北京市疾病預防控制中心免疫預防所前身可追溯至上世紀80年代的北京市衛生防疫站流行病科計劃免疫組、計劃免疫科，2006年6月正式更名為北京市疾控中心免疫預防所。目前主要承擔全市兒童計劃免疫疫苗的預防接種技術指導、接種率監測等任務，在消滅天花、維持無脊髓灰質炎等重大事件中發揮了重要作用。
目前免疫預防所設有疾病監測、免疫服務、實驗室檢測等專業技術組，現有正式職工38人，博士10人、碩士23人，高級職稱專業人員14人。免疫預防所成立十餘年來，在中心的領導下，在相關部門的大力支持下，全體職工團結協作，甘於奉獻，銳意進取，開拓創新。在疫苗可預防疾病監測與控制、預防接種技術平臺建設、疫苗安全性監測與評價、預防接種政策制定、適宜技術應用與推廣等方面發揮了重要的作用。
北京市疾病預防控制中心免疫預防所前身可追溯至上世紀80年代的北京市衛生防疫站流行病科計劃免疫組、計劃免疫科，2006年6月正式更名為北京市疾控中心免疫預防所。目前主要承擔全市兒童計劃免疫疫苗的預防接種技術指導、接種率監測等任務，在消滅天花、維持無脊髓灰質炎等重大事件中發揮了重要作用。
目前免疫預防所設有疾病監測、免疫服務、實驗室檢測等專業技術組，現有正式職工38人，博士10人、碩士23人，高級職稱專業人員14人。免疫預防所成立十餘年來，在中心的領導下，在相關部門的大力支持下，全體職工團結協作，甘於奉獻，銳意進取，開拓創新。在疫苗可預防疾病監測與控制、預防接種技術平臺建設、疫苗安全性監測與評價、預防接種政策制定、適宜技術應用與推廣等方面發揮了重要的作用。
免疫預防所目前每年承擔常規免疫規劃疫苗預防接種和應急接種超過1000萬人次的管理和技術指導工作，預防接種工作的開展，不僅有效地保護了市民的健康，也大大降低了我市傳染病的發病率，提高了本市居民的期望壽命。截至2016年底，北京市已連續32年無脊髓灰質炎野病毒病例發生，連續20年無白喉病例發生，麻疹、百日咳、新生兒破傷風、乙腦、流腦等疾病的發病率、死亡率均已降到歷史最低水平，調查顯示，北京市全人群的乙肝表面抗原流行率已經由1992年的6.03%下降到了目前的2.73%，其中25歲以下兒童降至1%以下。
此外，免疫預防所還大力推動流動人群免疫預防接種工作，截止2016年，北京市已連續18年在學齡前流動兒童中開展預防接種強化查漏補種工作；連續14年在外來務工人員中開展麻疹、流腦疫苗的預防接種工作，這些工作有力的保障了外來務工人員及其子女的身體健康，對有效維護首都公共衛生安全，起到了極大的推動作用。
近年來免疫預防所還在科研工作和管理工作上取得了豐碩成果；其中“北京市免疫規劃信息管理系統”項目，榮獲了“2009年信息北京十大應用成果（第二名）”，受到中共北京市委宣傳部、北京市科委的表彰；北京市乙肝、流感、脊髓灰質炎、水痘等多個科研成果分別獲得北京市和國家的科技成果進步獎。
十餘年積澱出的豐碩成果，也磨礪出了一支科研水平高、業務能力強的專業技術人員團隊。展望未來，免疫預防所已站在了新的歷史起點上，未來將會在“促進首都人民健康”的征途中取得更大的成績。
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