徐福確有其人並確實東渡大海，這點無人質疑。但徐福東渡目的是什麼，徐福是否就是日本神武天皇還有不少疑問。其實疑問從歷史記載中就可解決大半。首先別忘了徐福是個什麼樣的人：秦朝著名方士，博學多才，通曉醫學、天文、航海等知識，且同情百姓，樂於助人，傳他種了一顆茶樹，能用茶葉治百病，故在沿海一帶民眾中名望頗高。徐福是鬼谷子先生的關門弟子。學辟穀、氣功、修仙，兼通武術。據《史記》“秦始皇本紀”記載，秦始皇希望長生不老。秦始皇二十八年（前219年），徐福上書說海中有蓬萊、方丈、瀛洲三座仙山，有神仙居住。於是秦始皇派徐巿率領童男童女數千人、以及已經預備的三年糧食、衣履、藥品和耕具入海求仙，耗資巨大。但徐福率眾出海數年，並未找到神山。秦始皇三十七年（前210年），秦始皇東巡至琅岈，徐巿說出海後碰到巨大的鮫魚阻礙，無法遠航，要求增派射手對付鮫魚。秦始皇應允，派遣射手射殺了一頭大魚。後徐福再度率眾出海，去而不返。
一、海上仙山有沒有？在哪裡？
這個問題是一切研究 出發點，必須弄清楚。徐福的人生理想是得道成仙，故他才去師從鬼谷子學辟穀、氣功、修仙，這三者是有聯繫的一回事。徐福認為海中有蓬萊、瀛洲、方丈三座仙山，不是空穴來風，極有可能是他在海邊面對日本方向打坐入定時的氣功態下遙視到了這幾座“山”。如蓬萊為三座仙山之首，應該最高大，他向大海東方遙視看到的自然首先是日本最高的富士山了，上白下綠，用“蓬”、“萊”兩種花草命名最合適不過，蓬開白花，萊為可吃綠野菜，山名稱就起好了；為什麼他敢肯定是仙山，因為一年四季他看到的山上“白花”永不枯萎凋謝，誤以為那是長生不死的仙草，而有仙人居之地才有這種情景。所以他才有天大膽子去上書並和秦始皇要這要那，始皇深信不疑，也是因為徐福本人的自信和始皇也在一心向往長生不老。瀛洲的“瀛”是大海，合起來指大海里的島，日本許多地方正是大海中的島了。方丈指方方正正一大塊土地，是日本的關東大平原或其他平原，也就是《史記》提到的徐福到達的“平原廣澤”之地。“平原廣澤”之所以能寫進《史記》，是因為徐福已經在定境中見到了日本的大平原，並向恐懼入海的童男童女作出海動員，說大海對面即“平原廣澤”的仙境，以絕其離家之恐懼和思念，自然其家人和沿海一帶百姓也皆知了。徐福一心求仙，使他的遙視帶上主觀色彩，誤以為日本山島就是理想中仙界了，這促使他下了最大決心徵得秦始皇同意東渡日本。也就是說，如果他自己沒有十分把握認為有“仙山”是毫無必要冒殺頭危險去騙秦始皇和冒生命危險闖大海的。
二、徐福是否去了其他地方？
徐福東渡根本目的取決於他的人生目的：一心求仙。所以他必然是去日本，沒求得仙藥也不會去美洲、東南亞等地，首先不知 那裡是仙境否決不再去，何況物資也支撐不了走那麼遠，糧食也是計劃留一半做種子的。所以去了富士山知道不是仙山就絕不會再去其他地，那會違揹他的人生目標。到達日本後，徐福沒有得到長生不老藥，擔心秦始皇追殺，要求同行男女各自改姓成為「秦」、「佃」、「福田」、「羽田」、「福臺」、「福山」等姓氏。日本人認為徐福在日本的紀州熊野的新宮（今和歌山縣新宮市）登陸，目前當地還有徐福墓和徐福神社，每年11月28日是祭祀徐福的日子。
三、徐福是否是日本第一位天皇“神武天皇”?
名稱本身就蘊含最真實最豐富的信息。所有推論離開基本事實就會有無數可能。徐福在中國就是個半仙人物，在當地人眼中就更神了：知陰陽達幽冥，懂天文識地理，能掐會算，拈草可治絕病，會武術氣功並帶來一幫射蛟武士——也許是武士道精神創始人，突然“穿越時空”般來到日本，並帶來大量先進技術，當地原始居民能不奉為天降之“神武”皇帝嗎？反過來說，除中國來之徐福，又有誰能做配做這一稱號的天皇呢？在日本徐福的傳說中，日本人認為徐福帶來了童男童女、百工、谷種、農具、藥物及生產技術和醫術，對日本發展起了重要作用，因此尊徐福為“司農耕神”和“司藥神”。查日本迄今共125位天皇中只有三位與“神”掛鉤，另兩位是“崇神天皇”和“應神天皇”，一位崇拜神一位要與神相應，無疑都是在求得“神武天皇”庇佑，都不敢把自己當成神，而只有“神武天皇”是可以讓人們感到其本身就是神明和英武的化身的，儘管這一稱呼可能是後人加的。日本的一些研究者也認為，“徐福是日本民族開國始祖”，並稱：“日本民族的始祖，是徐福和他帶來的一批人。日本歷史上所謂‘造化三神’的三座神山聖蹟，與天皇氏之源義，根本就是徐福的化身”。
四、徐福有移民企圖嗎？
帶那麼多童男童女，還有百工共三千人，包括齊國國戚，不是不滿齊國之亡想趁機移民嗎？他的根本目的不在移民，還在求仙。既然去了仙山還不留下來享受？還不趁機修仙？所以要做好長期生存打算，在仙山建立自己的天堂國都；這麼大事齊國原皇親國戚自然都知道了，都想去仙界，這就是帶百工的原因了，所以就都帶上了。當然說有些人不滿秦統治想移民出國享受那是有些人，不是徐福本意。