這個我覺得有以下幾方面原因：
1、索額圖輔佐的是太子，是未來的皇上；明珠黨爭幫的是大阿哥。而皇太子在康熙心中乃是至寶，誰把太子帶壞了，就弄死誰。
歷史記載太子的老師徐元夢只會讀書不會騎射，一次隨陪康熙和太子射箭，被康熙一頓訓斥，而他辯解幾句，康熙聞聽勃然大怒，立即命人將徐元夢按住，當著皇子們的面，一頓板子，打成重傷，史載“且走且打，所過處血皆遍地”。這鞋劣跡不算，康熙還下令抄了徐元夢的家，而且要把徐元夢的父母發配到黑龍江去。可見康熙對胤礽的重視，凡是給他的都是最好的，給不了他最好的人就打他，更何況像索額圖這種帶壞了他的人就更應該弄死。
而大阿哥雖是長子，但在古代的庶長子，就是嫡子的奴僕，自然而然他的人平時不用那麼重視，他被帶壞了，也就算了，反正庶長子多的是。
我記得有個故事說的一個末代皇帝說的，國家亡了，你們可以做下一個朝代的臣子，而我是皇帝唯有死路一條。而黨爭也就是這樣吧，幫著其他皇子，大不了以後就不做官了，而幫著皇太子的人一旦失敗必死無疑吧。
2、跟兩個人的性格有關係，《清史稿·列傳五十六》中有一段這樣的記載，“索額圖生而貴盛，性倨肆，有不附己者顯斥之，於朝士獨親李光地。明珠則務謙和，輕財好施，以招來新進，異己者以陰謀陷之，與徐乾學等相結。索額圖善事皇太子，而明珠反之，朝士有侍皇太子者，皆陰斥去。薦湯斌傅皇太子，即以傾斌。”
就是說索額圖，生的富貴權利很盛，這個人傲慢無禮很放肆，有不附和他的人就明顯排斥，而明珠這個人和謙和，好善樂施，用來招攬朝中新貴，不會表面上跟你過不去，都是用陰謀排斥異己。說明索額圖得罪的人很多，希望他死的人也很多，而明珠應該朝中人緣不錯吧。
我在寫了一篇文章《侍衛明珠遇上康熙大帝，如何職場投機一躍成為宰輔》
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3、兩個人對康熙大老闆的態度不一樣
明珠善於看風向拍領導馬屁，事事都順著康熙，康熙喜歡讀書學習，明珠就廣納賢士，家裡面有藏書樓，藏有很多善本，他兒子納蘭性德和納蘭奎敘都是一代大家，深得康熙喜歡。
康熙想撤藩，明珠寧願跟大多數朝臣站在反立面也要全力支持。康熙說收復臺灣，明珠就擼起袖子加油幹。
而索額圖是索尼的兒子，在早期捉拿鰲拜中有功。後來就不得了了失控了，為了太子黨的利益，是反對撤藩的。
不管這黨那黨，跟大老闆過不去就得成為去世黨，如果你是大老闆即使再喜歡二老闆，你會不會弄死他這個不聽自己話的心腹？
4、兩個人倒臺的時間節點不一樣
康熙二十七年的時候，明珠被彈劾，緊接著倒臺，康熙把他發往侍衛處酌情留用，他的倒臺很大的說辭是結黨營私、買官賣官、貪汙受賄，其實有很大一種說法就是康熙為胤礽即位掃清明珠這個障礙。別忘了在封建社會，康熙不就是最大的官位販子、貪汙販子嗎？所以這些罪名在康熙嚴重是可以原諒的。
而康熙四十二年，在太子漸漸失去康熙的信任後索額圖倒臺，後數年後康熙說，“索額圖助允礽潛謀大事，朕知其情，將索額圖處死。今允礽欲為索額圖報仇，令朕戒慎不寧。”幫著兒子反老子，這個罪名是不可以被原諒的了，所以，弄死索額圖沒說的。
明珠和索額圖雖然都是滿人出身，但出身不同，註定軌跡不同。明珠在發跡之前家庭已經敗落，所以他的成功可以看做是個人天賦和後天努力的成功，尤其在削藩問題上，明珠態度堅決，旗幟鮮明的支持剛剛親政不久的康熙，而明珠淡薄的家事背景又不會牽扯太多裙帶關係，容易施恩，易於控制，所以康熙既需要明珠，明珠也符合康熙當時的需求，由此奠定此後數年的相位，後期的明珠雖然價值下降，但地位高聳，可以用來制衡朝堂，依舊有利用價值。
索額圖的父親是索尼，他本人更是孝誠仁皇后的三叔，太子的叔外祖父，世襲一等公，這就註定他比明珠走的容易，當然也不能否定索額圖對於清廷的貢獻，擒鰲拜，平葛爾丹索額圖都是有功勞的，但索額圖的忠心更加複雜，他不但要考慮自己，還要考慮家族千秋萬代的榮寵，所以他在為康熙辦事的同時，想的更多，想的更遠。
但這恰恰是最危險的地方！
但凡大有為之君，都忌諱大臣提前站隊，索額圖的身份註定他要站隊，不幸的是，他趕上了中國歷史上最波雲詭異的奪嫡大戰，九子奪嫡，更不幸的，他的外孫子不爭氣，一把好牌打的稀爛，索額圖站錯隊了！
錯了就的死！
侄女婿康熙更是希望通過處死索額圖這隻雞給那些不安分的猴子大臣們提個醒，權力還在我手裡，你們小心點，別瞎站隊。所以索額圖更是非死不可了！
明珠的失勢可以看做是鳥盡弓藏，失去了利用價值，皇帝對他貪汙腐敗的罪行不再容忍，但基於他的貢獻和危害性，給他善終。
索額圖的罪行已經動搖了國本，所以縱然有大功有親戚關係，康熙也不會放過他，不但自己被圈禁而死。兩個兒子也被牽連致死，還背上了“本朝第一罪人”的惡名，永世不得翻身。
一切都是權力惹的禍！
我是歷史達人日慕鄉關，歡迎關注！
“天要平，殺老明；天要安，殺索三”貌似納蘭明珠和索額圖都是一路貨色，但同樣參與朋黨之爭和九子奪嫡的下場卻迥然不同，這點確實令人奇怪。
朝中大員很少有不結黨的，或明或暗而已，有政治上的對手，就會有政治上的袍澤。誰還沒個朋友。這些康熙都懂，別出圈就行。
明珠不是大爺黨麼，也參與的黨爭，他咋沒死哩？
沒錯，可是胤褆智商偏低，過早的被圈禁，失去了政治舞臺上繼續表演的機會，這對納蘭明珠來說可能也是好事吧，而索額圖就沒那麼幸運了。
先看活活被餓死的索額圖：
一句話就夠了，挑撥胤礽和康熙的父子關係，教唆胤礽造反······胤礽的老師都是康熙欽點的，唯一能教太子這些東西的也只有索額圖了，教壞了康熙最喜歡的兒子，教壞了未來的大清皇權繼承者，僅僅弄死他就非常給索尼面子了。
康熙：“索額圖誠本朝第一罪人也”。啥意思？從語氣和態度上來說，康熙對索額圖恨到家了！
相比之下，納蘭明珠還算好點，起碼胤褆想親手解決胤礽，還當著康熙的面請示，這種沒腦子的事情，康熙知道，絕不是明珠教的，明珠傻不到那種程度，不用猜就知道，完全是胤褆本性使然。退一萬步講，即便教壞了，皇位也沒有庶長子啥事，但胤礽可不同。明珠最後被拿下的藉口也就是諸如賣官啦，結黨營私啦，等等，這些康熙早就知道。最後的結果僅僅算是狠狠敲打了一下，已經法外開恩了，並且雖然康熙對明珠不復重用，畢竟還是又給他官復原職，還要怎樣，明珠真該謝恩才是。
明珠的事情，索額圖的事情，康熙明察秋毫，不是不辦，而是等雙方都作死做到頭了再說，其實何嘗不是給二人機會呢，可惜，誰都沒報握住。
首先要說這兩人相同點，都是滿洲親貴，屬於自己人，這也是獲得康熙信任的基礎。明珠為人八面玲瓏，處事老道圓滑，能力強，是康熙能用的幹才，他斂財不蓄財，納賄所得全都慷慨施惠予同僚部屬，廣結善緣，這也是明黨人馬眾多的一個因素。康熙重用明珠也是制衡索黨的手段。索額圖是太子外戚，早早就捲入皇儲爭鬥，犯了康熙大忌，作為政敵明珠洞若觀火，出於脣亡齒寒之心，明珠也曾暗示過索額圖，索額圖自恃身份顯要反而更加敵視明珠。後來為警告索額圖收斂，康熙先整治了明珠，意在打擊朋黨，索額圖依然不知收斂，終於惹來大禍。而明珠在打擊索黨過程中有功，康熙就此放過明珠。整個過程其實比凌解放的小說要精彩複雜的多，內中曲折多有反轉，是康熙帝王權術的淋漓發揮
索額圖是清初四大輔臣的索尼的兒子，是皇后赫舍裡的叔叔，在輔佐康熙的過程中都立下了汗馬功勞。在朝廷中大有權勢，後來甚至結成了太子黨，威脅到皇權。被皇帝下令拘禁。
那蘭明珠是葉赫部族人，說起來還是愛新覺羅氏的仇人，但康熙不避前嫌重用了他，讓他感激涕零。明珠還是個很有才的人，把政務處理得井井有條，在撤藩大事上力主撤藩，與皇帝保持一致，後組成長子黨與索額圖抗衡，因貪汙受賄被皇帝撤職。
他們兩人下場不同是因為索額圖是觸犯了皇權，對這種事任何朝代都不會手軟。
