查克拉，日文：チャクラ，粵語譯作“卓羅”，是人體掌控各組分能量完美融合所產生的一種能量。是施展忍術、幻術、體術或製成線狀捆綁對手或切斷同為查克拉所構成的物質的能量來源。
查克拉共有七種性質變化：火、水、風、雷、土、陰、陽。
陰的性質變化比如奈良一族的影子束縛術、山中一族的心靈忍術等，而陽的性質變化比如秋道一族的倍化術、醫療忍術等。
陰遁，利用精神能量，能從無中創造出物質形象。陽遁，利用身體能量，將查克拉或意志注入無機物，使其擁有生命。六道仙人以此改造世界。
而這種能量組成為：
1.從人體130兆個細胞裡，一個一個細胞攝取的身體能量。
2.經歷許多修煉、積累經驗而鍛鍊的精神能量。
3.若修煉仙術，則一份為自然能量。提取查克拉後經由“結印”才可使用“術”。
查克拉變化有二：形態變化、性質變化。
查克拉的概念來源於印度神話中的輪脈，在印度教及佛教(尤其是密教)中都可以找到涉及查克拉的修煉內容，而日本古代的武士和忍者都要進行密教修煉。《火影》中的查克拉就取材於此。
| 火 | 高溫查克拉，能夠燒燬所接觸的物件。能夠令對象燃燒起來，與“風”同屬攻擊特化型 |
| 風 | 如鋒利刀鋒的查克拉，能夠斬斷一切物件。用以對付特殊忍具和忍術，用於查克拉刃上則會使切割力發揮到極致，在中、近距離下最具攻擊力 |
| 雷 | 與中、遠距離擴散式忍術最配合。加在金屬製的武器上，會提升殺傷力及觸電效果 |
| 土 | 能夠改變物體的硬度、成分、質量、重力。高手可以令忍術物件甚至是身體變得如鋼鐵般堅硬，或和黏土般柔軟，另外“土”非常適合做土牆來抵擋其他的忍術攻擊 |
| 水 | 適用於“形態變化”，可以變成霧隱藏身影，或變成海嘯阻擋別人，又或者變成水龍彈之類的形態對敵人進行攻擊，具有很高的輔助效果 |
剋制關係：
火優於風、風優於雷、雷優於土、土優於水、水優於火。
血繼限界：
性質變化組合將兩種查克拉性質變化同時發動可以產生新的遁，即血繼限界。
查克拉的由來
據宇智波斑所言，神樹是天地創始之物，被人類尊為神柱，頂禮膜拜。神樹從未捲入過任何人類的戰亂。神樹是一切查克拉的根源。所有的忍界忍者身上的查克拉皆源自神樹。
突然有一天，神樹上竟結出聖果，聖果一千年才會結出一次。但人類的祖祖輩輩皆留下祖訓，萬萬不可染指聖果。但是由於人類無休止的戰亂，一名公主求勝心切，竟偷食了聖果。她的名字叫做大筒木輝夜。
傳聞公主之後得到了神的力量，憑一己之力平定了戰亂。這位公主是第一個擁有查克拉的人類。她的兒子體內與生俱來就具有了查克拉，是第二個擁有查克拉的人。
然而被奪去聖果的神樹為奪回查克拉，變化為十尾的模樣，開始暴走，這就是十尾。大筒木輝夜的兒子成功地阻止了十尾，他的名字叫做大筒木羽衣，他闡明瞭查克拉的真理，開創了忍宗，是忍者的始祖。他還有一個名字叫做“六道仙人”。
這些事據宇智波斑所言，記載於宇智波石碑上。至於發動這種查克拉的能量。效果會根據忍者想發動的忍術而各有不同。精確的控制查克拉是很重要的，如果只需要30%的量卻製造45%，就等於間接耗損了體 能，當體力及查克拉都變成0時，就會死亡。
發動忍術的能量來源-查克拉簡單地說，查克拉就是忍術的“能量”。忍者本身精神和身體的能量和所謂的“精力”相互呼應，在把體內的能量和查克拉相互轉換。而變換效率的好壞也會影響施術者的能力。