法院認定夫妻雙方分居的標準是兩個人的感情早就已經不睦，還有就是當事人必須舉證連續分居的時間已經有兩年，而且，分居最關鍵的認定標準就是兩個人已經沒有性生活，所以，就算同住在一個屋簷下，但夫妻之間已經兩年沒有性生活的也是分居。

一、人民法院如何認定夫妻分居?

(一)必須是因感情不和而分居。

夫妻分居，有客觀原因造成的、感情不和造成的、以及雙方自願協議分居的等多種情況。比如，夫妻分別在兩地工作，因相隔遙遠而沒有同居條件，或一方在外面打工無法同居的。這種夫妻分居，並不是因感情不和而造成的，即使分居的時間再長，也不符合“因感情不和而分居”的法定應准予離婚的情形。

還有的情況是，夫妻感情尚好，但由於某種原因自願實行分居。這種情況，也不符合“因感情不和而分居”的法定應准予離婚的條件。

作為應准予離婚的法定情形的分居，必須是因夫妻感情出現問題，感情不和、感情破裂、相互厭惡而造成的分居。

(二)分居必須是連續的，且已滿兩年。(不能累計)

首先，從夫妻實際分居的第二日算起，到向法院立案提起離婚訴訟時為止，時間必須滿兩年。

其次，分居必須是持續的，分居時間必須連續計算。如果分居後又同居，則應從同居後又分居的次日重新計算。不能把前後幾次分居的時間累加計算。

(三)夫妻分居的實質是互不履行夫妻性生活之義務。

對於夫妻因感情不和而“分居”的理解，不能只簡單的理解為分開居住。有些夫妻因家庭住房條件所限，並非感情不和也在分別居住。但是，這種分居並不排除夫妻之間的性生活。他們可以利用種種辦法，來滿足夫妻之間的相互需要。所以，作為法定應准予離婚的夫妻分居的實質，在於夫妻因感情不和而互不履行夫妻性生活之義務，並持續長達兩年。

(四)“夫妻分居滿兩年”須以證據證明。

二、法院判決離婚的依據是什麼?

我國現行《婚姻法》第三十二條第2款規定：“人民法院審理離婚案件，應當進行調解;如感情確已破裂，調解無效，應准予離婚。”“感情確已破裂”作為準予離婚法定條件。

因此，法院在審理離婚案件時，是根據夫妻雙方當事人的感情是否確已破裂為依據來判決離婚的。而有下列情形之一，調解無效的，應准予離婚：

(一)重婚或有配偶者與他人同居的；

(二)實施家庭暴力或虐待、遺棄家庭成員的；

(三)有賭博、吸毒等惡習屢教不改的；

(四)因感情不和分居滿二年的；

(五)其他導致夫妻感情破裂的情形。

綜上所述，導致雙方分居的原因、時間和分居的實質要件都有非常明確的規定，如何證明長達兩年沒有性生活可能是比較困難的，意思就是通過分居解除婚姻關係並不是一個特別理智的辦法，時間不僅特別長，分居期間的收入、債務很多時候也很難界定。