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金代末年，慶壽寺的住持是海雲禪師。海雲禪師是金末元初時的著名高僧，山西嵐谷寧遠人，俗姓宋，法名印簡，道號海雲。
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先後被蒙古貴由皇帝和蒙哥皇帝授權擔任全國的宗教領袖。元世祖忽必烈在稱帝之前便對海雲十分倚重，奉為“國師”；忽必烈鎮守漠北時，曾邀請海雲前去，諮詢有關佛教的問題，海雲特地把一位法名“子聰”的隨行弟子推薦給忽必烈，這位子聰和尚，就是後來成為元大都總設計師的劉秉忠。
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1257年海雲圓寂，忽必烈下旨為海雲在慶壽寺修築了一座9級靈塔，名為“天光普照佛日圓明海雲佑聖國師之塔”；海雲的徒弟可庵為海雲立了一座石碑，名為“大慶壽寺西堂海雲大禪師碑”。
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後來可庵繼任了住持，他圓寂後，又修了一座7級的靈塔，稱“佛日圓照大禪師可庵之靈塔”。由於這兩座塔，慶壽寺俗稱為“雙塔寺”。在海雲圓寂後的第三年，忽必烈稱帝，並開始修建大都城。
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由於雙塔正處在南城牆經過的位置上，有人建議將其拆除。但忽必烈決定讓城牆向南繞過雙塔，把它們圈進了城內。由於這一決定，雙塔得以留存了將近七百年。
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然而，到了近代由於建設長安街，慶壽寺恰在應當拆除的位置。
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當時，建築學家樑思成提出，將這兩座古塔保留在道路中央，建成環島，既能保護古蹟，又可豐富街道景觀。但是，他的建議遭到副市長吳晗的堅決反對，雙塔終於徹底消失了。
