在科索沃戰爭中，美國的F117隱身戰機發揮了重要作用，24架F-117A駐紮在意大利阿維亞諾空軍基地，主要擔負對南聯盟重要防空設施或高價值目標進行重點打擊任務。美國空軍利用F-117A多次在南聯盟主要城市和供電系統上空投放裝有BLU-114/B子彈藥的GBU-94石墨炸彈。這種新型彈藥通過拋撒碳纖維造成線網短路，導致南聯盟大範圍供電中斷，指揮控制中心停止運行。
1999年3月27日夜，一架編號為AF-82-806的F117隱身戰機被南聯盟的地空導彈打了下了。
至於該機是如何被擊落的，至今並沒有一個權威的說法。有人說是高射炮打下來的，證據是殘害上的彈洞，但是地空導彈破片殺傷戰鬥部的後效跟高射炮炮彈區別並不大。也有人說該機是被捷克的維拉反隱身雷達發現後，指揮蘇制S-125伯朝拉地空導彈將隱身戰機擊落。
還有另一個說法，南聯盟防空兵利用S-125伯朝拉地空導彈所配備的P-15/15M或者P-19目標指示雷達，配合PRV-10/11測高雷達，制導雷達不輕易開機暴露，依靠目標指示雷達或上級空情保障提供空情信息。由目標指示雷達提供概略方位數據，測高雷達提供概略高度數據。等目標進入防空導彈系統的殺傷區的必殺區以後，才打開制導雷達對目標精確測距測角，發射導彈殲滅目標。這種戰術與六十年代中國使用紅旗2導彈打擊來犯美製U-2高空偵察機，運用的“近快戰法”，以及通過57毫米高炮“鬆-9“雷達提供預警情報迷惑敵機的戰法類似。
但以上說法有個最大的問題，是S-125伯朝拉地空導彈採用全程無線電指令制導，其制導雷達是釐米波的，並沒有反隱身能力，所以不足以捕捉住F117隱身戰機的雷達反射信號。
那麼，F117又是怎麼被擊落的呢，原來是瞎貓碰了死耗子。
在當天夜晚的作戰行動中，作戰機群中除了F-117A以外還有美軍的F16戰鬥機。南聯盟部隊向F-16機群發射了一批S-125導彈。由於北約的電子干擾，南軍所射導彈全部偏航，無一擊中目標，發射陣地還遭到了轟炸。
南軍發射出去的S-125導彈在失去動力後相繼自毀，可萬萬沒有想到的是，竟有1枚薩姆-3 導彈沒有自毀，繼續沿拋物線飛行到了射程以外。湊巧的是，在這枚導彈下落過程中，美國那架F-117A正好飛到了該彈的下落彈道上。這枚無動力下落的導彈在F-117A上方爆炸，彈片擊中了這架隱身飛機。F-117A糊里糊塗的就被打了下來。
這個推斷就比較符合軍事常識，因為S-125伯朝拉地空導彈所配備的幾種米波雷達，由於波束比較寬，具有一定的反隱身能力，能夠概略發現F117的航跡。但制導雷達是釐米波的，沒有反隱身能力。所以擊落F117是一個小概率的偶然事件。
F117被擊落以後，美國也並未將其殘骸炸燬，主要原因是在F117屬於七十年代的隱身技術，其採用技術祕密已經過時了，多面體外形和早期的鐵氧體隱身塗層材料也並非什麼神祕技術。美國在科索沃戰爭結束以後，於2005年就將F117乙隱身戰機做了退役處理，2005預算財年規定要求10架F117在2007年退役，餘下的42架在2008年退役。
據當年我國人民日報駐南聯盟的記者回憶，在南聯盟防空兵擊落美製F117隱身戰機的那時間，F117的殘骸是對外公開展示的，甚至可以隨意拍照。南聯盟政府還邀請了好幾個國家的外交和軍事使團前去參觀。
那麼，這些F117隱身戰機殘骸到底去哪了呢？
妥妥的躺在貝爾格萊德尼古拉·特斯拉機場旁邊的貝爾格萊德航空博物館裡。這架美國F-117戰機的殘骸目前還在該博物館展出，裡面包括印有美國空軍標記的左翼、駕駛艙蓋、彈射椅、飛行員頭盔和無線電裝置等等。
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