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大雲寺博物館位於西王母文化發源地、陝甘寧交通樞紐——甘肅省平涼市涇川縣。
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1402年前的公元601年10月，隋文帝楊堅以印度的護法王（佛教稱為轉輪法王）——阿育王為榜樣“弘法護教”。阿育王所建的84000塔，是在同一日修起的，於是，仁壽元年（601年）6月13日，在隋文帝60歲生日的這一天，下詔在30州建30座舍利塔供養佛舍利。欽定10月15日午時，30州“同下”（舍利入石函）。
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當時的涇州屬長安門戶，京畿之地，14粒舍利於公元601年10月由高僧送到涇川，在大興國寺建地宮，置函，供養。
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公元690年9月9日，67歲的武則天登基，稱“神聖皇帝”。在男尊女卑的時代，武則天稱帝受到各方面的反對和阻撓。武則天對以女性經變故事為主題的《大雲經》很崇敬，於同年7月將其頒行天下。
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公元690年10月，武則天又敕令兩京（長安、洛陽）、各州都建一座大雲寺，珍藏《大雲經》，並總遣千名僧人，到各地講解《大雲經》。涇州大雲寺選在在大興國寺遺址上建塔立寺，動工之際，發現了隋代供養的舍利。
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女皇敕建大雲寺之舉恰與佛祖舍利相遇，被認為是大吉大利的巧合，於是請金銀器製作大師，選寶石珍珠，做成銅、銀、金棺槨，以硫璃瓶盛裝14粒佛骨舍利，配以石函，鐫刻清楚朝代地點數量，入磚築地宮，建塔立寺。
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一座1400年前的舍利石函，一套1300年前的金銀棺槨，14粒來自古印度的佛祖舍利，只是因幾個農民平整土地時隨意的一鐵鍬，便剷出的一個驚世發現。由此，轟動了當時的佛教考古界。
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1964年12月，甘肅省平涼市涇川縣城關公社水泉寺大隊賈家莊生產隊的村民們，在村莊附近的河川地裡平整土地。這個地方過去叫官背後，東面是古涇州城州署和隍廟遺址，西南面叫營裡，東南面叫倉裡。早年這兒有一座寺廟，後來寺廟坍塌了，地中間只剩下一堆廢棄的斷垣殘壁和瓦礫磚石。
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村民喬碎成在剷除瓦礫時，用力過猛，鐵杴一下子竟伸了進去，再一看，原來是一個洞口。洞裡黑乎乎的，像是一座墓室，他趴在洞口仔細瞅時，裡面似乎還有東西，就喊了起來：“哎呀，我挖出古墓了！”
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大家七手八腳把洞口挖得大了一點兒，這時出現一個石頭門框，上面刻著花兒，朝裡面細細瞅了好大一陣，裡面像是有一個石鬥樣的東西，大小就跟裝糧食的木鬥差不多
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村民喬兆福鑽進了地洞，洞內冷如冰窖，藉著洞口的亮光，他看見洞壁上繪有圖畫，那隻石鬥在正中間放置著，能挪動，但抱不起來。他把石鬥挪到洞口，喊道：“寶物出來了，幫一把！”村民喬正雲忙爬進洞口，兩人一前一後把石鬥弄了出來。
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太陽光下，人們這才看清，原來不是什麼石鬥，而是一個石函。石函上刻有花紋和銘文，揭開函蓋，裡面竟有一口鎏金銅匣，銅匣下面還壓著一枚鎏金銅鑰匙。“匣子裡一定有珍寶，不能亂動！”喬萬福說完，抱起石函，和村民們一起回到村裡，當即把石函放在大隊部，隨後便派人向縣文化館作了彙報。
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石函由質地堅硬的灰色大理石製成，方形覆鬥頂，長50.5釐米，寬49.5釐米，高42.5釐米。頂上正中刻一方框，框內刻著：“大周涇州大雲寺舍利之函總一十四粒”16個字，陽文隸書，書法遒勁有力。周圍鐫刻著纏枝西番蓮，整齊規律，刻工精細。函身四周刻有銘文，銘末有建塔官員和僧眾的姓名，紀年為“延載元年”（公元694年）。
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現如今，涇川大雲寺博物總佔地364畝，分為中心區、服務區和景區廣場三部分。中心區主要建設主展館、舍利塔、附展廳、大門、鐘樓、鼓樓、東西碑亭；服務區主要建設接待中心、管理中心、服務中心；景區廣場主要建設迎賓廣場、佛文化街、商業街、景區道路等。舍利塔主體設計為7層鋼架結構，塔高95米，採用四角方塔的建築形式，實現了鋼結構與古建築的完美結合，工程設計新穎、氣勢恢弘、風格獨特，國內罕見。
