朱棣進攻濟南，被此人幾番羞辱，即位後惱羞成怒，將其凌遲烹炸

1398年，朱元璋駕崩，因太子朱標早於朱元璋去世，帝位傳給了朱標的次子朱允炆（朱標長子也早逝），是為建文帝。

建文帝繼位後感到自己受了威脅，就削廢諸藩，將五個叔叔降為庶人。遠在北平的燕王朱棣不等被人收拾，憑藉多年苦心經營的兵力和謀略，決意起兵殺出北平。名義是剷除皇帝身邊奸臣，為國消除災難。

建文二年(1400)，燕王朱棣發動“靖難之役”，叛軍兵臨濟南城下，朱棣令人用箭將一封勸降書射進城內，鐵鉉見信後隨即效仿此法回信一封。朱棣打開一看，見是《周公輔成王論》一文，明白鐵鉉是在勸自己效法周公，忠心輔佐建文帝。朱棣大怒，命強攻濟南。鐵鉉用計誘朱棣大軍入城，若非朱棣換馬急返，否則難逃一死。同年，鐵鉉配合盛庸在東昌(今聊城)大敗朱棣。從此南伐不敢再取道濟南。

建文四年（1402年），燕軍繞過濟南，最終攻佔京師，建文帝下落不明，朱棣自立為帝，改年號永樂。鐵鉉聞之，幾次欲自殺，被勸止，帶殘兵駐淮南以圖復興。朱棣即位後，回兵北上覆攻濟南，鐵鉉死守不肯投降，但終因寡不敵眾，兵敗後被擒。

朱棣親自審問，朱棣要鐵鉉面北而跪、俯首認罪並投降，鐵鉉背朝朱棣、昂首挺胸並大罵，朱棣惱羞成怒，下令將鐵鉉凌遲處死，並投油鍋烹炸，屍骨也不許收葬。行刑時，鐵鉉仍連聲大罵朱棣。

鐵鉉遇害後，其父母被髮配到海南，他長子充軍，次子做了官奴，後來被虐待而死。35歲的妻子楊氏和僅四歲的女兒也被籍沒為奴，淪為樂戶發配到當時的官營妓-院為妓。

鐵鉉竭盡職守、剛烈如鐵的不屈精神深受後人敬佩，他們尊稱其為“鐵公”，並在大明湖畔專門修建鐵公祠以茲紀念。在山東各地，有許多“鐵公”祠廟，都是祭奉鐵鉉，濟南人民更視其為鄉土神或城隍爺。