印巴分治是造成印巴衝突的直接原因，但不是根本原因。
1947年印巴分治以後，根據《蒙巴頓方案》，各個地區根據宗教信仰人口情況自主選擇加入印度，還是巴基斯坦。但是克什米爾地區位於印度和巴基斯坦之間，當地人口77%信仰伊斯蘭教，但是土邦王公卻是一個印度教徒，當時猶豫不決加入哪一方。而當地穆斯林爆發起義，土邦王公向印度尋求幫助，傾向於加入印度，導致印度軍事介入，隨後巴基斯坦也軍事介入，進而引發印巴兩國對克什米爾長期的爭奪。
當初印巴為何分治，用一句話來概括就是，一幫信仰伊斯蘭教的印度人不想留在印度內，所以才謀求獨立建立巴基斯坦。穆斯林教徒為何不願留在印度呢，因為穆斯林在整個英屬印度佔少數，留在印度內擔心會受到不公正的對待，所以才決定建立一個由全部穆斯林組成的國家。
在印巴分別建國以後，不管是印度，還是巴基斯坦，都想獲得更多的地盤和人口來壯大自己的實力，當時各個地區根據宗教信仰人口的多少選擇加入一方。畢竟信仰伊斯蘭教的人佔少數，所以加入巴基斯坦的邦比較少，主要是穆斯林化比較徹底的印度西部地區和孟加拉地區，所以巴基斯坦也迫切需要擴大自己的地盤。
而對於印度來說，雖然南亞大陸稱為印度，但是歷史上並未實現過真正的統一，在印巴分治以前，以甘地為首的印度國大黨就謀求實現整個印度大陸的統一。作為國大黨的領導人，甘地力主推動整個印度的統一，為了實現印度整體統一，甘地同全印穆斯林聯盟領導人真納進行了14次會談，但是真納去意已決，最終雙方未談攏，這才有了後來的印巴分治。
印巴為何一定要分治呢？不分行不行？
首先，印度國大黨和全印穆斯林聯盟這兩個英屬印度最大的政治勢力在共同建國上未達成一致，從政治上已經分裂，這使印度統一的夢想破裂。
其次，在整個英屬印度範圍內，由於印巴分治的分界線是由一名完全不瞭解英屬印度實際情況的英國律師花了兩個月時間閉門造成畫出來的，這導致很多地區的印度教徒和穆斯林發生衝突。尤其是英屬印度西部的旁遮普地區被認為地劃分為旁遮普省和旁遮普邦，東部的孟加拉地區被人為地劃分為東巴基斯坦和孟加拉邦，這導致被劃為印度地區的穆斯林大量逃亡到巴基斯坦，被劃為巴基斯坦地區的印度教徒和錫克教徒大量逃亡到印度，引發巨大的混亂和衝突。而且有政治勢力在煽動推動印巴分治，如果不分，印度將面臨長期的內戰衝突，所以不得不分。
印度在獨立以後，首先從領土上推動印度的統一，這就包括搶佔克什米爾的土地、收復葡屬印度和法屬印度領土、佔領安達曼群島和尼科巴群島、吞併錫金王國、佔領藏南領土，這才使印度有了298萬平方公里的土地。印度甚至對周邊小國使用羈縻之策，使他們與印度捆綁，即使名義上不屬於印度，但是實際上卻不得不唯印度馬首是瞻。
所以，印巴分治是導致印巴衝突的直接原因，但是印巴衝突的根本原因在於印巴分治以後，雙方都想通過擴張領土來壯大自己，而印度更是想推動整個南亞大陸的統一，這使雙方的矛盾不可調和。印度獨立後採取了一系列領土擴張政策，以及近期印度大力發展軍事力量，謀求加入聯合國安理會常任理事國，擴大自己在世界上的影響力和話語權，這都證明印度有著一顆勃勃雄心。如果有一天印度有整合南亞的實力了，不排除印度還會推動整個南亞的統一。
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