我們知道，《孫子兵法》是運用的科學，只有能夠靈活地運用，才能說真正懂得了《孫子兵法》。
那麼，怎樣才能讀懂《孫子兵法》呢？
首先，讀書時要多思考，要多問一下“為什麼？和怎麼做？”。
如，卷一的計篇，在計算敵我雙方實力後，就要思考在我方實力強於敵方時，應該怎麼做？應該採取什麼樣的對策？在我方實力弱於敵方時，應該怎麼做？應該採取什麼樣的對策？
又比如，集中兵力上孫子說：我專而敵分，那麼就要思考怎麼做，才能做到讓敵人分散？怎麼做我方才能集中？
再像，孫子說：致人而不致於人，讀到這裡就要思考一下為什麼要設法調動敵人，而不被敵人調動。
其次，要多分析戰例。
戰例，是古人對《孫子兵法》的實踐化，戰勝必是因為遵循了《孫子兵法》的原則，戰敗必是因為違背了《孫子兵法》的原則。因此，在分析戰例時，一定要搞清楚戰勝方成功的原因，和戰敗方失敗的原因，還要搞清楚當時運用其原則的實際條件，具體問題具體分析。
像孫臏擒龐涓時，用減灶計，就是根據三晉輕視齊軍，一直以為齊軍膽小的錯誤看法，而因勢利導，大敗魏軍。
而《三國演義》上，孔明為了順利退兵，卻反其道而用之，根據司馬懿多疑的性格，用增灶計嚇退了司馬懿。
可見，運用之妙，存乎一心，運用時要根據實際情況，靈活地運用之。否則，只會像馬謖一樣淪為紙上談兵。
第三，要學會融會貫通。
簡單地說，就是要將整本《孫子兵法》看做一個整體，讀前面時，要聯繫後面章節內容，讀後面時，要聯繫前面章節內容。
如，後面的《勢》篇講奇正，要以奇勝，那具體要怎麼勝呢？答案在前面的《計》篇，《計》篇講要“攻其無備，出其不意”，這句話就是以奇勝的關鍵，也就是要乘敵不備而攻之。
總之，讀《孫子兵法》為了在實際中運用，如果不能靈活運用，即使倒背如流又有什麼用呢？
而運用時要注意的一個最關鍵的問題就是要根據不同的情況，而採取不同的措施，而不是死搬兵法，照本宣科。只有這樣，才能說是真懂《孫子兵法》。