2009年至2016年期間，馮軍以打麻將“假賭”方式收受管理服務對象所送禮金224萬元；2007年至2018年期間，馮軍利用職務便利，為他人在承攬工程項目等方面提供幫助，收受他人以賭博形式和賭博“鋪底”名義所送現金454萬元；另，馮軍主動交代，本人還以打麻將“假賭”方式收受管理服務對象所送錢款336萬元，願上交組織。此外，馮軍還存在其他嚴重違紀違法問題。
2019年1月24日，馮軍受到開除黨籍、開除公職處分，並收繳其違紀所得。涉嫌違法犯罪問題移送司法機關依法處理。