光合細菌簡稱PSB，是國內最早用於水產養殖的細菌製劑。光合細菌是一些能利用光能進行不產氧的光合作用的細菌。很多朋友看到光合，就會跟葉綠素的光合作用比較。光合細菌是不產氧的，光合細菌在自身繁殖過程中能利用小分子有機物做碳源、供氫體，利用水環境溶解氮(如銨、硝酸鹽、亞硝酸鹽等)做氮源合成有機氮化物,因此可消耗水中的小分子有機物、銨、硝酸鹽、亞硝酸鹽,起淨化水質的作用。 光合細菌是分解小分子的，所以用紅糖激活是沒作用的，紅糖是大分子。些人遇到亞硝酸鹽高，用光合細菌有效果，也是這個原理。
但是光合細菌不能利用水環境中的一些大分子有機物,水體中的大分子有機物(如蛋白質、脂肪、糖)必須先由其它微生物 (如枯草桿菌、芽孢桿菌、乳酸菌、酵母菌、放線菌、硫化菌等)分解成小分子有機物(如氨基酸、低級脂肪酸、小分子糖等)後才能被光合細菌分解利用,因此在利用光合細菌淨化水質時應配合使用其它有益菌。我們日常用菌，最好幾種配合使用，事半功倍。光合菌改良水體的過程通常是在光合作用下完成。一般情況下光合菌對水體中可見光或光能見度較高的水體表層（30–50cm）水質具有較好改良效果，而對水體中光能見度較底的較深或深水層以及難見光的池底部分，由於光合作用進行困難或難於進行，因此難於產生良好的改良效果。
芽孢是一大類細菌，我們日常用得最多是枯草芽孢。芽孢桿菌屬於革蘭氏陽性菌，好氧，能產生孢子，是一類具有高活性的消化酶系、耐高溫、抗應激性的異養菌。
芽孢桿菌可以降低水體中硝酸鹽、亞硝酸鹽的含量，從而起到改善水質的作用。枯草芽孢桿菌在代謝過程中還產生一種具有抑制或殺死它種微生物的枯草桿菌素，從而來改善水質。芽孢生長繁殖過程中耗氧，這個問題估計很多人碰到過。所以在使用時注意增氧。成品中的芽孢桿菌處於休眠狀態，需要活化（加紅糖等有機物）。芽孢桿菌在繁殖過程中分泌大量的澱粉酶、蛋白酶和脂肪酶, 能迅速降解魚蝦殘留餌料和排洩物，在池內其他微生物的共同作用下, 大部分進一步分解為水和二氧化碳, 小部分成為新細胞合成的物質, 從而淨化水體。
有人遇到亞硝高，說用芽孢，也有效果。也是如此。到底光合細菌，芽孢細菌還是硝化細菌降亞硝好呢？ 我建議平常就需要預防，幾種菌配合使用。
硝化細菌是一類化能自養型細菌，利用氨或亞硝酸鹽為主要生存能源，以二氧化碳作為主要碳源的一類細菌，有亞硝化細菌和硝化細菌兩類生理亞群組成。亞硝酸細菌完成NH4+到 NO2－的轉化；而硝化細菌完成NO2－到NO3－的轉化，從而使對水生動物有毒的氨態氮和亞硝酸鹽轉化為對水生動物無毒的硝酸鹽。硝化作用是一種氧化作用，在溶氧充足的條件下效率最高。
很多人用過硝化細菌，覺得效果不如預期。為啥？一就是溶解氧，硝化細菌需要溶氧足；二是硝化細菌的繁殖很慢。有多慢呢？我查過資料，硝化細菌20小時才繁殖一代。所以當你亞硝酸鹽高時，才想到硝化細菌，那基本沒用了，硝化細菌用在防上面好。我的朋友他們清完塘後，從小苗開始就定期潑硝化細菌。
亞硝酸鹽超標的問題是很多人碰到的，預防為主，特別是中後期，隨著飼料的增加，糞便的增加，水裡已經分解不了了，就開始爆發了。控料是從源頭抓，菌的使用也很關鍵。光合細菌對亞硝酸鹽轉化低效率和芽孢桿菌對氨氮轉化低。
硝化細菌還有一個特點，它需要附著，它跟別的菌不同，所以有的地方有發展生物載體。亞硝酸細菌完成NH4+到 NO2－的轉化；而硝化細菌完成NO2－到NO3－的轉化，從而使對水生動物有毒的氨態氮和亞硝酸鹽轉化為對水生動物無毒的硝酸鹽。有機物過多，PH值低，溶氧低（2mg/L以下），溫度低等都將抑制硝化細菌在水體中的濃度。
酵母菌與細菌不同，它具有真正的細胞核，屬於單細胞真菌類微生物。預防可以，治的話，非常你下非常多。酵母菌在有氧和無氧的環境中都能生長，即酵母菌是兼性厭氧菌，在缺氧的情況下，酵母菌把糖分解成酒精和水。在有氧的情況下，它把糖分解成二氧化碳和水，在有氧存在時，酵母菌生長較快。酵母菌添加到食物當中能黏附在腸道中, 刺激魚蝦體內澱粉酶和刷狀緣膜酶的分泌, 從而提高動物對食物的利用率。
酵母菌是喜生長於偏酸性環境中的需氧菌，可以在消化道內大量繁殖。酵母菌的大量繁殖和生長，使其在與有害菌生存競爭中成為優勢種群，抑制了有害菌的生長。好東西，但得會使用。
很多人一聽蛭弧菌，就覺得是殺弧菌的。蛭弧菌是一種寄生於細菌的細菌，能以自身的吸附器附於寄主菌的細胞壁上，並迅速地鑽入寄主細胞內，利用寄主的營養生長、繁殖，最後導致寄主菌裂解。
蛭弧菌就像一個殺手，它會殺菌。蛭弧菌對寄主有選擇性，它專以弧菌、假單胞菌、氣單胞菌、愛德華氏菌等革蘭氏陰性菌為寄主。自然界中的有害菌有害藻其實殺不完的，我們要的就是讓有益菌有益藻佔優勢。
EM相信很多人用很多，EM為有效微生物群的英文縮寫，它是由光合細菌、乳酸菌、酵母菌、放線菌、絲狀菌等五大類菌群中80餘種有益菌種複合培養而成。理論如此，但估計實際上不同廠家配方有所不同。EM菌滲入水體後，能抑制病原微生物和有害物質，促進浮游生物的大量繁殖和提高水中溶氧量，保持養殖水體的生態平衡，淨化養殖池塘中的排洩物和殘餌，改善水質和底質，從而減少疾病。
如果各位不嫌麻煩的話，經常拌乳酸菌必有奇效，形成腸道保護層，阻止病原菌,病毒的侵襲，刺激腸道分泌抗體，提高腸道免疫力，促進胃液分泌，增強消化功能。
微生物水質調節劑與抗生素及消毒劑混合使用：養殖戶在使用微生物水質調節劑改善水質的同時，處於對養殖動物疾病的恐懼，習慣於使用抗生素進行預防，在水體、餌料中長期加用一種或是多種抗生素，以期殺滅病原體，減少發病，以為這樣雙管齊下，可保萬無一失。殊不知抗生素在殺滅病菌的同時也將活菌組成的微生物製劑破壞。
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