木谷先生因為身體原因，在職業生涯後期參加大賽次數有限，不過他開設的木穀道場蒸蒸日上，弟子們紛紛嶄露頭角，成為日本棋界的生力軍，日後更是湧現出大竹英雄、石田芳夫、加藤正夫、武宮正樹、小林光一、趙治勳、小林覺等頂級棋士，雄霸日本圍棋界，寫下後人難以超越的奇蹟。
木谷先生開設木穀道場時只有28歲，他愛才如命，不論在哪裡，只要發現學棋的好苗子，就想帶回道場收為內弟子。木穀道場早期學員有加田克司、巖田達明、大平修三等人，日後都成就不凡。其中加田克司、大平修三與另一位青年才俊加納嘉德曾並稱“戰後派新三巨霸”。尤其大平修三曾五奪日本棋院選手權戰桂冠，被譽為“日本棋院選手權戰之男”。
因為年齡等因素，木谷先生與日後成長為超一流棋士的幾位最著名弟子正式比賽交手紀錄甚少，和早期弟子的直接抗衡也不多見。在這些對局中，弟子們展現各種風格，顯示出木谷門下百花齊放的風采。
1963年的第11期日本棋院選手權戰上，木谷先生與大平修三狹路相逢，這難得的師徒大戰令棋界矚目。
日本第11期日本棋院選手權戰八強戰
木谷實執黑中盤勝大平修三
對局日期：1963年9月1日
日本棋院選手權戰是阪田榮男的固有領地，他在總共22期賽事中12次奪冠，第二期到第八期達成七連霸，其中第五期挑戰賽就是2比0擊退木谷實。大平修三在第十三期挑戰賽上3比1力挫阪田，隨後達成四連霸，共五期稱雄，在這項賽事中戰績僅次於阪田。
阪田在第九期衛冕戰上0比3不敵高川格，次年高川擊敗山部俊郎蟬聯冠軍。第十一期的挑戰權之爭異常激烈。木谷實淘汰宮下秀洋、大平修三擊敗梶原武雄，師徒二人於八強戰上會面。
第一譜 1-50
本局木谷先生執黑先行，當時日本棋院選手權戰黑貼4目半。
黑5單關守角在木谷先生的對局中並不多見，大平以小目和三三抗衡，似乎會是爭奪實地的格局。
左上和右下都是木谷先生愛用的定式，進行到黑23，雙方都非常平穩。
白24刺想便宜一下，黑25託反擊，木谷先生對實地非常敏銳。
白36尖時，黑取角轉換，白46虎住，當無不滿。
第二譜 1-50（即51-100）
黑1堅實無比，木谷先生面對徒弟仍穩紮穩打。
大平白6以下擴張中腹，看起來是白棋開闊的局面。
黑11絕不冒進，木谷先生的厚重體現在各個技術領域。
白26後，白棋中腹甚大，黑棋的邊角實空足夠抗衡嗎？
黑27刺，白28脫先長在上邊，也體現了大平的自信。
黑33手筋。
白40斷時，黑41頑強取空。
黑棋雖然氣緊，但白棋並無嚴厲手段，大平選擇封鎖外圍。
第三譜 1-50（即101-150）
黑1衝下兩子實地很大。
白10吃兩子同樣不小。
黑15刺手筋，白16照顧中腹。
到黑29斷吃一子，木谷先生小刀割肉般壓縮著白棋邊空並增加自身實地。
黑31以下厚實定型，白棋腹空雖然驚人，但黑棋各處實地也很醒目，此時是白棋稍好的細棋格局。
黑45、47是官子手筋。
第四譜 1-50（即151-200）
白6逆收，大。
黑13衝時，白14脫先打吃也是一手大棋。
黑15、17先手破目，然後19粘回。
雙方官子均緊湊。
黑43扳時，白棋還是應該擋住再走45位，白棋可望小勝。
實戰大平是覺得自己劫材豐富嗎？
第五譜 1-23（即201-223）
白4撲劫沒有必要，此時把下邊3目收住，白棋還是微優。
大平失去冷靜，黑17提劫時，白棋應該粘上，仍可獲勝。
白18找劫，黑19不理，繼續提劫，木谷先生抓住勝機！
白棋如果提掉右上轉換，黑棋可以繼續打吃兩子，白棋劫材不足只得退讓，黑棋將反敗為勝。
白20找上邊的劫材，但黑23在左邊也有劫材，白棋無論放棄左邊還是下邊都是敗局。
看清變化的大平修三黯然投子。
木谷先生最後時刻敏銳抓住對手的失誤，贏得這場師徒大戰的勝利，可惜在本賽四強戰上不敵島村俊宏，未能再進一步。阪田榮男在挑戰者決定戰上擊敗島村，並於挑戰賽五番勝負上3比0擊沉高川格，重返日本棋院選手權戰寶座。兩年後大平修三越眾而出，挑落阪田，完成了恩師的夙願。
木谷先生的獨特棋風，門下弟子無人能夠完全繼承，但弟子們各有千秋，宇宙流、地鐵流、攻殺流等流光溢彩，這是木谷先生教育的巨大成就。能夠教出如此眾多風格迥異的弟子，不知後來者還能有誰……
1975年12月19日午夜，木谷先生與世長辭，他駕鶴而去之前一刻，最後一位內弟子園田泰隆正式入段趕來送別，木谷先生無憾離開。
木谷先生的名局系列暫時告一段落，但先生風骨永留人間。
木谷實執黑223手中盤勝大平修三
木谷先生指導少年時期的佐藤昌晴