孝惠章皇后，博爾濟吉特氏，生於清崇德六年十月初三日，為科爾沁貝勒綽爾濟之女。清世祖順治帝的第二任皇后，出身滿珠習禮家族。
順治十年八月，順治堅持將第一任皇后博爾濟吉特氏廢為靜妃，而廢后為科爾沁左翼吳克善之女，孝惠章與廢后同出一族，為廢后博爾濟吉特氏的侄女，二人自小便有交往的情誼。
順治十一年五月，在順治帝第一任皇后被廢之後，14歲的孝惠章作為滿珠習禮的孫女被選入宮，初封為妃，與其妹博爾濟吉特氏，一同侍奉順治。同年六月，孝惠章是孝莊太后的侄孫女被孝莊指定為後，最後被順治冊為皇后，孝惠章與廢后同出一脈，在性格上二人多有相似，本來就不滿再次立博爾濟吉特氏一族為後的順治，對這個第二任皇后本就不喜。而孝惠章作為科爾沁大草原上的女子，性格自然也高傲，既然不得順治的喜歡，再者因為廢后對順治帝的偏見，便也不強求順治的寵愛，因而二人感情並不和睦。而之後董鄂妃的進宮，更是催化了兩者的矛盾。
順治十三年八月，歷史上著名的董鄂氏入宮，被順治冊為賢妃，順治極為喜愛這位溫婉可人的江南女子，對其愛惜珍重無比，不過四個月時間，在同年十二月，順治就晉封董鄂為皇貴妃，如此超常規的寵愛晉封也沒有制止住順治的愛惜之情，甚至順治想要再次廢了孝惠章改立董鄂氏為後。
順治十五年正月，順治以太后身體不適為由，斥責孝惠章禮節疏漏，統攝後宮不力，將中宮箋錶停用，之後更是召集王公大臣討論廢后的事；同年三月，孝莊太后下旨，順治廢后的事才沒有成功。因為此事，孝惠章自然對順治更為埋怨，而順治更是與孝惠章撕破了臉，帝后關係更為惡劣。
順治十七年八月，董鄂妃病逝，順治將其追尊為孝獻皇后，廢后之事才算是告一段落。
在順治十八年，順治逝世，康熙帝繼位後，將孝惠章與康熙的生母孝康章皇后兩宮並尊，稱母后皇太后，上徽號為仁憲皇太后。
康熙二年，康熙生母孝康章皇后去世，在康熙二十六年，孝莊文皇后也溘然長逝，在後宮中便只有孝惠章一個太后，在孝莊太后去世之前，康熙帝雖然對嫡母孝惠章晨昏定省，但二人關係並不融洽，直到孝莊太后去世時，康熙和孝惠章悲慟無比，孝惠章悲傷過度臥床不起，而康熙割了自己的辮子來表達自己對孝莊的思念，也正因為二人同病相憐，便有了更進一步接觸。
康熙二十八年，寧壽新宮剛剛建成，康熙便親自帶著大臣請孝惠章入住。
康熙三十五年，在孝康章大壽時，因為康熙正恰逢北巡，便專門奉上家書為孝惠章祝壽，孝惠章遣送衣裘，康熙同時也送回水果乾等土產，令總管太監請孝惠章嚐鮮。康熙三十八年，康熙帝南巡，孝康章亦同行。在孝康章六十、七十大壽，康熙親自賦詩祝壽。
據《康熙帝家訓格言》記載，在康熙五十二年，孝惠章的妹妹淑惠太妃去世，當時孝惠章意識到自己年老，便說自己："牙齒動搖，其已脫落者，則痛止，其未脫落者，痛難忍"，康熙則回道"太后聖壽已逾七旬，孫及曾孫殆及百餘，且太后之孫，皆已鬚髮將白而牙齒將落矣，何況祖母享如此高年。我朝先輩，常言老人牙齒脫落，於子孫有益，此正太后慈闈福澤綿長之嘉兆也"，太后便笑道"皇帝此語，凡我老嫗輩，皆當聞之而生歡喜也!" 由此看見康熙對孝惠章的尊敬與敬愛。
康熙五十六年十二月，孝惠章病重性命垂危，康熙也因為廢太子的事心力交瘁，頭暈目眩足部腫大不能走路，康熙聽聞消息將腳裹上帕子仍然親自去為孝惠章侍奉湯藥。在孝惠章彌留之際，康熙跪在她床邊，捧著孝惠章的手呼喊："母后，臣在此"，孝惠章才睜開眼睛，她不能說話，只能默默看著康熙，未幾，孝惠章便去世了，康熙嚎啕大哭，以割辮之禮來以盡哀思，其悲痛絲毫不少於孝莊去世之時。
在孝康章死後，康熙將孝康章的神主位於康熙生母孝康章之上。在康熙年間，大約是因康熙顧慮孝惠章的原因，在孝獻即董鄂氏的生辰祭日從未派遣官員去祭陵。
孝惠章經過雍正，乾隆累加諡，諡號全稱為：孝惠仁憲端懿慈淑恭安純德順天翼聖章皇后。