1、海賊王，黑鬍子海賊團
海賊王中每一個海賊團都可以算作是一個組織，其中能稱之為黑暗組織的也有很多，比如多弗朗明哥家族，但是這些家族除了boss刻畫的比較突出之外其他人刻畫的較薄弱，實力也較差，所以這裡就列舉黑鬍子海賊團吧，作為路飛最後對打的敵人，黑鬍子海賊團絕對夠黑，船員們的穿著也大多帶點黑色，並且他們大多都是從海底大監獄第6層下面出來的窮凶極惡之徒，乾的事也夠黑，第一當之無愧。
2、火影忍者，曉組織
火影中最強大的組織，起初是彌彥、小南、和長門共同創立的組織，成立之初的目的是為了給自己的國家帶來和平。
在彌彥被團藏和半藏合謀害死後，長門轉而黑化，最後被帶土利用作為收集尾獸的工具，團員由各個忍村的叛忍組成，實力強悍，擁有能夠攻打任何一個忍村的實力，
團隊成員多死於木葉忍者之手，可惜了小南女神。
3、全職獵人，幻影旅團
獵人中的黑暗團體，成員大多出自流星界，世界著名的盜竊團體，為了奪取想要的東西可以大開殺戒，曾經虐殺窟盧塔族，奪走他們的眼睛，致使酷拉皮卡成為窟盧塔族唯一倖存的人。
酷拉皮卡發誓要找他們報仇併成功殺死了窩金，間接搞死了派克諾妲並讓團長失去能力，雖然團長後面恢復了能力，但在與西索的決鬥中激怒了他，致使庫嗶和俠客被殺，並表示今後無論在任何地方，任何地點見到團員就立刻開打，惹怒了西索這個戰鬥狂變態和酷拉皮卡這個為了報仇不惜一切代價的人，團員們的未來堪憂啊！
只希望瑪琪女神能活到最後。
4、死神、破面軍團
藍染為了進入靈王宮攻殺死靈王用大虛製造出來的破面，實力強悍，但是在與護庭十三隊的戰鬥中幾乎全部覆滅，結果藍染暴怒之下一刀砍了最後還有點戰鬥力的蒂雅·赫麗貝爾，並裝腔道：“辛辛苦苦找來的十刃比我一個人還要低劣”十刃中對烏爾奇奧拉的印象比較深刻之外，其他人的名字一直都沒有記住。
3、家庭教師，密魯菲奧雷家族
傑索家族和基里奧內羅家族合併而成，印象太薄弱了，就知道這個組織的存在，具體要幹什麼，完全不清楚 ，除了白蘭之外換一堆人好像也沒什麼差別。
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