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因殘塔年久失修，加之鄉民迷信塔磚可辟邪宜男，盜挖者日眾，塔不堪重負，雷峰塔於民國13年（1924年）9月25日下午，轟然倒塌。
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從塔址撿拾的塔磚看，雷峰塔磚系專門燒製，部分塔磚上還刻有捐助建塔者姓氏，另一面為佛像。另有一些塔磚，側面有圓孔，一端封閉，一端塞以木塊，中藏《一切如來心祕密全身舍利寶篋印陀羅尼經》卷。經卷均以長4寸、寬2寸白棉紙木板精印，為我國早期雕版印刷的珍貴實物。
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此後近80年，遺址僅剩殘垣斷瓦，逐漸荒寂。2000年3月，為配合雷峰塔重建，考古人員對遺址進行發掘。清理後的雷峰塔遺址顯露出底層局部的殘垣斷壁和塔基，可以清楚地看到塔山、廊道、倚柱、磚刻文字以及完整的塔基平面佈局。
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塔心正中部下方2.6米處有地宮，地宮口用一方形石板密封，上有巨石鎮壓。地宮為長寬各半米、深約一米的磚砌小室，其中出土了鎏金蓮座青銅蟋龍佛像、銅鏡、玉供養人等精美文物。在地宮正中的鐵函中珍藏著供奉佛螺髫發的鎏金銀舍利塔。
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。其中，鐵質舍利函高度有50釐米，重達100多公斤。神祕鐵函內的鎏金塔是一座精美的四角金塗塔，鎏金銀質，塔高35釐米，底座為方形，邊長為12.6 釐米，塔上有水鏽，在塔的四面飾有佛祖故事題材的淺浮雕。
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通過塔四周的鏤空部分可以看到塔內藏有佛螺髻發的金質容器。塔的下方是一個鎏金的銀盒，盒蓋上飾有繁縟纖細的雙鳳纏牡丹紋樣，四周等距分佈著“千秋萬歲”四個楷字。
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“雷峰塔地宮發掘出來的文物非常豐富，是吳越王國鼎盛國貌的集中體現，對研究當時的工藝成就、佛教文化的影響，有非常重大的價值與意義。”黎毓馨說，它不愧為當年中國的十大考古發現。
