段祺瑞號稱北洋三傑之一，是袁世凱手下最能打的一員虎將。袁世凱死後，北洋軍群龍無首，瞬間分化為諸多派系。作為元老之一的段祺瑞當然也有自己的嫡系，因為家鄉的原因被稱為皖系。
民國有一個高危職業，就是國家元首。誰一旦有幸掌控北京，就會成為眾矢之的，迅速走向滅亡。其實這與民國的建立太過容易有關，一個朝代的建立，往往要經歷數十年的殺戮，最終由最強者收拾殘局。民國僅僅通過清帝的一張退位詔書就成立了，沒有人有足夠的威望令天下臣服，即使是袁世凱也做不到。
段祺瑞很不幸的成為了袁世凱之後的第一任國務院總理。按照袁世凱的遺囑由黎元洪做總統，但真正掌握實權的還是段祺瑞，這也為後來的府院之爭埋下了伏筆。
執掌時局後，段祺瑞名義上是天下共主，實際上卻是諸路軍閥的眼中釘。而段祺瑞卻行事高調，不知韜光養晦。尤其是他的得力干將徐樹錚驕陽跋扈，四處樹敵。
於是，沒過多久就爆發了直皖戰爭，這是北洋兄弟之間的第一場大戰。有趣的是段祺瑞曾是保定軍校的總辦（校長），而直系的總指揮吳佩孚則畢業於保定軍校。所以段祺瑞戰敗後氣恨的說：“吳佩孚學問不錯，兵練得也不錯，學會打老師了”。
短短五天的時間，就宣告戰爭結束，段祺瑞的皖系幾乎全軍覆沒。段祺瑞的慘敗主要有以下幾點。
第一，輿論。段祺瑞的掌權離不開日本人的支持，並曾向日本人借了5個億的外債。吳佩孚將這一事件公佈於眾，利用人們仇日的心理，讓自己站在了道義的一邊。再加上，段祺瑞的強勢，連續得罪了黎元洪、馮國璋、徐世昌等歷屆總統，孤立無援。
第二，實力。直皖戰爭段祺瑞面對的敵人卻不只是曹錕、吳佩孚。正當兩軍打的難解難分時，奉系的張作霖帶領東北軍順勢南下，攻擊皖系。段祺瑞腹背受敵，形勢急轉直下。
第三，指揮。段祺瑞雖然崇尚武力，但是缺乏對行動的總體籌劃，隨意性大。皖系掌權後，將領也變得腐化起來，缺乏作戰決心和吃苦精神。徐樹錚、靳雲鵬、段芝貴等難堪大任，並且不和，所以當時流傳著皖系無大將的說法。
而對手中的吳佩孚則是登上美國時代週刊封面的第一個中國人，指揮若定，很有軍事才華。更重要的是，對直系、奉系來說是生死之戰，打贏了就可以掌控北京，動力十足。
下野後，殺人如麻的段祺瑞竟跑到天津，過起了吃齋唸佛的生活。
當時對怎樣統一中國有兩種觀點，文統和武統。當然前者深得民心，但是歷史告訴我們這是不可能的。段祺瑞選擇的是後者，最終還是失敗了。這與他的剛愎自用有關，與當時的時局也有關。
歷史，素顏一些會更美。我是素顏歷史，期待您的關注。
我是薩沙，我來回答。
直皖戰爭失敗的關鍵，在於3點。
第一，奉系軍閥張作霖支持直系。
客觀來說，直皖實力相差有限，雙方完全可以周旋。
當然直系軍隊戰鬥力較為強悍，但也絕對不會區區5天就打完了。
此戰中，段祺瑞被張作霖忽悠，誤以為張帶兵南下是來助戰的。
段祺瑞全部的部署，都是把張作霖當做盟友至少是中立。
然而，張作霖卻在段祺瑞還沒有陷入頹勢的時候，趁火打劫，全面進攻。這導致段祺瑞全線潰敗，迅速垮臺。
第二，皖系軍閥其實沒有太多嫡系部隊。
袁世凱死後，段祺瑞實際上繼承了袁的地位。
袁世凱是所謂北洋的唯一領袖，可以掌控所有北洋軍，北洋軍就是他的嫡系。
段祺瑞也是這麼認為的，所以他開始並沒有什麼嫡系部隊，因為原則上北洋軍包括直系祖宗馮國璋在內，全部都是他的部下。
然後段祺瑞不是袁世凱，即便袁世凱在後期也難以控制北洋軍。
段祺瑞很快發現馮國璋之流形成了山頭，成為擁兵自重的土皇帝，根本控制不住。
所以，段祺瑞開始扶持自己的嫡系，比如藉助向一戰編組自己的參戰軍，後來又編組了西北軍。但這兩支部隊的規模都不大，不過幾萬人而已，而且基本沒有實戰經驗。
這種軍隊裝備訓練雖好，哪裡是百戰老將吳佩孚和曹錕的對手。
其餘都是附庸段祺瑞的軍閥部隊，完全不可靠。
比如皖系軍隊第15師，甚至是馮國璋舊部，此戰中直接火線倒戈投降。
此戰中，直系是佔有很大優勢的。開戰之前，直系和他的盟友其實已經從4個方向包圍了皖系軍閥盤踞的河北核心地區。
此戰還沒打，皖系軍閥就敗了七八成。
第三，將帥不和，素質低劣
部隊數量有限，更重要嫡系部隊將領也矛盾重重。
段祺瑞心腹大將徐樹錚樹敵太多，幾乎沒有朋友，尤其同大將曲同豐有仇。
此戰中，段祺瑞為了防止兩人出問題，讓他們分別帶領部隊分頭作戰，導致皖系軍閥部隊其實是分散且互相沒有支援，自然會被直系個個擊破。
除了不和以外，將領素質很差。比如西路總指揮曲同豐，莫名其妙被人抄了司令部，被活捉到了，導致西路軍自潰。
其他軍官也很爛。
東路軍徐樹錚開始打得不錯，後來發現戰局不利，竟然扔下部隊自己逃走，導致東路軍潰散。
而在東西路軍之上的總指揮段芝貴，更是一坨屎。在戰局不利的時候，段芝貴仍然不忘記在專列上搓麻抽菸。結果當晚突然聽到幾公里外有槍炮聲，就溜得不知去向，連衛兵都找不到他。直到第二天，衛兵才在附近一個農家柴草堆裡找到段芝貴。
如此軍官，部隊哪裡有戰鬥力。
嫡系邊防軍第1第2第3師，均是直接投降或者將領扔下部隊逃走後投降。
西北軍第1第2第4旅也是將領或逃或投降，餘部自行潰散。
作者：金滿樓
通常來說，稱段祺瑞是軍閥其實是有些名不副實的。
為什麼這樣說呢，軍閥第一要有自己的軍隊，第二要有自己的地盤，擁兵自重，這才是軍閥最起碼的前提條件。
但這兩挑，段祺瑞卻是沒有的。當然，沒有並不代表老段就沒搞過，只是他用人不對、運氣不佳，沒有做好而已。
和那般北洋同僚們一樣，段祺瑞是天津武備學堂畢業，之後送到德國留學，回國後跟隨袁世凱小站練兵，由此風生水起。
但在民國年後，他不想其他同僚分駐各省而是留守京城，所以沒有自己的地盤，說他是皖系軍閥的頭目，未必恰當。
不過在一戰後期、俄國發生革命後，在日本的幫助下，段祺瑞確實編練過一支參戰軍。
1918年8月，參戰軍訓練處成立，靳雲鵬任督練，軍官教導團和軍士教導團分由陳文運和曲同豐擔任團長，專門負責這支新軍隊的編練事務。
按約定，參戰軍的軍費均來自日本借款，其使用的武器裝備也都從日本購買，訓練方式也完全採用日本那一套。
參戰軍軍官教導團，主要從保定軍校中的優秀畢業生和接近皖系的初級軍官中抽調組成，訓練結束後分派到參戰軍擔任初級軍官；
軍士教導團則從皖系的北洋各師抽調優秀士兵前來受訓，受訓三個月後分派到參戰軍充當軍士。軍士教導團共六個營，總人數3200人。
軍官教導團和軍士教導團訓練結束後，隨即赴安徽、山東、河南等地招募了三萬多名新兵，並於1919年1月正式成軍。
參戰軍共分3個師：第一師師長曲同豐，駐北京北苑；第二師師長馬良，駐山東濟南；第三師師長陳文運，駐北京南苑。
參戰軍的武器裝備都來自日本，每師轄兩個步兵旅，一個炮兵團，一個騎兵團，另有工兵、輜重、機關槍各一營，總兵力一萬餘人。
炮兵團轄三個營，每個營轄三個連，每個連有火炮四門。機關槍營則共四個連，每連有重機槍六挺。
就武器裝備、訓練水平、兵員素質等方面來看，參戰軍算得上國內軍隊的佼佼者，不過，參戰軍有一重大隱患，那就是成軍時間太短，缺乏實戰經驗。
後來，計劃中的對俄作戰實際並未執行，這支部隊之後又轉為了邊防軍。
1920年，這支部隊和曹錕吳佩孚的直系軍隊發生“直皖戰爭”，結果不到三天，就被吳軍全部消滅。所以說，光好看是一點用都沒有的。
段祺瑞作為袁世凱之後北洋軍閥三大派系之中皖系軍閥的首領，自然是有他的嫡系部隊的。
需要說明的是，段祺瑞雖然是袁世凱手下的重要心腹、北洋三傑之一，也是袁世凱死後第一個執掌北洋政府的軍閥。但是段祺瑞的嫡系部隊卻根本就不是繼承自當年袁世凱創建北洋六鎮，而是段祺瑞在執掌北洋政府之後才創建的。
實際上，當年袁世凱核心力量：北洋六鎮，在頻繁的人事調動之後，基本上和段祺瑞沒有太多關係的。反倒是以馮國璋、曹錕、吳佩孚為首的直係軍閥，掌握了其中不少的力量。另外張作霖的奉系，雖是北洋三大系之一，卻不是北洋嫡系，是張作霖自己發展起來的。
段祺瑞之所以能在袁世凱死後第一個執掌北洋政府，靠的是出色的政治手腕，而不是軍事實力，當時段祺瑞手中所有的力量無非就是倪嗣沖、盧永祥、李厚基、張樹元、陳樹藩等擁護者的地方部隊，而且只能間接控制。段祺瑞也很快就感受到了手中沒有嫡系部隊的痛苦：
在北洋政軍和南方的革命軍戰鬥的時候，前線的吳佩孚和馮玉祥都是直系軍，而直系向來是主張南北議和，和段祺瑞的武力統一完全是背道而馳。因此當吳佩孚和馮玉祥在前線駐足不前時，段祺瑞毫無辦法！
痛定思痛之後，段祺瑞決定要組織自己的嫡系部隊。
因此在1917年的時候，段祺瑞假借著參加第一次世界大戰為名，利用日本人經費支持，組建了3個師的部隊，35000人左右，名為“參戰軍”，統帥為靳雲鵬（段祺瑞四大金剛之一）。所謂“參戰軍”只不過是個幌子，等到參戰軍組建完畢之後，第一次世界大戰都已經結束幾個月了，因此參戰軍改名為邊防軍。
此外，段祺瑞還讓自己的心腹大將徐樹錚夥同奉系軍閥劫持了一批北洋政府的軍火，然後用這批軍火武裝了5混成旅，改編為西北邊防軍，統帥為徐樹錚（段祺瑞四大金之一）。後來徐樹錚收復外蒙古，正是靠的西北邊防軍。
也就是說，段祺瑞手中有兩隻嫡系部隊，分別是邊防軍、西北邊防軍。（補充一下，西北邊防軍中的5個混成旅，有4個旅長出自舊時奉系，只有一個是皖系）
直皖大戰爆發後，雙方雷聲大，雨點小，雙方罵了一個多月，真正交戰的時間卻不過區區5天，段祺瑞的嫡系部隊和其附庸便被擊潰了。
其中的原因主要一下幾個：
1、直皖大戰，實際上上直系和奉系聯合對付皖系。說白了，就是段祺瑞1打2，輸了也是正常。
2、皖系沒有大將。皖系將領中，除了徐樹錚之外，根本拿不出一個像樣的軍事人才來，像段芝貴這種，前方在大戰，他在後面打麻將，你說這戰怎麼打？即便是徐樹錚，比起吳佩孚來，差的不是一點半點。
3、皖系內部並非鐵板一塊。段祺瑞最為倚重的兩位大將靳雲鵬和徐樹錚兩人之間勢同水火，其矛盾之深，甚至超過皖系和直系之間的矛盾。別人還沒有打過來，內部先打起來了。再加上前面說的，西北邊防軍裡面還有不少奉系出身的將領，段祺瑞內部已經不攻自破了。
直皖大戰之後，段祺瑞的嫡系部隊被直系和奉系兼併，他的擁護者是倪嗣沖、李厚基、張樹元、陳樹藩的隊部基本被幹掉，戰後段祺瑞所能掌控的軍隊不過盧永祥手中的隊伍了；1924年，盧永祥的隊伍在上海被幹掉了；1925年，徐樹錚被馮玉祥暗殺，段祺瑞徹底變成了光桿司令。
謝邀。
段祺瑞為“北洋三傑”之一（另兩人是馮國璋、王士珍）。袁世凱創立北洋六鎮，段祺瑞陸續擔任過第三鎮、第四鎮、第六鎮的統制。辛亥革命爆發時，段祺瑞已經官至北洋軍第二軍軍統，是北洋軍中除袁世凱外的第二號人物，北洋系的頭號大將。武昌起義爆發後，北洋軍趕赴湖北鎮壓革命軍段祺瑞受命南下兼任第一軍總統官，全權主持前線作戰指揮工作。
以北洋軍的實力攻克武漢三鎮本無懸念，而段祺瑞得袁世凱面授機宜，在前線取得有優勢後沒有一鼓作氣打垮革命軍而是三分真打，七分假打。另一邊北洋軍也與革命黨開始談判，在革命黨迫於形勢作出妥協後，1912年2月5日，以段祺瑞為首的第一軍所有將領通電逼迫清廷退位，倡議共和。
1913年3月20日，宋教仁上海遇刺，兩日後逝世。孫中山號召革命黨人共同討伐袁世凱，史稱“二次革命”。北洋政府果斷出兵開始了鎮壓，段祺瑞全面負責調兵及統籌指揮，發揮了重要作用。
後來袁世凱欲獨攬北洋大權開始架空段祺瑞，兩人之間的矛盾日益尖銳。後來段祺瑞和馮國璋帶頭反對簽訂《二十一條》無果，心灰意冷下段祺瑞稱病辭職，隱居西山不問世事。
後來在內外交迫之中，袁世凱宣佈退位，繼續實行內閣制，並且任命段祺瑞為國務院總理。袁世凱死後，北洋軍閥內部分裂成了直、奉、皖三派，其中段祺瑞為皖系首腦。當時的直系首腦是馮國璋，而段祺瑞得皖系控制著北京的實權兩派為爭奪北洋軍閥內部的話語權一直明爭暗鬥。
後來馮國璋去世，直系的曹錕成為了首腦，曹錕這個人比較激進，而當時的內閣想壓制段祺瑞沒有成功，段祺瑞想把內閣趕下臺。直系的曹錕趁著這個機會全力挽留內閣，而張作霖明著居中調和，實際上在拉偏架，話裡話外都在偏袒直系。
這個時候段祺瑞已經不滿直系、奉系的暗中聯手，有了開戰的心思，但是迫於各方面壓力沒有發作罷了。
1920年6月27日，吳佩孚發表《告邊防軍西北軍書》，矛頭直指皖系將領徐樹諍，明著要“清君側”，實則是打擊段祺瑞。當時的總統徐世昌本來就不滿皖系把他當傀儡，有了直系軍事力量的支持，直接下令免去徐樹諍的職務。吃了虧的段祺瑞，準備武力威懾直系。但是直系和奉系已經做了武力解決爭端的決定。
1920年7月14日，直皖戰爭打響。皖系動員兵力包括邊防軍第一師一萬一千人，第三師一萬一千人，陸軍第九師八千人，第十三師八千人，第十五師八千人，西北軍八千人，學生隊三千人，共計五萬七千人。
直系動員吳佩孚的第一師一萬一千人，第二、三、四混編旅兩萬四千人，一個擴充旅六千人，曹錕衛隊三千人，警備隊一萬一千人，共計也是五萬七千人。另有張作霖暗中派出的東北軍兩個旅挺進山海關暗中幫助直系，這樣一來兵力上直系已經佔據了優勢。
7月16日夜天降大雨，直軍前線總指揮吳佩孚果斷利用這一時機大舉進攻皖軍陣地。大雨使得皖系部隊的兵器優勢無法發揮，最終全線潰敗，7月18日，段祺瑞請求徐世昌下令停戰。19日段祺瑞辭職，後來段祺瑞去了天津隱居，再不過問世事。
直皖之戰中，皖軍的技術兵器是佔優勢的。但是直軍前線總指揮吳佩孚是當時中國最優秀的軍事將領，而且與直軍協同作戰的東北軍也是驍勇善戰之軍，皖系五天戰敗也就不足為奇了。
直皖戰爭是發生在1920年7月14日到18日，皖系軍閥段祺瑞和直係軍閥曹錕、吳佩孚之間暴發的軍閥混戰，戰爭以皖系軍閥段祺瑞完敗、直係軍閥勝利為結果，隨後，時任國務總理的段祺瑞下臺，直系的曹錕和奉系的張作霖開始聯合執掌北京政權。
號稱“北洋之虎”的段祺瑞，皖系軍閥首領，是自袁世凱、黎元洪、馮國璋之後，從1916年到1920年北洋政府的實際掌權者，也就是說，這5年間，北京的政權實際掌握在皖系軍閥手中，統治著從奉天（今遼寧）到浙江沿海各省、黃河流域沿隴海路各省、長江中下游各省和東三省、熱河、內蒙古等地。
當時，北洋政府有幾股貌合神離的勢力，一者當然是皖系的段祺瑞，在北京政府、津浦沿線和上海有相當大的力量，掌握安徽、浙江、福建、湖南和陝西；二是張作霖領導的奉系，據有東三省；
三是先由馮國璋、後由曹錕、吳佩孚掌握的直系，勢力集中在長江中下游和京漢沿線各省；四是長江的三個督軍，包括江蘇的李純，江西的陳光遠，湖北的王佔元。當時，北京政府之外的南方還有許多軍閥，包括唐繼堯的滇軍，陸榮廷的桂軍，另外廣州還有孫中山領導的護法政府。
為什麼會暴發直皖戰爭？因為段祺瑞認為，南北必須統一，要統一南北，北洋政府必須團結一致，但南北分裂使地方軍人可以投機取巧，左右國政，因此，他特別反對督軍干政，尤其是南方的督軍干政，而南方的幾大督軍，都是直系的。為此，北洋幾大軍閥在一起開了天津會議，後又開了漢口會議，第二次天津會議。但由於南北統一戰爭，要以江蘇、江西、湖北為運兵通道，長江三督軍極力反對，北洋內部因此有了裂痕。段祺瑞又聯繫張作霖的奉系來對付其他北洋勢力，北洋分裂進一步加深。後來，皖系又與奉系鬧得不愉快。
1980年3、4月間，直系和奉系在政治上取得了很多共同點，皖系與直系的矛盾卻越來越大，最後便暴發了直皖戰爭，最後以段祺瑞的皖系軍閥失敗告終。
段祺瑞雖然掌握了北京政府，但他卻沒有一支佔據一定區域的嫡系部隊，他的軍隊是日本人支持建立起來的，軍費也是借款，但軍隊太過分散，又缺乏集中有效的領導，打起仗來便大敗虧輸。比如開戰後，皖系第一路軍劉詢的第十五師便不戰而退，讓吳佩俘輕而易舉地把第二路軍給包圍了。
還有，在訓練有素的直系軍的進攻下，直隸、河南、甘肅、陝西、安徽的皖軍紛紛投降，大部分改編成了直系。戰爭熱熱鬧鬧地打了5天，段祺瑞的所謂皖軍，很多瞬間就投降了直系，這在民國戰爭史上，是一個大笑話。
人少，準備不足。
其一：段祺瑞的皖系軍閥之所以失敗的根本原因當然是因為人少（當時直系和奉系合作，所以算是兩系打一系）以及吳佩孚的“閃電戰奇襲”戰策略，換句話說，人家是以大優勢，大人力，並且攻其不備，所以段祺瑞的皖系怎麼換姿勢都是個“死”。當然了，還有一些其他的因素，但是和這兩樣比，就不算什麼了，比如說後來的皖系本身軍心不齊，調動困難等等。
其二：段祺瑞有自己的嫡系部隊，也就是私人武裝—中央軍，關於中央軍的由來是這樣的。在段祺瑞趕走“張勳復辟”的辮子軍，用傀儡徐世昌上位中華民國大總統之後，段祺瑞就宣佈加入一戰的協約國。
不過宣佈加入歸加入，跟沒有加入其實一點區別也沒有，況且這個時候一戰都快打完了。當然了，段祺瑞的重點其實就是要個名義。於是1918年8月，他便以這個名義籌建參戰軍備（那邊都基本打完了），並且得到了日本的經費扶持。到了次年1月，3個師被段祺瑞整編成功，錢、裝備、編制全部都是日本給的。
但是人家一戰都打完了呀，總不可能現在把這3個師派過去，於是這支部隊就順理成章稱為了段祺瑞的嫡系隊伍。
段祺瑞，清末民初風雲人物，北洋軍閥創建者之一，袁世凱的左膀右臂，號稱“北洋之虎”；1916年袁世凱死後，段祺瑞帶領皖系軍閥把持北京政府大權，以正統自居，權勢滔天。但是就是這樣強大的段祺瑞和皖系軍閥卻在1920年的直皖戰爭中，短短5天就一敗塗地，段祺瑞勢力從此一蹶不振，這是為什麼呢？
首先段祺瑞缺乏自己的嫡系部隊，軍閥的權力來源於自己手中的軍隊，段祺瑞缺乏嫡系部隊使得權力不穩。在整個北洋體系中別看段祺瑞位高權重，卻很少有在一線領軍的機會，主要是進行統籌全局、軍官教育培養的工作，北洋軍官多是他的門生故吏，這使得段祺瑞威望很高，但是一旦發生利益衝突，這種師生關係也就不好使了。
身為軍人的段祺瑞也明白依靠他人軍隊不是長久之計，因此1917年段祺瑞把持中央政權後，以參加一戰為名編練參戰軍，到1919年共編成了三個師，這些才是段祺瑞的嫡系部隊。但是1920年就爆發了直皖戰爭，剛剛完成編練、作戰經驗稀少的參戰軍對陣直系、奉系的聯手進攻還是太弱了。
其次段祺瑞的心腹徐樹錚使得皖系樹敵太多。徐樹錚是段祺瑞的老鄉，1901年兩人相識後就非常投緣，徐樹錚成為段祺瑞的主要助手和代言人，在皖系發展過程中出力甚大，但是徐樹錚權力慾極重、手段陰險狠辣、囂張跋扈得罪了太多的人。
比如北洋軍閥內部都是沾親帶故，互相之間的爭鬥基本不會傷及性命，但是徐樹錚就打破了這個潛規則，1918年6月直系元老陸建章在參加督軍團聚會期間，因為政見不合被徐樹錚誘騙槍殺，這件事是直皖決裂的導火索，也激起了中間派系對於皖系的不滿。再比如段祺瑞為了壓制直系勢力，大力拉攏奉系軍閥張作霖，但是徐樹錚擅自挪用撥付給奉軍的軍費數百萬元，更是多次派人暗殺奉系軍閥首領張作霖，造成奉系勢力放棄“中立”，倒向了直系陣營。
徐樹錚不只是得罪外人，在皖系內部他也仗著段祺瑞的寵信大肆攬權，造成皖系內部分化，削弱了自身的力量。到1919年，形成了一個以直系、奉系為核心，勢力範圍遍佈七省的反皖同盟。
再次皖系軍閥勢力分佈過於分散，難以形成合力。皖系軍閥是建立在段祺瑞的崇高威望上的，因此佔據的地盤很分散，北京周邊、安徽、山東、上海、浙江、福建、陝西是皖系的主要勢力範圍，基本上沒有連接在一起的地盤，實力分散容易被各個擊破。而1920年的直皖戰爭中，皖系的迅速戰敗也證明了這一點。
最後段祺瑞等皖系軍閥將領在軍事上缺乏總體規劃。直皖爭端中是皖系首先提出了“武力解決”的口號，但是皖系在戰前卻準備不足，反而讓直系率先展開進攻；另外皖系將領盲目輕敵、私心太重、兵力部署非常隨意，造成東西兩路大軍缺乏合作，被直系將領吳佩孚抓住機會突襲了皖系的前線司令部，皖系部分高級將領被俘投降，造成皖系全線潰敗。
北洋軍閥皖系首腦、內閣總理段祺瑞與直系首腦、代理大總統馮國璋在國事問題素有爭議，引起了府院之爭，後來兩人同時去職。
段祺瑞
馮國璋下臺後，回老家河間閒居；而段祺瑞卻以參戰督辦的名義繼續在北京政壇呼風喚雨。原來段祺瑞政府在一戰爆發後宣佈參戰，成立了督辦參戰事務處，由段自兼參戰督辦。
我們常說段祺瑞是皖系軍閥，其實他長期在中樞任職，擔任陸軍總長和國務總理等要職，並無自己的嫡系部隊和地盤，算不上嚴格意義上的軍閥。宣佈參戰後，段祺瑞編練了一支參戰軍，這是段祺瑞的親信部隊。段氏先後向日本借款3000萬元，購買了12萬5千支三八步槍、372挺機關槍、318門山炮和228門野炮。至段祺瑞下野時，已經編練了參戰軍3個師，而此時第一次世界大戰已經結束。
段祺瑞編練參戰軍的目的是為了武力統一南北，一戰結束後已無戰可參，有人提出要解散參戰軍。但段祺瑞又想出了一個名堂，他將參戰軍更名為邊防軍，將督辦參戰公署改為邊防督辦公署，他也搖身一變成了邊防督辦。段祺瑞的這支部隊最後發展到3個師4個混成旅，其心腹徐樹錚以西北籌邊使的名義節制邊防軍。
皖系靈魂人物徐樹錚
直系新首腦曹錕、吳佩孚和奉系張作霖見段祺瑞軍事勢力日益強大，便聯合反對。曹錕、張作霖、吳佩孚等人在北洋系統資歷皆不如段祺瑞，應該算是段的下屬和學生輩，他們不好公開反段，於是便將矛頭指向徐樹錚，以“清君側”的名義向段祺瑞集團發起進攻。
直係軍閥首腦曹錕
1920年7月，直皖之戰爆發。戰爭之初，直系並不佔優勢，但吳佩孚揭露了段祺瑞集團利用日本人貸款打內戰的祕聞，在輿論上佔了先機；隨即吳佩孚突襲邊防軍，活捉皖系前敵司令官曲同豐，使邊防軍士氣受挫；隨即，張作霖奉軍加入反段隊伍，邊防軍在直奉夾擊下，潰不成軍，在廊坊指揮作戰的徐樹錚匆匆退回北京，邊防軍不戰而潰。
至此，直皖之戰勝敗已見分曉。
段祺瑞的失敗，主要在於其雖深謀政治，卻沒有牢牢掌握軍事，最要命的事情，皖系的主張卻是戰鬥到底，窮兵黷武，最後被直系所打敗。
皖系是北洋軍閥中三大派系之一，也是最早主導北洋政權的派系，是以段祺瑞為為安徽人所以簡稱皖系，皖系的主要人物除了段祺瑞外還有徐樹錚、靳雲鵬、段芝貴等人。
皖系之所以能掌權，完全在於皖系的政治手腕能力，早在袁世凱執政晚期，皖系已經有足夠的資本和袁世凱對抗，段祺瑞也是最反對袁世凱稱帝的大佬，所以，袁世凱死後，再加上段祺瑞的個人人品在北洋這麼多年攢了許多政治聲望，所以最後能夠主導北洋政權。
後來由於和黎元洪政治理念不同，段祺瑞要民國加入一戰，黎元洪反對，結果段祺瑞就借張勳復辟之舉（縱橫個人觀點）幹掉黎元洪等反對派，然後再出手幹掉張勳，從而聲望再次上升，並且加入了一戰。
段祺瑞深知，皖系根本沒有能力撐起整個中華民國，因此國內聯合奉系，打壓直系，並且挖直系的牆角，然後進行武力統一南方，而國際上尋求日本的保護，充當日本的代理人，其中段祺瑞的西原借款，堪稱大手筆。
段祺瑞手下徐樹錚也是一號人物，屬於能文能武的，當時組織了安福系甚至操縱了國會，皖系的政治手腕能力很強。
皖係為什麼會敗給直系？一句話的解釋就是，皖系打不過直系唄！而且直系還聯合了奉系！下面，縱橫就來分析分析！
實際證明皖系要求加入一戰完全是對的，中華民國派遣十幾萬勞工最後獲得了一戰戰勝國的身份，戰後很多欠的錢都不用還了，但是在膠州灣的問題上，尤其是在日本的壓力下，給了日本很多好處，這讓段祺瑞的皖系很被動。
在對待南方問題上，皖系始終要求武力統一，西原借款就是為了武力討伐南方革命黨，但是很多將領都是直系的，比如吳佩孚、馮玉祥等人，打著打著就停戰了，在前線上將領就議和了，而且國內反戰情緒高漲，老百姓遊行示威，反對內戰，這樣段祺瑞的政治聲望就跌到了谷底。
善於玩政治的，說到底都是沒有兵，皖系和直系以及奉系，縱橫曾經反覆思考過，實際上皖系的行程是靠個人人格魅力以及政治聲望，但是直系不一樣，直系是屬於袁世凱的家底啊！奉系則屬於割據一方，後孃養的，所以直系才是袁世凱的親兒子。
關鍵是，皖系的內部還不合，皖系能自成一派，其實主要是資源整合，實際上人心不齊，段芝貴號稱民國第一皮條客那完全是不入流的存在，徐樹錚和靳雲鵬兩個人可以說是段祺瑞的左膀右臂了，但是兩個人之間的矛盾比皖系和直系之間的矛盾還深，最後正是由於兩個人之間的矛盾，引發其他派系對皖系的討伐。
直奉聯手聲稱反對徐樹錚對皖系進行進攻，段祺瑞當然和徐樹錚共進退了，結果直皖大戰僅僅打了幾天皖系就崩潰了。
這個問題問的很好，皖繫到底有沒有自己的嫡系部隊呢？在上文已經分析了皖系的存在方式主要是以政治影響力，在武力討伐南方革命軍的時候，皖系是依靠和收買直系的將領，而在打壓直系的過程中，皖系採取的是拉張作霖的奉系入關，利用直奉之間的矛盾做文章。
皖系軍閥巔峰時期控制安徽、山東、上海、浙江、福建、陝西，不可能一點嫡系部隊都沒有，尤其是在討伐張勳和武力討伐南方的過程中，皖系的軍事實力實在是差強人意。
但是皖系並不是沒有著手建立自己的嫡系部隊，當時徐樹錚為了讓張作霖入關，將北洋政府買來的武器讓奉系的楊宇霆到秦皇島去扣押，給奉系四分之三，自己留四分之一，剩的這部分幹什麼了呢？
縱橫認為是用來編練參戰軍了，當時民國已經宣佈參戰了，但是隻派了勞工，沒有派軍隊，於是段祺瑞打著參戰的名義組建參戰軍，共編三個師，然而一戰結束後，再加上反皖勢力的敢於，參戰軍已經不能再繼續發展了，為了保住這支部隊，將其改名為邊防軍，徐樹錚更是將這支部隊調到西北，這支部隊在收復外蒙的過程中起到了一定作用。
然而，這個時候皖系樹敵太多，徐樹錚又是一個惹事的主，最後在直奉大戰中這點嫡系部隊被直系給幹掉了。
