《紅樓夢》裡，妙玉的身份比較神祕。她在書中的出場是通過榮國府管家林之孝家的之口引出的。當時榮國府剛剛得到一個烈火烹油，繁花著錦的好消息：元春升為貴妃，並且允許回家省親。
榮國府開始大興土木，修建大觀園，以及去蘇州採買小戲子、小尼姑等。籌備工作完工階段，管家林之孝家的向王夫人彙報採買女孩子的情況，順便提到妙玉。
不管妙玉的身世如何顯赫，但她現在卻通過一個下人向榮國府主子請求庇護。王夫人第一反應是草草敷衍，經過林之孝家的提醒，她才批示“下帖子請妙玉”！
由此可見，妙玉的身世超不過四大家族。她寄住榮國府，只能用一種畸形的傲慢來維護己不如人的自卑。妙玉擠兌劉姥姥，擠兌寶玉，擠兌她領地上的任何人。連一向明哲保身的李紈都公開表態：“可惡妙玉那人，我不理她。”
相比之下，跟妙玉背景相似、祖籍相同的黛玉則身段非常柔和。黛玉投奔榮國府時，賈母帶著全家老小親自迎接；黛玉住進榮國府後，賈母寵她若珍寶，對她跟寶玉不相上下。
黛玉從未恃寵而驕，相反，她對下人非常友善，連不相干的小丫頭佳蕙都得到過黛玉的賞錢。
為何天時地利人和都不如黛玉的妙玉卻這麼高調？這麼囂張，她的底氣來自哪裡？
劉姥姥二進榮國府時，書中給出了暗示和線索。
眾人在探春的秋爽齋用飯，飯罷，探春拉著賈母等人進入臥房，劉姥姥和板兒也跟了進去。板兒在裡面玩鬧，探春非常剋制。離開時，賈母讚歎：“我這三丫頭卻好，只有兩個玉兒可惡，咱們吃完酒，偏去他們那裡鬧！”
這裡提到的兩個玉兒是誰？顯然一個玉兒是寶玉，賈母知道這個孫子喜潔，所以沒有帶人去怡紅院；另一個玉兒是誰呢？
顯然不是黛玉。賈母帶著劉姥姥等人遊逛大觀園第一站就是黛玉的瀟湘館。黛玉非常得體，讓座讓茶。劉姥姥讚歎：“這裡比上等書房還精緻！”
另一個玉兒可能是妙玉。賈母等人吃完酒後就去櫳翠庵，她對妙玉仍有幾分體諒，藉口“剛吃完酒怕衝撞了菩薩”而讓眾人只在院子裡。
妙玉奉茶，賈母還未接茶，先說道：“我不喝六安茶。”妙玉答道：“我知道，這是老君眉！”
這兩個人為何如此熟稔？賈母平時很少遊逛大觀園，妙玉一直待在櫳翠庵深露簡出。她倆為何知道彼此的生活細節？
賈母知道妙玉通常用六安茶招待客人，妙玉知道賈母平常喝老君眉。
由此可見，賈母和妙玉的關係非常特殊。賈母口中的兩個玉兒，其中一個很可能就是妙玉。
妙玉沒有拿出梅花雪水煮茶招待賈母，卻拉著黛玉和寶釵去喝體己茶，後來寶玉偷偷跟來。
寶釵是一個陪客，期間沒說一句話；寶玉也是一個陪客，雖然他說了很多話，卻被妙玉擠兌踐踏。可見，妙玉真正要招待的人是黛玉。
後來，榮國府中秋月黛玉和湘雲在凹晶館聯詩，妙玉出現後邀請她倆吃茶。期間湘雲這個話癆也是沒說一句話，可見，妙玉真正要招待的人也是黛玉，湘雲只是陪客而已。
妙玉和黛玉到底有什麼情分呢？
熟知妙玉底細的邢岫煙道出實情：“她被權貴所不容，被迫來到榮國府。”以當時的社會規則：權貴之間沆瀣一氣。偏偏權貴逼走妙玉後，又有權貴收留妙玉。可以推測，他們應該是一夥人即賈家。不然，妙玉早就死定了。
妙玉被逼走那一年，蘇州老家發生一件大事。林如海病逝，賈家派賈鏈帶著黛玉去處理後事。後來，黛玉又回到榮國府，只帶回筆硯書籍，林家財產不知所蹤。當寶玉轉送珍貴的手串時，黛玉擲地不取，嫌棄“什麼臭男人拿過的，我不要它！”
這裡可以推測，林家的財產已經悉數被賈家接管。妙玉修行的寺廟沒有了，黛玉繼承的家產也沒有了。
妙玉和黛玉同時天涯淪落人。《紅樓夢》開篇就提到過，林如海有幾房姬妾，奈何命中無子。妙玉很有可能是林如海的庶出女兒，黛玉的庶出姊姊。
如此一來就解釋了妙玉和黛玉的關係為何超越一般人，妙玉為何這麼討厭榮國府，連賈母都不肯逢迎，而榮國府卻不敢拿她怎麼樣。