生物有機肥的生產原料：
1、農業廢棄物：比如秸稈、豆粕、棉粕等。
2、畜禽糞便：比如雞糞、牛羊馬糞、兔糞；
3、工業廢棄物：比如酒糟、醋糟、木薯渣、糖渣、糠醛渣等；
4、生活垃圾：比如餐廚垃圾等；
5、城市汙泥：比如河道淤泥、下水道淤泥等。
施用微生物菌肥應注意以下幾個方面：
因地制宜 對含硫高的土壤和鏽水田，不宜施用生物菌肥，因為硫能殺死生物菌。對於翻漿的水田，一般不用撒施，用噴霧的方法效果更明顯。
因溫制宜 施用菌肥的最佳溫度是25℃～37℃，低於5℃，高於45℃，施用效果較差。對高溫、低溫、乾旱條件下的農作物田塊不宜施用。同時還應掌握固氮菌最適宜土壤的含水量是60％～70％。
因混制宜 應注意，不應將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥（如硫酸鉀等）以及稻草灰混合用，因為這些藥、肥很容易殺死生物菌。或者先施菌肥，隔48小時後，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。還應防止與未腐熟的農家肥混肥。
因量制宜 對於多年來施用化肥的田塊，施用生物菌肥時不能大量減施化肥和有機肥，因農作物對化肥產生了依賴性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子適應，因此，其取代量應做到第一、第二、第三年分別取代30％、40％和60％，磷、鉀肥只能補足，不能減少。
因時制宜 生物菌肥不是速效肥，在作物的營養臨界期和營養大量吸收期前7～10天施用，效果最佳。
生物有機肥可用於拌種、浸種、蘸根、做底肥、追肥，溝施或穴施。生物有機肥的施用方法比化肥、有機肥要嚴格，因此要注意：
一是避免開袋後長期不用。肥料買回家後儘快施到地裡，開袋後儘量一次用完。包裝袋打開後其它細菌就可能浸入袋內，使微生物菌群發生改變，影響其使用效果。二是避免在高溫乾旱條件下使用。高溫和乾旱會影響微生物菌群的生存和繁殖，不能使肥料發揮其良好的作用。三是避免與未腐熟的農家肥或過酸鹼的肥料混合使用。這兩種肥料會因為溫度或酸鹼度而影響微生物肥料的正常發揮。四是避免與農藥同時使用。化學農藥都會不同程度的抑制微生物的生長和繁殖，甚至殺死微生物。
對於生物有機肥，小編推薦使用沐農牌奇田大盛生物有機肥，營養均衡全面，保證植物生長所需的各種養分，可促進作物根系發達，加速養分吸收，增強作物抗旱澇、抗逆、抗倒伏能力，比使用傳統肥料增產20%左右。才外還有降解土壤中殘留化肥、農藥的功效。