人類誕生後，地面上幾乎沒有中斷過戰爭，特別是黃帝降世後，戰爭的幾乎遍佈到神洲的每一個角落，它的直接後果便是令到天地間的戾氣增加到祥和之氣無法與之中和的地步，而幾百年下來凶獸肆虐的情況又始終沒有改善，雖然有賢明的帝俊，讓百姓得到短暫的安寧，但十日危機與天妖作祟都帶給了人類巨大的危機，生存面前，人類變得無法琢磨，惡念叢生。人的惡念又可以稱之為魔念，而魔唸的不斷積累，終於令到元始天妖之後又一個蓋世魔王的誕生。他的名字就叫做魔。
魔，本來是無影無形的，只能以寄生的方式害人，但在一次偶然的機會裡，魔與幾個怨靈同時吸收到天地交合之氣，又正好得到元始天王盤古氏的造世神光的照拂，在與一小塊息壤相融後，便形成了第一個有形的魔！又經過數千年光陰的沉浸，終於修煉成人形，並自取一名曰刑天！
刑天不但擁有了源於三界之惡念而來的強大破壞力，還能夠隨時吸取新生於天地間的魔氣為己用，力量一日強過一日！終於有一天，他從地底破繭而出，踏入天地人三界，準備大展拳腳。玉皇大帝得到消息後匆匆趕來，與刑天展開惡戰，雙方各顯神通，三百回合後，玉帝佔據了絕對的上風！刑天魔力雖強，無奈武藝不精，自思的確遜於玉皇大帝一籌，於是借血遁敗走！他的血不但巨毒無比，而且附有譏咒的力量，玉皇大帝想不到他突然逃走，逃走的手段又這麼絕，血又這麼毒，只好先自行避過毒血，再用法力收入容器中，以免它落入人間。
經此一役，刑天本該知難而退，但他只是找了個邪氣極重的地方，繼續吸收人間的魔氣，當玉皇大帝經過常羊山的時候，他自認為已有足夠把握，就攔住了他的去路，一仙一魔展開第二場大戰！
話說天帝殺掉刑天后，也是精疲力盡，同時還吸入了大量來自刑天的魔氣脾氣變的十分暴躁。他回到天宮，仔細看向人間時，發現人類身上的七情六慾遠遠超出了神仙身上所載帶的情感，而人類的理性則經常迷失於七情六慾之中，而人類的野心又好象是無限可擴張的，這一切都是刑天魔力的來源。玉皇大帝成道同時，把以前的肉身化作一本無字天書，藉助無字天書，他向人類的未來看去，終於發現隨著人類科技的不斷進步，天地將危在旦昔，而這一切將會在一萬年發生，想不到下一個萬年的天劫竟會來自科技發達了的人類。玉帝一時失控，竟降下天水。
十日危機之後，是一個漫長的乾涸期，在人間大帝堯與萬民的齊心攜心下，莊嫁開始有了更大的產量，雖然遠遠談不上豐收，但看著新的一年的糧食就要收穫取了，大家是繁忙併快樂著的，然而黃河突然崩潰，淮河也隨著決堤，滔天的洪氣，就將要搶走人類的希望了。天神鯀是當時玉帝的得力助手，職責是專門管理與處理人間的事務，比如二十四時（節氣），及時雨，各類災害等等，與人類有著很深厚的感情，他不明白天帝為什麼要發下天水，殺死無辜的人類，於是他偷走了被嚴密看守的息壤，下界治水。他信奉水來土掩的道理，在有洪水的地方四處設堤建壩，然而這樣做的結果是讓洪水改道，淹不了這頭，淹去那頭，還是人類遭殃。天帝一時衝動，也有些後悔，所以鯀盜息壤下界的事，他只當是睜一支眼閉一支眼，可是鯀治水的結果卻讓情況變的越來越糟。接下來該怎麼辦？太白金星深知玉帝此時騎虎難下的處境，苦思數日之後，想出了一條絕世妙計。玉帝聽了他的話後，也是茅塞頓開，於是他派火神祝融，下界把鯀抓住，處死在北極之陰的"羽山"。
鯀死後，一魂不散，三年後不但肉體不腐，還孕育出一個新的生命，雖然有悖倫常，但玉帝就是讓一個從此改變了整個人間世界的生命在一個男體內發育成熟，在出生的那一天，月老帶著吳刀，替鯀剖腹生子。鯀腹開，虯龍現，這個真龍天子便是大禹。
大禹是玉帝三魂之中的一魂轉世，他長大後便帶領人們，本著“疏通”的精神來治水，開山破峽，挖出水道洩洪水，這個方法很有效，洪水的災情很快得到控制。但這個時候，他遇到了第一個阻力，來自共工的阻撓。水神共工因為十幾年的大水而恢復了元氣，一心與玉帝做對的他奮起神威，挾巨洪從西而來，一直掩到“空桑”（即現在的山東曲阜），禹在會稽山（茅山）聚集了人間各界的精英，準備與共工決一死戰，當時有個巨神叫做“防風氏”被共工收買了，故意來的很遲，有心給大禹難堪，結果大禹當機立斷，馬上綁了他暫首示眾。之後第一役又殺掉了相柳，共工知道玉帝在暗中相助，知道不是對手，便逃掉了，據說最終還是死在祝融手上。
共工的另一個暗中的幫凶河伯一看情勢急轉直下，忙從河裡跳出來，獻上了“河圖”，爭取坦白從寬。有了河圖做參考，大禹破龍門，開三峽，很快就治理好了黃河。大禹在治水的時候，經常遇到妖怪山神的攔阻，但他手上有一根叫做“如意金箍棒”的寶貝，重達一萬三千五百斤，可以隨他的心意，變化成任何形狀，誰也擋不住這麼沉重的大棒的一棒子。