之江大學
之江大學是美北長老會和美南長老會在中國杭州聯合創辦的一所教會大學。1951年被浙江省文教廳接管，美籍教員離校回國。前身為1845年於寧波創立的崇信義塾。1952年因中國高校院系調整解散，院系拆分至浙江師範學院、浙江大學、復旦大學等，之江大學宣告結束。
教會大學在中國教育近代化過程中起著某種程度的示範與導向作用。因為它在體制、機構、計劃、課程、方法乃至規章制度諸多方面，更為直接地引進西方近代教育模式，從而在教育界和社會上產生頗為深刻的影響。它為中國高等教育作出了不可磨滅的貢獻。
聖約翰大學
聖約翰大學誕生於1879年，初名聖約翰書院。1881年開始完全用英語教學，是中國首座全英語授課的學校。1892年起正式開設大學課程，1905年升格為大學，是中國第一所現代高等教會學府。
聖約翰大學是當時上海乃至全中國最優秀的大學之一。聖約翰大學享有“東方哈佛”、“外交人才的養成所”等盛名，更是培育出了顧維鈞、宋子文、顏福慶、嚴家淦、劉鴻生、林語堂、潘序倫、鄒韜奮、榮毅仁、經叔平、貝聿銘、張愛玲、周有光等一大批聲名顯赫的校友，成為中國教育史上的傳奇。
1952年院系調整，聖約翰大學停辦，其院系分別併入華東師範大學、復旦大學、同濟大學、交通大學、上海第二醫學院、上海財政經濟學院、華東政法學院，校址劃歸華東政法學院。
震旦大學
震旦大學，原名震旦學院，1928年改稱震旦大學，為中國近代著名高校。震旦由中國神父馬相伯於1903年2月27日在徐家彙天文臺舊址創辦，後遷址盧家灣。“震旦”一詞出自梵文，意即中國，在英語中，亦有黎明、曙光的含義。由此可見，馬相伯將震旦學院喻作旭日東昇，擔負著以教育開啟中國曙光的重任，必將前途無量。
震旦大學是中國第一所開展研究生教育並授予碩士學位的學校。1952年秋，全國高校院系調整，震旦大學被撤銷，系科分別併入復旦大學、上海第一醫學院、華東師範大學、交通大學、同濟大學、華東化工學院、華東政法學院、上海財政經濟學院等高校。
金陵大學
金陵大學誕生於1888年，美以美會在南京創辦的教會大學，同美國康奈爾大學為姊妹大學。當時社會評價為“中國最好的教會大學”，享有“江東之雄”、“鐘山之英”之美譽。
金陵大學文理農三院嵯峨，英語文學和中國文化研究成就卓著，聞名世界。尤其農林學科堪稱中國之先驅，享譽海內外。其他方面亦有發展，如開創中國電影教育、首開中國醫科七年制教育和博士教育。
1952年院系調整，金陵大學被撤銷建制，主體併入南京大學，其餘院系參與組建中國其他高校。
國立中央大學
國立中央大學是中華民國時期中國最高學府，也是中華民國國立大學中系科設置最齊全、規模最大的大學。國立中央大學追溯學脈源自三國時期吳永安元年（258年）的南京太學，近代校史肇始於1902年的三江師範學堂，1928年5月16日由國立江蘇大學改稱而來。1948年，在普林斯頓大學的世界大學排名中，居亞洲第一。1949年更名國立南京大學的中央大學。
齊魯大學
齊魯大學誕生於1864年由來自美國、英國以及加拿大的多個美北長老會共同籌款聯合開辦。是中國最早的教會大學之一。經過長期發展，齊大發展成一所綜合性教會大學。學校的醫科的實力最強，有“南湘雅、北齊魯”之稱。當時的齊魯大學號稱“華北第一學府”，和燕京大學並稱“南齊北燕”。1952年院系調整，齊魯大學被撤銷建制，其學科分別併入山東大學、山東師範大學、南京大學等高校。