朮赤的來歷一直都存在疑問，這在朮赤生前就一直存在。不僅是他的弟弟察合臺當面用這個罵他，他自己也是清楚的知道的。
其實成吉思汗本人也是清楚這一點的。朮赤的名字是從蒙古語音譯過來的，而這個名字在蒙古語中的意思就是客人。既然是客人，也就意味著，成吉思汗也懷疑朮赤的來歷。
成吉思汗九歲的時候，他父親也速該就給他訂了娃娃親，也就是朮赤的母親，弘吉剌部首領的女兒孛兒帖。訂完親，也速該在返回本部落的時候被殺，成吉思汗留在岳父家裡，得以活下來。
到成吉思汗十六歲的時候，正式和孛兒帖成親。但只過了一個月左右，因為也速該以前曾經搶過相鄰的蔑兒乞部的親，所以蔑兒乞部一直存心報復，這次就突然進攻成吉思汗的部落。成吉思汗落荒而逃，扔下了孛兒帖，被蔑兒乞部搶走了。
之後，成吉思汗和他父親也速該的安達王汗和他自己的安達札木合的幫助下，連兵進攻蔑兒乞部，擊敗了蔑兒乞部，又奪回了孛兒帖。
等到孛兒帖重新回到成吉思汗身邊的時候，和被搶走已經隔了九個月左右的時間。回來不久，就生下了朮赤。
其實這種搶親的行為在當時的蒙古各部落之間是普遍存在的，所以大家都不是特別在意這些問題。成吉思汗的大量妻妾中，就有許多是被他擊敗了的敵人的妻妾，作為戰利品被他納為妻妾。
關於孛兒帖在蔑兒乞部這段時期的生活，沒有特別明確的記載，一般的說法都是她得到了脫阿黑臣精心的保護，並沒有被其他人強佔。但這基本上都是後來的成吉思汗後人的記錄所說的，是否存在為尊者諱和遮醜的情況，也不好說。
不過，成吉思汗在遭到攻擊的時候自己落荒而逃，他的母親月倫也逃走了，其他兄弟也都逃走了，只有孛兒帖無人照看，成了蔑兒乞部的俘虜和戰利品。因此，成吉思汗對孛兒帖一直是心存愧疚的。
也是因此。雖然孛兒帖在被俘的這段時間的生活狀態不太清楚，朮赤的來歷也不清楚，但成吉思汗並沒有過分追究這個問題，反而又和孛兒帖接連生下了察合臺、窩闊臺和拖雷三個兒子。
而且，雖然成吉思汗後來的老婆多大四十四個，但孛兒帖的長妻身份始終非常穩固，哪怕是後來成吉思汗非常寵幸也遂姐妹，孛兒帖的地位也沒有動搖過。
最重要的則是，除了孛兒帖生的四個兒子之外，成吉思汗和其他的妻妾其實也生了兒子，但成吉思汗比較重視而且賜予封地的，只有這四個兒子，其他兒子留下的記錄非常少。蒙古帝國和四大汗國的帝系也始終都在這四個兒子的後裔中產生。
正是因為朮赤來歷存疑，所以，成吉思汗在考慮繼承人的時候，朮赤自己其實也是知道自己沒有希望的。老二察合臺也是以這個理由攻擊朮赤，把朮赤排除出去了。但朮赤也攻擊了察合臺，最後是兩人都被放棄，窩闊臺被確立為汗位繼承人。
朮赤本人也因此而因禍得福。後來，他受命率軍西征，他的兒子拔都又繼續受命西征，最終建立了金帳汗國，今天的俄羅斯和東歐的相當一部分，基本上都在金帳汗國的統治之下。而在拔都的時代，拔都也是以成吉思汗的長孫自居的，其他人都沒有提出什麼反對意見。