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滇池，也稱昆明湖、昆明池，古稱滇南澤，位於雲南省昆明市西南部，湖泊海拔高度1886米，是雲南省面積最大的高原淡水湖。
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洱海，位於雲南省大理白族自治州大理市西北，因其狀似人耳，故名洱海，是雲南省第二大淡水湖，也是中國第七大淡水湖。
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撫仙湖，位於雲南省玉溪市下屬的江川縣、華寧縣和澄江縣之間。撫仙湖的美主要因為其清澈的湖水，古代著名旅行家徐霞客就曾說“滇山惟多土，故多壅流而成海，而流多渾濁，惟撫仙湖最清。”
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瀘沽湖，亦稱永寧海、左所海、勒得海、落水海子，位於雲南省寧蒗縣與四川省鹽源縣之間，是雲南四川共管的湖泊。沿岸居住著很多少數民族，最著名的就是摩梭人，他們的走婚婚俗在旅遊界有很大的影響。
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杞麓湖，位於雲南省玉溪市通海縣，以位於杞麓山畔而得名，通海人民把杞麓湖稱為“母親湖”。
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星雲湖，古稱星海，唐代稱利水，位於雲南省玉溪市江川縣，因夜間星月皎潔，銀河照映湖心而得名。
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異龍湖，位於雲南省紅河哈尼族彝族自治州石屏縣，是石屏人民的母親湖，以夏季湖內盛開的荷花而聞名。
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陽宗海，古稱明湖，地跨雲南省昆明市呈貢區、宜良縣和澄江縣三個區縣，“陽宗”一名源自大理國時期在此設的強宗部（後訛傳作“陽宗”）。
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納帕海，位於雲南省迪慶藏族自治州香格里拉市，是一座季節性高原湖泊，夏季時積雪融化，形成湖泊，秋冬季節湖泊退化形成依拉草原。
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拉市海，位於雲南省麗江市拉市壩中部，是雲南麗江拉市海高原溼地省級自然保護區的核心部分，是著名的候鳥聚集地，每年冬天約有兩萬多隻候鳥會在此處過冬。
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普者黑湖，位於雲南省文山壯族苗族自治州丘北縣，“普者黑”為彝語，意為魚蝦多的地方。湖畔山水田園風光秀美，是雲南著名的旅遊景點，也是國家4A級旅遊景區。
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茈碧湖，又叫寧湖，位於雲南省大理白族自治州洱源縣，因湖中生長茈碧花而得名，是洱海的源頭之一。
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洱源西湖，也稱大理西湖，位於雲南省大理白族自治州洱源縣右所鎮，湖水水質優良，風景秀麗，明代旅行家徐霞客稱讚其“悠悠有江南風景，而外有四山環翠，覺西子湖又反出其下也”。
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碧塔海，位於雲南省迪慶藏族自治州香格里拉市，湖面海拔3538米，是雲南省海拔最高的湖泊，碧塔海湖水未受到汙染，清澈碧藍，能見度極高，倒映周圍雪山樹影，風景優美，素有“高原明珠”的美譽。
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屬都海，也叫屬都崗湖、屬都錯，位於雲南省迪慶藏族自治州香格里拉市，屬都海四面環山，湖水清澈透亮，湖中盛產“屬都裂腹魚”，是普達措國家公園的重要組成部分。
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長湖，又稱為藏湖，位於雲南省昆明市石林彝族自治縣長湖鎮，是彝族撒尼人的母親湖。
