和可能的治療靶點。”來自Genentech的研究人員,共同資深作者Robert Graham 和Tushar Bhangale寫到。特別是,研究小組注意到,新的候選基因在溶酶體活性途徑和自噬途徑中都存在,也出現在線粒體通路中。

來源:測序中國

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