看到這個問題，忍不住心疼小蘭姐姐，自己的男人變成了小孩，從此二人展開了長達22年的“網戀”，雖然天天都在一起卻和沒在一起沒什麼區別，簡直想仰天大叫談個戀愛怎麼就這麼難呢！orz
不過值得慶幸的是，二人對彼此的感情還是很堅定的，再者柯南與新一本就是一人，因此有很多小習慣下意識地就會表現出來，這就讓細心的小蘭發現端倪啦！小蘭最早懷疑柯南是新一發生在TV版的第七集（我沒記錯的話orz），當時深更半夜，小蘭把柯南堵在新一家門口，劈手摘掉柯南的眼睛質問他就是新一吧，當時的柯南真的慌得一批，不知所措被水淹沒，後來還是美人老媽出來幫他解的圍，當然在未來婆婆面前小蘭自然乖巧的如一隻小白兔，這次的身份危機就這麼有驚無險地過去了。
之後柯南有好多次都被懷疑，我覺得最懸的一次，是柯南的一部劇場版，叫《世紀末的魔術師》，當時眾人經歷過危險破解了案件之後回了家，小蘭坐在窗邊眼含熱淚目光悲哀地問柯南“你就是新一，對吧？”，當時我那個心疼呀，然後就看著柯南神色凝重地緩緩摘掉眼鏡，下一秒就要親口承認了，結果什麼叫驚喜來得太突然我不敢看，基德半路殺來扮成新一的模樣轉移了小蘭的注意，成功幫助柯南解除了小蘭的嫌疑。
後來柯南大概意識到這個辦法真是棒啊，他和基德長得像就算了大家都是聰明人兒吶，時不時讓基德假扮自己掩人耳目自己就能更好地破案簡直不要太爽好伐！因此後期經常能看到基德假扮新一來來去去，由於二人同時出現的時候變多，因此小蘭慢慢減少了對柯南的懷疑。
但是小兄弟大概忘了他的妹子很想他啊，每次他出現在眾人面前最高興的莫過於小蘭姐了啊，對於柯南來說破案大過一切，所以很多時候他都會忽略小蘭的感受，讓別人假扮自己固然爽，但是一不小心把女友丟了那就gg了。
在劇場版《天空的遇難船》中，柯南日常讓基德假扮自己混上飛機，小蘭自然不會放過很難出現一次的新一，所以一直關注他，到最後塵埃落定基德覺得自己可以功成身退啦的時候卻被小蘭攔住了，當時月色正好很適合發生點什麼，我並不懂基德是怎麼想的怎麼就想和小蘭親親呢！兄弟你也是有女朋友的人啊喂！朋友妻不可欺啊！要不是柯南最後趕到阻止了這個荒唐的行為，不然女朋友都該沒了，我覺得當時的柯南可能特想和基德同歸於盡吧2333333。
你們都錯了，毛利蘭之所以不在懷疑，是因為她已經肯定了。所以就不在懷疑。
首先，不要把毛利蘭當傻妞，她智商很高的。
從遺傳學來說，她娘是英妃理，那是什麼人啊？超牛的律師，這智商和推理能力，小蘭繼承幾分就不得了。她爸是誰？小五郎，你們真當他是蠢貨就是真傻，對於他是有介紹的，以前是精英刑警，也是牛逼人物。不然英妃理能看上他。可以說他是最早洞悉柯南真實身份的人，只是一直裝傻而已。否則次次都昏，就是傻子也懷疑了。他卻從沒懷疑柯南，因為他已經肯定了，所以就順水推舟，不點破。你看每一次破案，他貌似在製造各種笑話，卻實實在在吸引了所有的注意，完美掩護柯南尋找證據。可以說和柯南配合的天衣無縫。這一點看來，小五郎的智商和心思縝密，估計新一也遜幾分。
所以有這父母優秀基因的毛利蘭可謂文武雙全，幾次懷疑。貌似在各種幫著下，完美的掩飾過去，騙到了毛利蘭。其實恰恰相反，她已經發現了柯南的真實身份。所以以後就沒有在做懷疑的事。因為她很明白，自己男友新一，突然變小孩，還有苦難言，不敢告訴自己。這期間涉及的陰謀只怕驚天。故而為了保護男友新一，她不在做任何懷疑，只是默默的守護他。這從後面劇情的蛛絲馬跡都能看的出來，她對柯南的感情有些出格。但是她的表現又沒有背叛新一。之所以漫畫顯得這樣矛盾，其實原因就是她知道柯南新一本是一人。
如果柯南真有結局，必然是和毛利蘭，一起把組織幹掉，然後小蘭道破一切。
名偵探柯南中，前期小蘭經常會通過蛛絲馬跡發現柯南和新一的關係，但是每一次都被完美化解過去了，後期基本看不到這種情節了，這是為什麼呢？
名偵探柯南中，前期小蘭經常會通過蛛絲馬跡發現柯南和新一的關係，但是每一次都被完美化解過去了，後期基本看不到這種情節了，這是為什麼呢？
個人認為有以下幾點原因：
第一，小蘭智商不在線。
如果說前期小蘭發現柯南的祕密是智商在線的表現，那麼後期可以說小蘭完全沒有智商了。某種程度上來說，小蘭是整部作品，唯一一位，智商不在線的女性角色。除了武力值，前期幾次發現柯南和新一的關係，是屈指可數的幾次高光操作。
第二，小蘭習以為常了。
小蘭前期可以說是和柯南剛接觸，發現他和新一有些類似的地方，但都被各種忽悠過去了，後期習慣了，自然也沒覺得有什麼特別的了。
第三，柯南等人掩飾的太好了。
全世界都在演小蘭系列，小蘭好不容易發現了點啥，就被各種欺騙。類似阿笠博士，新一的父母，服部，小哀等，為了欺騙小蘭無所不用其極啊，試想小蘭一個整部劇智商倒數的角色自然扛不住這麼多高智商角色的忽悠啊，於是後期就完全被矇在鼓裡了。
第二，小蘭習以為常了。
小蘭前期可以說是和柯南剛接觸，發現他和新一有些類似的地方，但都被各種忽悠過去了，後期習慣了，自然也沒覺得有什麼特別的了。
第三，柯南等人掩飾的太好了。
全世界都在演小蘭系列，小蘭好不容易發現了點啥，就被各種欺騙。類似阿笠博士，新一的父母，服部，小哀等，為了欺騙小蘭無所不用其極啊，試想小蘭一個整部劇智商倒數的角色自然扛不住這麼多高智商角色的忽悠啊，於是後期就完全被矇在鼓裡了。
第四，青山玩膩了。
這一點最實在，小蘭發現柯南身份這一點已經被青山玩膩了，用了這麼多次，不僅讀者厭煩了，青山自己也不想再用了，所以在後期基本沒有這個梗了。
以上就是我認為的，小蘭後期為什麼發現不了柯南身份的原因了，如果各位小夥伴有什麼其它間接，請在評論區留言。
《名偵探柯南》早期毛利蘭經常懷疑柯南，後期很少再懷疑的原因有幾個方面：
首先是這種劇情過度重複，都是從一些細微的事讓小蘭察覺柯南很可疑，又或者是跟消失已久的新一很相似，但最後又能被柯南化解這種懷疑危機，在早期這種橋段確實很有意思，但隨著故事推進，各種佐證柯南身份的人物出現，柯南的媽媽江戶川文代現身、工藤有希子的否認等，都能證明柯南是獨立的一個人，所以再弄這種懷疑橋段就會矛盾。
其次，在早期毛利蘭經常懷疑柯南，畢竟新一剛消失，而聰明的柯南又出現，小蘭會認為新一和柯南之間有什麼聯繫，靠糊弄過去還是沒有問題。但實際上到了《危險的復活 生死一瞬間》，毛利蘭已經看到工藤新一和柯南一同出現在自己面前時，小蘭是沒有任何再懷疑柯南的理由，所以這種後期不怎麼出現這種橋段。
從這兩方面看，這種橋段確實沒有必要再出現，再玩的話不僅前後矛盾，反而會讓觀眾覺得小蘭智商有問題。
謝謝邀請。
emmm，關於這個事情，其實挺簡單的...小蘭前期懷疑了那麼多次，都被各種解決了肯定是懷疑不動了啊。
想想啊，到底有幾個情況。
首先是，舞會：白乾救場，我記得好像小哀打扮成了柯南的樣子吧。
這個兩人同框，這就很尷尬了。
不過小蘭沒發現小哀，這也很奇怪。
其次是基德扮新一：
這裡好像是向日葵什麼的~反正不止一次吧，基德總是扮成新一的樣子，也間接幫了柯南很多次啊。
平次扮新一：
這個好像是佛像的事件，平次打扮成新一，也算是一種幫忙了吧。
咳咳，其他時候，類似變聲器，有一個整容的，新一父母的證詞~
都在幫柯南，小蘭經歷了這麼多，再天天懷疑柯南，恐怕就不正常了吧...
是不？你覺得呢？
劇情發展到一千集，你覺得小蘭再去糾結柯南的身份 還有觀眾嗎？
因為問題已經“解決”了啊，新一不是柯南。眼見為實他們同時出現過了還有什麼好懷疑的。
因為問題已經“解決”了啊，新一不是柯南。眼見為實他們同時出現過了還有什麼好懷疑的。
毛利蘭早期懷疑柯南身份，很多原因是柯南的原作者包括導演都沒預料到柯南會被人如此的喜歡。
再說了，毛利蘭是柯南系列裡從頭傻到尾的人。後來柯南的劇情豐富了，黑衣組織，FBI,CIA全都來，也沒什麼時間讓小蘭再疑神疑鬼了。
畢竟誰能想到，柯南的故事能發展了這麼多年，裡頭人物的關係都錯綜複雜了，唯一沒變的就是小蘭的智商。
不請自來：
因為毛利蘭經過多次懷疑和被欺騙後。基本已經排除了柯南=新一的可能。
但在柯南中真實身份不能暴露給他人知道不然有可能會招到黑衣組織滅口的設定感覺就十分牽強。作為最大黑幕的黑衣組織如果哪天發覺柯南就是新一，那為了排除柯南，像毛利小五郎和蘭，阿笠博士這樣天天和柯南一起的人必然會被清理掉，不管柯南有沒有吐露自己身份，畢竟作為黑衣，我為啥管你知不知道，一起滅了就好。別說怕鬧大，開武裝直升機炸樓都不怕，滅口擔心啥。
沒有早期後期，柯南的世界總共才過了不到一年時間
