2016年4月15日周琦正式宣佈參加2016年NBA選秀。6月24日在第二輪43順位被休斯敦火箭隊選中。在CBA繼續深造一年後，2017年4月7日幫助新疆隊以總分4-0擊敗廣東隊，奪得2016-17賽季CBA聯賽總冠軍。該賽季榮膺2016-17賽季CBA年度最佳防守球員。7月8日正式簽約休斯敦火箭隊，成為繼姚明之後第二位效力休斯敦球隊的中國球員，“大魔王”周琦開始了他的NBA之行。
2017年10月22日，火箭對陣小牛。周琦迎來常規賽首秀，登場7分鐘，三分一次出手未能命中，沒有得分拿到3板1帽的數據。
2017年11月2日，周琦職業生涯首次得分（出戰4分鐘得到3分） 。11月6日，周琦登場5分鐘得到4分1板，並完成NBA生涯首次扣籃。
2018年3月26日，周琦迎來2018年NBA首秀，登場3分鐘得到2分3板。
2018年11月24日，火箭官方宣佈，他們已經將周琦從發展聯盟里奧格蘭德河谷毒蛇隊召回。因為左腳踝扭傷，周琦缺席了里奧格蘭德河谷毒蛇隊上一場比賽。本賽季周琦已經為里奧格蘭德河谷毒蛇隊打了7場比賽，場均出戰27.9分鐘可以拿到11.9分9.4籃板。
由於火箭隊內競爭激烈，周琦始終無法在火箭獲得機會，甚至是替補的機會少得可憐。國內很多球迷覺得周琦的NBA之行意義不大，遠離祖國和親人，甚至連出場的機會都撈不著，倒不如回到CBA，但是周琦堅定了選擇了留守國外。
但是，有個對周琦有個好消息是，2018年7月23日，丁彥雨航和達拉斯獨行俠隊簽下了一份訓練營合同。如今的小丁正在美國隨隊訓練，有消息稱丁彥雨航將會被下放到發展聯盟先打一年球。
今天，丁彥雨航微博喊話周琦：在的我似乎更明白你身上的那份執著。保持樂觀，保持堅定，一起加油。
2018體育微男神，投給你。
字裡行間流露出對周琦的尊敬，也暗含著自己的NBA之行不易，同時為自己和周琦打氣。
加油吧，周琦和小丁，有夢想的人最可怕，希望有一天，你們能立足NBA，重現亞洲人在NBA的輝煌。