'Windows輕鬆實現linux shell環境:gitforwindows'
windows缺少shell命令支持
用過Linux服務器分析數據的小夥伴,一定對Linux強大Shell命令所折服,經常會感覺windows缺少這些命令而感覺不方便。
還有想學習Linux Shell命令的小夥伴,一直沒有一個很好的學習環境。雙系統安裝涉及分區改變對硬盤數據不安全,虛擬機效率太低,服務器也是不每個人都會買的。
"windows缺少shell命令支持
用過Linux服務器分析數據的小夥伴,一定對Linux強大Shell命令所折服,經常會感覺windows缺少這些命令而感覺不方便。
還有想學習Linux Shell命令的小夥伴,一直沒有一個很好的學習環境。雙系統安裝涉及分區改變對硬盤數據不安全,虛擬機效率太低,服務器也是不每個人都會買的。
現在方便了,Github推出了一款軟件 gitforwindows,只有30 M的一個windows軟件,卻可以取代windows下的dos環境,輕鬆實現200多個linux命令,讓每個windows用戶輕鬆擁有一個功能強大的終端。
Windows用戶和Mac只差一個git的距離!
安裝 gitforwindows
Git for Windows,主頁:http://gitforwindows.org/Git本來是github網站推出的代碼版本備份和管理軟件,但其也提供了高仿真的shell命令,使用windows用戶體驗相似的Linux強大命令行工具。
點擊頁面中“Download”進入下載列表。可根據個人喜好和系統選擇下載版本。
這裡我選擇下載最新版64位版:Git-2.16.1.4-64-bit.exe
(如有更新請下載最新版)
下載完畢,雙擊開始安裝,全都默認選項,一路Next
至安裝成功。
如何使用
默認安裝成功,在桌面或任何文件目錄中,點擊右鍵菜單中會有Git Bash Here
選項
windows缺少shell命令支持
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選項
左鍵單擊Git Bash Here
即打開Git Bash終端
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選項
左鍵單擊Git Bash Here
即打開Git Bash終端
現在你有了一個功能強大的終端,管理你windows文件系統像linux一樣。
如~
家目錄,就是用戶主目錄,我們位置在桌面,即~/Desktop
值得注意幾點:
啟動Git bash的位置即當前目錄
/
為系統根目錄,系統的分區c/d僅為根目錄下的目錄,如進入C盤,則輸入cd /c
git只是實現了部分shell命令
git運行
/bin
目錄中所有命令,同時支持系統中的dos命令和安裝的程序,如查看文件可以使用ls
也可以使用dos命令dir
Git有那些Shell命令
本質上Git將Linux命令重新編寫了適合windows使用的exe可執行文件版本,查看一下系統中有那些可用的linux命令:
# 進入系統命令目錄
cd /bin
# 查看所有exe可執行程序
ls *.exe
列出了247個Shell命令程序,不在目錄的shell命令也可上網搜索相應的windows版本exe文件,人工添加至windows環境變量即。
看看git支持哪些常用命令
"windows缺少shell命令支持
用過Linux服務器分析數據的小夥伴,一定對Linux強大Shell命令所折服,經常會感覺windows缺少這些命令而感覺不方便。
還有想學習Linux Shell命令的小夥伴,一直沒有一個很好的學習環境。雙系統安裝涉及分區改變對硬盤數據不安全,虛擬機效率太低,服務器也是不每個人都會買的。
現在方便了,Github推出了一款軟件 gitforwindows,只有30 M的一個windows軟件,卻可以取代windows下的dos環境,輕鬆實現200多個linux命令,讓每個windows用戶輕鬆擁有一個功能強大的終端。
Windows用戶和Mac只差一個git的距離!
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現在你有了一個功能強大的終端,管理你windows文件系統像linux一樣。
如~
家目錄,就是用戶主目錄,我們位置在桌面,即~/Desktop
值得注意幾點:
啟動Git bash的位置即當前目錄
/
為系統根目錄,系統的分區c/d僅為根目錄下的目錄,如進入C盤,則輸入cd /c
git只是實現了部分shell命令
git運行
/bin
目錄中所有命令,同時支持系統中的dos命令和安裝的程序,如查看文件可以使用ls
也可以使用dos命令dir
Git有那些Shell命令
本質上Git將Linux命令重新編寫了適合windows使用的exe可執行文件版本,查看一下系統中有那些可用的linux命令:
# 進入系統命令目錄
cd /bin
# 查看所有exe可執行程序
ls *.exe
列出了247個Shell命令程序,不在目錄的shell命令也可上網搜索相應的windows版本exe文件,人工添加至windows環境變量即。
看看git支持哪些常用命令
是不是已經很強大了,強大到了一多半你都沒用過。剛入門的小夥伴夠學習一陣了。
其實我們常用的也就幾個:
awk 文本行列處理,如兩個表共有列合併,即是一個小命令,也是一門語言,用好了功能極其強大
cat 顯示文件內容
cp 複製文件,與windows系統的
copy
功能類似cut 文件列操作
dos2unix 轉換windows換行符為linux格式
gzip 文件壓縮解壓
head 顯示文件前N行,或去除後N行
less 按頁查看文件內容
ln 建立文件軟鏈(快捷方式)和硬鏈
ls 顯示文件目錄,windows中類似命令為
dir
mkdir 創建新目錄
mv 移動或改名
rm 刪除文件
rmdir 刪除空目錄
scp 遠程複製文件
sed 文本替換,也是一門語言,功能極強
seq 產生連續等間隔數值序列
sort 排序,可實現excel中多條件同時排序
ssh 登陸ssh服務器,你和mac只差一個ssh的距離
zless 查看壓縮文件
簡單的fasta文件操作例子
我們在桌面上進建一個test文件夾,進入後右鍵執行 git bash,這時我們的起始目錄即為當前test目錄~/Desktop/test
。
我們創建一個fasta序列文件,內容如下:
>protein1
MEMEQEKMTMNKELSPDAAAYCCSACHGDETWSYNHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCP
>protein2
VTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKSPKSVLVIKKMRDASLLQPFKELCTHLMEENMIVYVEK
KVLEDPAIASDESFGAVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPVMAFHLGSLG
>protein3
FLTPFSFENFQSQVTQVIEGNAAVVLRSRLKVRVVKELRGKKTAVHNGLGENGSQAAGLDMDVGKQAMQY
QVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICP
HSLSFRPIVVPAGVELKIMLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVRDPVSDWFES
>protein4
LAQCLHWNVRKKQAHFEEEEEEEEEG
複製上以fasta格式蛋白序列全部內容,在終端中輸入如下命令:cat加>創建新文件test.txt
並寫始寫入
cat > test.txt
回車執行上述命令即開始編寫文件狀態,我們只需按鼠標滾輪即可快速粘貼
剪切板中內容,再按Ctrl+D組合實現結束編輯並保存
。
接下來對這個序列文件進行簡單的操作:
# 使用cat命令顯示文件內容
cat test.txt
# fasta文件通常為.fa的擴展名,mv命令改名
mv test.txt test.fa
# 文件很大可使用less按頁查看,空格翻頁,q退出查看模式
less test.fa
# 只查看序列名稱行
grep '>' test.fa
# 統計序列條數:即上條命令接wc統計字數,-l只統計行數
grep '>' test.fa |wc -l
# sed去除序列名中的大於號
grep '>' test.fa | sed 's/>//'
# 顯示每條序列長度
# 基本思路將fasta文件多行並單行兩列,為序列名和序列
# 統計第二列長度並輸出
awk '/^>/ {printf("\\n%s\\t",$0);next;} {printf("%s",$0);} END {printf("\\n");}' test.fa | awk '{print $1,length($2)}'
"windows缺少shell命令支持
用過Linux服務器分析數據的小夥伴,一定對Linux強大Shell命令所折服,經常會感覺windows缺少這些命令而感覺不方便。
還有想學習Linux Shell命令的小夥伴,一直沒有一個很好的學習環境。雙系統安裝涉及分區改變對硬盤數據不安全,虛擬機效率太低,服務器也是不每個人都會買的。
現在方便了,Github推出了一款軟件 gitforwindows,只有30 M的一個windows軟件,卻可以取代windows下的dos環境,輕鬆實現200多個linux命令,讓每個windows用戶輕鬆擁有一個功能強大的終端。
Windows用戶和Mac只差一個git的距離!
安裝 gitforwindows
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點擊頁面中“Download”進入下載列表。可根據個人喜好和系統選擇下載版本。
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如何使用
默認安裝成功,在桌面或任何文件目錄中,點擊右鍵菜單中會有Git Bash Here
選項
左鍵單擊Git Bash Here
即打開Git Bash終端
現在你有了一個功能強大的終端,管理你windows文件系統像linux一樣。
如~
家目錄,就是用戶主目錄,我們位置在桌面,即~/Desktop
值得注意幾點:
啟動Git bash的位置即當前目錄
/
為系統根目錄,系統的分區c/d僅為根目錄下的目錄,如進入C盤,則輸入cd /c
git只是實現了部分shell命令
git運行
/bin
目錄中所有命令,同時支持系統中的dos命令和安裝的程序,如查看文件可以使用ls
也可以使用dos命令dir
Git有那些Shell命令
本質上Git將Linux命令重新編寫了適合windows使用的exe可執行文件版本,查看一下系統中有那些可用的linux命令:
# 進入系統命令目錄
cd /bin
# 查看所有exe可執行程序
ls *.exe
列出了247個Shell命令程序,不在目錄的shell命令也可上網搜索相應的windows版本exe文件,人工添加至windows環境變量即。
看看git支持哪些常用命令
是不是已經很強大了,強大到了一多半你都沒用過。剛入門的小夥伴夠學習一陣了。
其實我們常用的也就幾個:
awk 文本行列處理,如兩個表共有列合併,即是一個小命令,也是一門語言,用好了功能極其強大
cat 顯示文件內容
cp 複製文件,與windows系統的
copy
功能類似cut 文件列操作
dos2unix 轉換windows換行符為linux格式
gzip 文件壓縮解壓
head 顯示文件前N行,或去除後N行
less 按頁查看文件內容
ln 建立文件軟鏈(快捷方式)和硬鏈
ls 顯示文件目錄,windows中類似命令為
dir
mkdir 創建新目錄
mv 移動或改名
rm 刪除文件
rmdir 刪除空目錄
scp 遠程複製文件
sed 文本替換,也是一門語言,功能極強
seq 產生連續等間隔數值序列
sort 排序,可實現excel中多條件同時排序
ssh 登陸ssh服務器,你和mac只差一個ssh的距離
zless 查看壓縮文件
簡單的fasta文件操作例子
我們在桌面上進建一個test文件夾,進入後右鍵執行 git bash,這時我們的起始目錄即為當前test目錄~/Desktop/test
。
我們創建一個fasta序列文件,內容如下:
>protein1
MEMEQEKMTMNKELSPDAAAYCCSACHGDETWSYNHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCP
>protein2
VTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKSPKSVLVIKKMRDASLLQPFKELCTHLMEENMIVYVEK
KVLEDPAIASDESFGAVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPVMAFHLGSLG
>protein3
FLTPFSFENFQSQVTQVIEGNAAVVLRSRLKVRVVKELRGKKTAVHNGLGENGSQAAGLDMDVGKQAMQY
QVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICP
HSLSFRPIVVPAGVELKIMLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVRDPVSDWFES
>protein4
LAQCLHWNVRKKQAHFEEEEEEEEEG
複製上以fasta格式蛋白序列全部內容,在終端中輸入如下命令:cat加>創建新文件test.txt
並寫始寫入
cat > test.txt
回車執行上述命令即開始編寫文件狀態,我們只需按鼠標滾輪即可快速粘貼
剪切板中內容,再按Ctrl+D組合實現結束編輯並保存
。
接下來對這個序列文件進行簡單的操作:
# 使用cat命令顯示文件內容
cat test.txt
# fasta文件通常為.fa的擴展名,mv命令改名
mv test.txt test.fa
# 文件很大可使用less按頁查看,空格翻頁,q退出查看模式
less test.fa
# 只查看序列名稱行
grep '>' test.fa
# 統計序列條數:即上條命令接wc統計字數,-l只統計行數
grep '>' test.fa |wc -l
# sed去除序列名中的大於號
grep '>' test.fa | sed 's/>//'
# 顯示每條序列長度
# 基本思路將fasta文件多行並單行兩列,為序列名和序列
# 統計第二列長度並輸出
awk '/^>/ {printf("\\n%s\\t",$0);next;} {printf("%s",$0);} END {printf("\\n");}' test.fa | awk '{print $1,length($2)}'
現在我們可以在windows裡輕鬆實現大文件操作,文件查看、壓縮解決,序列分析,是不是很方便。
筒子們,燥起來吧!
Linux小抄
入門小夥伴推薦學習Linux CheatSheet —— 常用linux命令速記表,來自fosswire.com,有多國語言版本,隨身常看,快速入門。
"windows缺少shell命令支持
用過Linux服務器分析數據的小夥伴,一定對Linux強大Shell命令所折服,經常會感覺windows缺少這些命令而感覺不方便。
還有想學習Linux Shell命令的小夥伴,一直沒有一個很好的學習環境。雙系統安裝涉及分區改變對硬盤數據不安全,虛擬機效率太低,服務器也是不每個人都會買的。
現在方便了,Github推出了一款軟件 gitforwindows,只有30 M的一個windows軟件,卻可以取代windows下的dos環境,輕鬆實現200多個linux命令,讓每個windows用戶輕鬆擁有一個功能強大的終端。
Windows用戶和Mac只差一個git的距離!
安裝 gitforwindows
Git for Windows,主頁:http://gitforwindows.org/Git本來是github網站推出的代碼版本備份和管理軟件,但其也提供了高仿真的shell命令,使用windows用戶體驗相似的Linux強大命令行工具。
點擊頁面中“Download”進入下載列表。可根據個人喜好和系統選擇下載版本。
這裡我選擇下載最新版64位版:Git-2.16.1.4-64-bit.exe
(如有更新請下載最新版)
下載完畢,雙擊開始安裝,全都默認選項,一路Next
至安裝成功。
如何使用
默認安裝成功,在桌面或任何文件目錄中,點擊右鍵菜單中會有Git Bash Here
選項
左鍵單擊Git Bash Here
即打開Git Bash終端
現在你有了一個功能強大的終端,管理你windows文件系統像linux一樣。
如~
家目錄,就是用戶主目錄,我們位置在桌面,即~/Desktop
值得注意幾點:
啟動Git bash的位置即當前目錄
/
為系統根目錄,系統的分區c/d僅為根目錄下的目錄,如進入C盤,則輸入cd /c
git只是實現了部分shell命令
git運行
/bin
目錄中所有命令,同時支持系統中的dos命令和安裝的程序,如查看文件可以使用ls
也可以使用dos命令dir
Git有那些Shell命令
本質上Git將Linux命令重新編寫了適合windows使用的exe可執行文件版本,查看一下系統中有那些可用的linux命令:
# 進入系統命令目錄
cd /bin
# 查看所有exe可執行程序
ls *.exe
列出了247個Shell命令程序,不在目錄的shell命令也可上網搜索相應的windows版本exe文件,人工添加至windows環境變量即。
看看git支持哪些常用命令
是不是已經很強大了,強大到了一多半你都沒用過。剛入門的小夥伴夠學習一陣了。
其實我們常用的也就幾個:
awk 文本行列處理,如兩個表共有列合併,即是一個小命令,也是一門語言,用好了功能極其強大
cat 顯示文件內容
cp 複製文件,與windows系統的
copy
功能類似cut 文件列操作
dos2unix 轉換windows換行符為linux格式
gzip 文件壓縮解壓
head 顯示文件前N行,或去除後N行
less 按頁查看文件內容
ln 建立文件軟鏈(快捷方式)和硬鏈
ls 顯示文件目錄,windows中類似命令為
dir
mkdir 創建新目錄
mv 移動或改名
rm 刪除文件
rmdir 刪除空目錄
scp 遠程複製文件
sed 文本替換,也是一門語言,功能極強
seq 產生連續等間隔數值序列
sort 排序,可實現excel中多條件同時排序
ssh 登陸ssh服務器,你和mac只差一個ssh的距離
zless 查看壓縮文件
簡單的fasta文件操作例子
我們在桌面上進建一個test文件夾,進入後右鍵執行 git bash,這時我們的起始目錄即為當前test目錄~/Desktop/test
。
我們創建一個fasta序列文件,內容如下:
>protein1
MEMEQEKMTMNKELSPDAAAYCCSACHGDETWSYNHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCP
>protein2
VTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKSPKSVLVIKKMRDASLLQPFKELCTHLMEENMIVYVEK
KVLEDPAIASDESFGAVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPVMAFHLGSLG
>protein3
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QVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICP
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>protein4
LAQCLHWNVRKKQAHFEEEEEEEEEG
複製上以fasta格式蛋白序列全部內容,在終端中輸入如下命令:cat加>創建新文件test.txt
並寫始寫入
cat > test.txt
回車執行上述命令即開始編寫文件狀態,我們只需按鼠標滾輪即可快速粘貼
剪切板中內容,再按Ctrl+D組合實現結束編輯並保存
。
接下來對這個序列文件進行簡單的操作:
# 使用cat命令顯示文件內容
cat test.txt
# fasta文件通常為.fa的擴展名,mv命令改名
mv test.txt test.fa
# 文件很大可使用less按頁查看,空格翻頁,q退出查看模式
less test.fa
# 只查看序列名稱行
grep '>' test.fa
# 統計序列條數:即上條命令接wc統計字數,-l只統計行數
grep '>' test.fa |wc -l
# sed去除序列名中的大於號
grep '>' test.fa | sed 's/>//'
# 顯示每條序列長度
# 基本思路將fasta文件多行並單行兩列,為序列名和序列
# 統計第二列長度並輸出
awk '/^>/ {printf("\\n%s\\t",$0);next;} {printf("%s",$0);} END {printf("\\n");}' test.fa | awk '{print $1,length($2)}'
現在我們可以在windows裡輕鬆實現大文件操作,文件查看、壓縮解決,序列分析,是不是很方便。
筒子們,燥起來吧!
Linux小抄
入門小夥伴推薦學習Linux CheatSheet —— 常用linux命令速記表,來自fosswire.com,有多國語言版本,隨身常看,快速入門。
更深入的學習,推薦陳同博士寫過的Linux學習系統推文,現在不用不用裝Linux或必須買服務,一個軟件就搞定:
Linux學習-總目錄
Linux學習-文件和目錄
Linux學習-文件操作
Linux文件內容操作
Linux學習-環境變量和可執行屬性
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Reference
官方:https://gitforwindows.org/
Windows平臺下Git的安裝與配置 http://mp.weixin.qq.com/s/32bVu-pjbPI70KuNgQBMug
Linux小抄 cheatsheet 多國語言版: https://fosswire.com/
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