垂直的B2B電子商務可以分為兩個方向，即上游B2B電子商務和下游B2B電子商務。企業既可以與上游的供應商之間形成供貨關係，也可以與下游的經銷商形成銷貨關係。面向製造業或面向商業的垂直B2B(又可以稱之為行業B2B)。
生產商或商業零售商與上游的供應商之間的形成供貨關係，如Dell電腦公司與上游的芯片和主板製造商就是通過這種方式進行合作。
生產商與下游的經銷商可以形成銷貨關係，比如Cisco與其分銷商之間進行的交易。 其中以中化網為首的網盛旗下網站成為行業B2B的代表網站，將垂直搜索的概念重新詮釋，讓更多生意人習慣用搜索模式來做生意圈，找客戶。垂直B2B成本相對要低很多，因為垂直B2B面對的多是某一個行業內的從業者，所以，他們的客戶相對比較集中而且有限。 垂直網站成功的關鍵
①垂直網站成功的最重要的因素是專業技能。一個垂直網站面對的是一個特定的行業、特定的專業領域，因此，網站本身應該對這個領域相當熟悉。
典型垂直網站的創始人往往對專業技能非常熟悉，他們通常是採購經理、技術部門負責人或者顧問。他們能夠洞察全行業的內外需求，能一針見血地指出各家“進場人市”企業的需要，並向他們提供靈活有效的各種解決方案。一旦他們的想法付諸實施，便會吸引很多傳統行業裡的年輕人加入進來。
②垂直網站成功的另一個因素是中間環節的整合。傳統行業的中間環節越多，環節鏈接效率越低，該行業的垂直網站就越有機會整合其中間環節，因此也就越容易成功。
③垂直網站吸引著更合格、更狹窄且經過預選的參與者，這種市場一旦形成，就具有極大的競爭優勢。所以，垂直網站更有聚集性、定向性，他們較喜歡收留團體會員，易於建立起忠實的用戶群體，吸引著固定的回頭客。結果，垂直網站形成了一個集約化市場，且客戶也多是有效客戶。因此這類電子市場是有價值的市場，他們擁有真正有效的購買者。 (3)垂直網站面臨的困難
①運作垂直網站需要較深的專門技能。專業化程度越高的網站，越需要投人昂貴的人力資本來處理很狹窄的、專門性的業務，才能發揮該虛擬市場的商業潛能。
②垂直網站市場面臨的最大挑戰是很難轉向多元化經營或向其他領域滲透，這是因其具備鮮明行業特徵的專門知識和客戶關係所決定的。
垂直門戶或者行業門戶B2B網站其實可以理解為綜合性B2B網站的一個特例，也就是定位於某個行業內企業間電子商務的網站，與綜合型的B2B網站相比，其特點是專業性強，並通常擁有該行業資源的背景，更容易集中行業資源，吸引行業生態系統內多數成員的參與，同時也容易引起國際採購商和大宗買主的關注。因此，近一個時期以來，垂直B2B網站成為了企業間電子商務中備受推崇的發展模式。但因為其涉及面窄，所以客戶數量的擴展受到一定限制。 水平網站：
面向中間交易市場的水平B2B電子商務交易模式，是指利用網上中介服務網站將買方和賣方集中到一個市場上來進行信息交流、廣告促銷、拍賣競標、商品交易、倉儲配送等商業活動。如阿里巴巴等都從事為傳統企業提供網上中介服務。
這種模式之所以稱為“水平”B2B電子商務，是因為利用這種模式的行業廣範、企業眾多，很多的行業和企業都可以在同一個網站上進行商務貿易活動。這種交易模式是水平
B2B，它是將各個行業中相近的交易過程集中到一個場所，為企業的採購方和供應方提供了一個交易的機會。
（5）水平網站成功的關鍵因素： ①業務處理流程的標準化程度
②業務及作業流程自動化處理專業知識 ③提供內容深層次自動化處理水平
④根據行業差異定製業務處理流程的能力
（6）水平網站的困境：
水平網站追求“全”，即行業全，服務全，但是這個“全”，使得水平網站要冒每一個行業都做不好的風險。
如何在“全”與“好”之間找一個平衡點，是水平網站目前面臨的一個需要解決的問題。