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宮野厚司
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組織的科學家，死亡故事為口傳
至今未正面登場。黑衣組織中神祕的科學家，宮野明美、宮野志保（即灰原哀）的父親，在科學界以遭驅逐的“瘋狂科學家”而聞名。
和妻子宮野艾蓮娜一起進行藥物研究。在志保出生後不久便與妻子一同“意外死亡”。
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宮野明美
化名廣田雅美
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外表為銀行職員，實際上為黑衣組織成員，宮野志保（即灰原哀）的姐姐，FBI搜查官赤井秀一的前女友。為了和妹妹一起脫離黑衣組織，化名為廣田雅美，
完成了組織交給的搶劫十億日元的任務，後被琴酒槍殺。臨死前柯南對其告知了自己的真實身份。
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卡爾瓦多斯
Calvados
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黑衣組織中的狙擊手。持各種武器，最喜歡用霰彈槍和來福槍。因迷戀貝爾摩德而參與到貝爾摩德與FBI的對決中，被赤井秀一打斷雙腿，在被帶走調查前自殺身亡。
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朗姆 Rum
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黑衣組織的二號人物。朗姆某隻眼睛在事故中受傷，所以裝的是義眼。其餘具體情況不明。
9/22
龍舌蘭
Tequila
10/22
黑衣組織成員，在一次和滿天堂公司職員交易的時候因拿錯箱子而被誤炸身亡。
11/22
楠田陸道
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黑衣組織基層成員，為了尋找失蹤的基爾而被組織安排裝病住進杯戶中央醫院進行祕密調查的眼線。被FBI發現後駕車逃亡，發覺追蹤者是赤井秀一後舉槍自殺。
13/22
琴酒
Gin
14/22
經常和伏特加一起出現。身穿黑色風衣，銀色（早期為金色）長髮，臉總被帽子和劉海半遮掩著，左撇子。
冷酷殘忍，頭腦冷靜，眼神冷厲，似乎可以毫不猶豫地殺死任何人。 經常執行各種暗殺和清除組織內奸的任務，
是給工藤新一灌下APTX4869使其身體變小的罪魁禍首，亦是柯南所面對的主要敵人之一。
15/22
伊森·本堂
CIA的臥底
16/22
是本堂瑛海（化名水無憐奈）和本堂瑛祐的親生父親，同為CIA（美國中央情報局）的諜報員，後潛入黑衣組織進行臥底調查工作，於四年前為掩護同是黑衣組織臥底女兒基爾的身份自殺身亡。
17/22
蘇格蘭威士忌
Scotch，日本公安警察的臥底
18/22
他與安室透同為日本公安警察派入黑衣組織的臥底，真名未知，蘇格蘭是其在組織中的代號。因公安身份暴露，已自殺殉職。
19/22
伊森·本堂
CIA的臥底
20/22
是本堂瑛海（化名水無憐奈）和本堂瑛祐的親生父親，同為CIA（美國中央情報局）的諜報員，後潛入黑衣組織進行臥底調查工作，於四年前為掩護同是黑衣組織臥底女兒基爾的身份自殺身亡。
21/22
沼淵己一郎
被捕
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連續殺人犯，原黑衣組織成員。身體素質非常好，因此被組織作為殺手培養，但是他達不到預期的培養效用，
就被送到宮野志保（雪莉）處做實驗對象。後來在做人體實驗前逃跑，並製造了一系列的連環殺人案。已被捕並判處死刑。
